| Database and Motifs | High-scoring Motif Occurences | Debugging Information |
FIMO version 4.9.0, (Release date: 6 EST 20)
For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net
If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble,
"FIMO: Scanning for occurrences of a given motif",
Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011.
DATABASE
/srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssflse7kbdghtv07p1c10u3ravqb49v7np46sqbs1el01a8kf21ha0/uniprobes.descend.fasta
Database contains
41868
sequences,
2512080
residues
MOTIFS /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssflse7kbdghtv07p1c10u3ravqb49v7np46sqbs1el01a8kf21ha0/pwm.fimo (nucleotide)
| MOTIF | WIDTH | BEST POSSIBLE MATCH |
|---|---|---|
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 10 | TTTTATGAGC |
Random model letter frequencies
(from non-redundant database):
A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275
| Motif | Sequence Name | Strand | Start | End | p-value | q-value | Matched Sequence |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 9 | − | 18 | 27 | 2.45e-06 | 1 | TTTTATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 11 | + | 4 | 13 | 2.45e-06 | 1 | TTTTATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 82 | + | 25 | 34 | 2.45e-06 | 1 | TTTTATGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 149 | − | 17 | 26 | 2.45e-06 | 1 | TTTTATGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3 | + | 14 | 23 | 4.47e-06 | 1 | TTTTACGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 10 | − | 13 | 22 | 4.47e-06 | 1 | TTTTACGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 88 | − | 22 | 31 | 4.47e-06 | 1 | TTTTACGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 394 | + | 15 | 24 | 4.47e-06 | 1 | TTTTACGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 45 | − | 4 | 13 | 6.92e-06 | 1 | TTTTATGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 53 | + | 9 | 18 | 6.92e-06 | 1 | TTTTATGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 78 | − | 13 | 22 | 6.92e-06 | 1 | TTTTATGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 152 | − | 10 | 19 | 6.92e-06 | 1 | TTTTATGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2 | − | 11 | 20 | 8.94e-06 | 1 | TTTTACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 12 | + | 21 | 30 | 8.94e-06 | 1 | TTTTACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 472 | − | 12 | 21 | 8.94e-06 | 1 | TTTTACGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 625 | + | 24 | 33 | 8.94e-06 | 1 | TTTTACGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 62 | − | 18 | 27 | 1.1e-05 | 1 | GTTTATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 371 | + | 25 | 34 | 1.1e-05 | 1 | GTTTATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 560 | − | 23 | 32 | 1.1e-05 | 1 | GTTTATGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 678 | + | 14 | 23 | 1.1e-05 | 1 | GTTTATGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 23 | + | 13 | 22 | 1.69e-05 | 1 | TTTTATTGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 24 | − | 4 | 13 | 1.69e-05 | 1 | TTTTATTGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 26 | + | 10 | 19 | 1.69e-05 | 1 | TTTTATGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 33 | − | 6 | 15 | 1.69e-05 | 1 | TTTTATGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 36 | + | 20 | 29 | 1.69e-05 | 1 | TTTTATTAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 56 | − | 12 | 21 | 1.69e-05 | 1 | TTTTATGAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 217 | + | 19 | 28 | 1.69e-05 | 1 | TTTTATGAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 373 | − | 16 | 25 | 1.69e-05 | 1 | TTTTATTAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 39 | + | 23 | 32 | 2.24e-05 | 1 | ATTTATGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 41 | + | 18 | 27 | 2.24e-05 | 1 | TTTTATGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 58 | + | 29 | 38 | 2.24e-05 | 1 | TTTTATGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 79 | − | 13 | 22 | 2.24e-05 | 1 | TTTTATGGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 102 | − | 5 | 14 | 2.24e-05 | 1 | ATTTATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 127 | − | 27 | 36 | 2.24e-05 | 1 | TTTTATGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 167 | + | 27 | 36 | 2.24e-05 | 1 | ATTTATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 169 | + | 23 | 32 | 2.24e-05 | 1 | TTTTATGGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 303 | − | 15 | 24 | 2.24e-05 | 1 | ATTTATGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 358 | + | 2 | 11 | 2.24e-05 | 1 | ATTTATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1101 | − | 2 | 11 | 2.24e-05 | 1 | TTTTATGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 8 | + | 13 | 22 | 2.4e-05 | 1 | GTTTACGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 107 | − | 20 | 29 | 2.4e-05 | 1 | GTTTACGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 276 | + | 8 | 17 | 2.4e-05 | 1 | GTTTACGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1858 | − | 3 | 12 | 2.4e-05 | 1 | GTTTACGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1 | + | 20 | 29 | 3.09e-05 | 1 | TTTTACGAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 6 | − | 16 | 25 | 3.09e-05 | 1 | TTTTACGAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 76 | + | 9 | 18 | 3.09e-05 | 1 | TTTTACTAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 91 | + | 9 | 18 | 3.09e-05 | 1 | TTTTACGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 104 | + | 12 | 21 | 3.09e-05 | 1 | GTTTATGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 151 | − | 18 | 27 | 3.09e-05 | 1 | GTTTATGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 163 | − | 17 | 26 | 3.09e-05 | 1 | GTTTATGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 192 | + | 15 | 24 | 3.09e-05 | 1 | GTTTATGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 205 | − | 25 | 34 | 3.09e-05 | 1 | TTTTACGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 455 | + | 8 | 17 | 3.09e-05 | 1 | TTTTACTGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 626 | − | 27 | 36 | 3.09e-05 | 1 | TTTTACTAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1228 | − | 11 | 20 | 3.09e-05 | 1 | TTTTACTGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3757 | − | 2 | 11 | 3.09e-05 | 1 | TTTTACTAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 5 | + | 7 | 16 | 4.09e-05 | 1 | TTTTATTGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 7 | − | 7 | 16 | 4.09e-05 | 1 | ATTTACGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 28 | − | 21 | 30 | 4.09e-05 | 1 | TTTTACGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 30 | − | 23 | 32 | 4.09e-05 | 1 | TTTTATTAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 31 | − | 27 | 36 | 4.09e-05 | 1 | TTTTATTGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 49 | + | 16 | 25 | 4.09e-05 | 1 | TTTTATGACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 69 | + | 18 | 27 | 4.09e-05 | 1 | TTTTATTAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 209 | + | 5 | 14 | 4.09e-05 | 1 | TTTTACGGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 397 | + | 24 | 33 | 4.09e-05 | 1 | ATTTACGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 545 | + | 24 | 33 | 4.09e-05 | 1 | TTTTACGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 747 | − | 3 | 12 | 4.09e-05 | 1 | TTTTATGACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 953 | − | 7 | 16 | 4.09e-05 | 1 | TTTTATGGCC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1093 | + | 21 | 30 | 4.09e-05 | 1 | TTTTATGGCC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1250 | − | 2 | 11 | 4.09e-05 | 1 | TTTTATTGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1298 | − | 16 | 25 | 4.09e-05 | 1 | ATTTACGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1892 | + | 18 | 27 | 4.09e-05 | 1 | ATTTACGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3194 | − | 11 | 20 | 4.09e-05 | 1 | TTTTACGGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 46 | + | 4 | 13 | 4.33e-05 | 1 | ATTTATGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 84 | − | 6 | 15 | 4.33e-05 | 1 | ATTTATGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 474 | − | 23 | 32 | 4.33e-05 | 1 | ATTTATGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 497 | + | 12 | 21 | 4.33e-05 | 1 | ATTTATGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 21 | − | 5 | 14 | 4.8e-05 | 1 | GTTTACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 71 | + | 23 | 32 | 4.8e-05 | 1 | GTTTACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 72 | − | 8 | 17 | 4.8e-05 | 1 | TTTTATAGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 130 | − | 25 | 34 | 4.8e-05 | 1 | TTTTATAAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 313 | + | 17 | 26 | 4.8e-05 | 1 | TTTTATAGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 408 | + | 14 | 23 | 4.8e-05 | 1 | TTTTATAAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1204 | − | 11 | 20 | 4.8e-05 | 1 | GTTTACGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 4340 | − | 21 | 30 | 4.8e-05 | 1 | GTTTACGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 228 | + | 16 | 25 | 5.44e-05 | 1 | TTTTACTAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 240 | + | 5 | 14 | 5.44e-05 | 1 | CTTTATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 242 | + | 13 | 22 | 5.44e-05 | 1 | TTTTACTAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 244 | + | 22 | 31 | 5.44e-05 | 1 | TTTTACGACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 266 | − | 13 | 22 | 5.44e-05 | 1 | CTTTATGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 393 | − | 25 | 34 | 5.44e-05 | 1 | TTTTACGACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 431 | + | 13 | 22 | 5.44e-05 | 1 | TTTTACGGCC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 712 | + | 19 | 28 | 5.44e-05 | 1 | TTTTACTGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1001 | − | 9 | 18 | 5.44e-05 | 1 | CTTTATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1169 | − | 6 | 15 | 5.44e-05 | 1 | TTTTACGGCC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1421 | − | 5 | 14 | 5.44e-05 | 1 | TTTTACTGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2860 | + | 20 | 29 | 5.44e-05 | 1 | CTTTATGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 17 | + | 12 | 21 | 5.89e-05 | 1 | ATTTACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 25 | − | 22 | 31 | 5.89e-05 | 1 | ATTTACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 243 | + | 26 | 35 | 5.89e-05 | 1 | TTTTATGACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 334 | − | 20 | 29 | 5.89e-05 | 1 | TTTTATGGCG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 639 | − | 3 | 12 | 5.89e-05 | 1 | TTTTATGACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 676 | − | 10 | 19 | 5.89e-05 | 1 | ATTTACGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 755 | + | 28 | 37 | 5.89e-05 | 1 | TTTTATGGCG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1673 | + | 3 | 12 | 5.89e-05 | 1 | TTTTATGGCG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1789 | + | 2 | 11 | 5.89e-05 | 1 | ATTTACGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2221 | + | 27 | 36 | 5.89e-05 | 1 | ATTTACGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 6868 | + | 1 | 10 | 5.89e-05 | 1 | TTTTATGACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 105 | + | 8 | 17 | 6.14e-05 | 1 | TTTTACAGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 145 | + | 17 | 26 | 6.14e-05 | 1 | TTTTACAAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 236 | − | 26 | 35 | 6.14e-05 | 1 | TTTTACAAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 438 | − | 21 | 30 | 6.14e-05 | 1 | TTTTACAGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 19910 | − | 1 | 10 | 6.14e-05 | 1 | TTTTACAAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 19 | + | 6 | 15 | 6.6e-05 | 1 | TTTTATAGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 81 | − | 12 | 21 | 6.6e-05 | 1 | CTTTACGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 146 | − | 10 | 19 | 6.6e-05 | 1 | TTTTATAAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 213 | + | 18 | 27 | 6.6e-05 | 1 | CTTTACGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 287 | + | 16 | 25 | 6.6e-05 | 1 | TTTTATAAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 307 | − | 4 | 13 | 6.6e-05 | 1 | TTTTATAGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 855 | + | 5 | 14 | 6.6e-05 | 1 | CTTTACGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1394 | − | 28 | 37 | 6.6e-05 | 1 | CTTTACGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2912 | − | 26 | 35 | 6.6e-05 | 1 | CTTTACGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 13878 | − | 1 | 10 | 6.6e-05 | 1 | CTTTACGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 29 | + | 7 | 16 | 7.74e-05 | 1 | GTTTATGAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 34 | + | 8 | 17 | 7.74e-05 | 1 | GTTTATTGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 75 | + | 6 | 15 | 7.74e-05 | 1 | CTTTATGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 100 | + | 7 | 16 | 7.74e-05 | 1 | TTTTACGACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 116 | + | 7 | 16 | 7.74e-05 | 1 | GTTTATTAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 148 | + | 28 | 37 | 7.74e-05 | 1 | TTTTACGACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 154 | + | 5 | 14 | 7.74e-05 | 1 | GTTTATGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 170 | − | 9 | 18 | 7.74e-05 | 1 | TTTAATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 215 | − | 7 | 16 | 7.74e-05 | 1 | GTTTATTGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 254 | − | 4 | 13 | 7.74e-05 | 1 | GTTTATGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 298 | − | 10 | 19 | 7.74e-05 | 1 | GTTTATTAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 323 | + | 21 | 30 | 7.74e-05 | 1 | TTTAATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 351 | − | 11 | 20 | 7.74e-05 | 1 | CTTTATGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 449 | − | 20 | 29 | 7.74e-05 | 1 | TTTTACGACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 513 | + | 7 | 16 | 7.74e-05 | 1 | CTTTATGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 580 | − | 11 | 20 | 7.74e-05 | 1 | GTTTATGAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1054 | − | 26 | 35 | 7.74e-05 | 1 | CTTTATGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1150 | + | 15 | 24 | 7.74e-05 | 1 | TTTAATGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1529 | + | 23 | 32 | 7.74e-05 | 1 | TTTTACGGCG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1695 | − | 8 | 17 | 7.74e-05 | 1 | TTTTACGGCG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2712 | + | 22 | 31 | 7.74e-05 | 1 | TTTAATGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 20475 | − | 1 | 10 | 7.74e-05 | 1 | CTTTATGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 38 | + | 15 | 24 | 8.35e-05 | 1 | TTTTATTAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 73 | + | 4 | 13 | 8.35e-05 | 1 | TTTTATTGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 121 | − | 6 | 15 | 8.35e-05 | 1 | TTTTATTAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 179 | + | 4 | 13 | 8.35e-05 | 1 | GTTTATGGGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 13 | − | 6 | 15 | 9.56e-05 | 1 | TTTTACAAGG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 22 | + | 29 | 38 | 9.56e-05 | 1 | TTTTATTGGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 60 | + | 29 | 38 | 9.56e-05 | 1 | TTTTATTGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 118 | − | 19 | 28 | 9.56e-05 | 1 | TTTTATTAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 165 | − | 9 | 18 | 9.56e-05 | 1 | TTTTATTGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 202 | − | 7 | 16 | 9.56e-05 | 1 | ATTTATGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 208 | − | 3 | 12 | 9.56e-05 | 1 | ATTTATGAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 233 | − | 8 | 17 | 9.56e-05 | 1 | ATTTATGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 274 | − | 16 | 25 | 9.56e-05 | 1 | TTTTACAGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 284 | + | 28 | 37 | 9.56e-05 | 1 | TTTTACAAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 286 | + | 20 | 29 | 9.56e-05 | 1 | TTTTATTAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 389 | − | 25 | 34 | 9.56e-05 | 1 | ATTTATTGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 462 | + | 26 | 35 | 9.56e-05 | 1 | ATTTATTGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 562 | + | 10 | 19 | 9.56e-05 | 1 | ATTTATGAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 655 | − | 4 | 13 | 9.56e-05 | 1 | ATTTATTAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1463 | + | 25 | 34 | 9.56e-05 | 1 | TTTTACAGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2490 | + | 1 | 10 | 9.56e-05 | 1 | ATTTATTGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 14 | + | 6 | 15 | 0.000106 | 1 | TTTAACGAGC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 68 | − | 14 | 23 | 0.000106 | 1 | GTTTACGAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 119 | + | 17 | 26 | 0.000106 | 1 | GTTTACGAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 201 | − | 26 | 35 | 0.000106 | 1 | CTTTACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 207 | + | 21 | 30 | 0.000106 | 1 | ATTTATGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 216 | + | 18 | 27 | 0.000106 | 1 | CTTTACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 264 | − | 18 | 27 | 0.000106 | 1 | TTTAACGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 271 | − | 20 | 29 | 0.000106 | 1 | ATTTATGGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 272 | + | 29 | 38 | 0.000106 | 1 | ATTTATGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 337 | + | 12 | 21 | 0.000106 | 1 | GTTTACTAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 361 | + | 29 | 38 | 0.000106 | 1 | ATTTATGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 495 | + | 27 | 36 | 0.000106 | 1 | ATTTATGGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 548 | + | 29 | 38 | 0.000106 | 1 | ATTTATGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 821 | − | 16 | 25 | 0.000106 | 1 | GTTTACTAGC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 80 | + | 27 | 36 | 0.000118 | 1 | GTTTACGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 111 | + | 4 | 13 | 0.000118 | 1 | TTTTACTAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 136 | − | 26 | 35 | 0.000118 | 1 | GTTTACGAGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 391 | − | 27 | 36 | 0.000118 | 1 | TTTAATGAGG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 923 | − | 18 | 27 | 0.000118 | 1 | GTTTATGGCC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 958 | − | 23 | 32 | 0.000118 | 1 | TTTAATGGGG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 269 | − | 5 | 14 | 0.000132 | 1 | TTTTATGACA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 335 | − | 18 | 27 | 0.000132 | 1 | TTTTATTACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 363 | − | 10 | 19 | 0.000132 | 1 | TTTTATGGCA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 830 | − | 20 | 29 | 0.000132 | 1 | ATTTACGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 886 | + | 23 | 32 | 0.000132 | 1 | TTTTATGGCA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1257 | + | 11 | 20 | 0.000132 | 1 | ATTTACGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1423 | + | 14 | 23 | 0.000132 | 1 | ATTTACTGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1569 | − | 26 | 35 | 0.000132 | 1 | TTTTACTGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1677 | + | 26 | 35 | 0.000132 | 1 | ATTTACTAGC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 123 | − | 17 | 26 | 0.000148 | 1 | ATTTACGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 126 | + | 8 | 17 | 0.000148 | 1 | TTTTATGGTC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 134 | + | 6 | 15 | 0.000148 | 1 | ATTTACGAGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 256 | − | 6 | 15 | 0.000148 | 1 | ATTTATGACC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 317 | + | 27 | 36 | 0.000148 | 1 | TTTTATGACT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 336 | − | 17 | 26 | 0.000148 | 1 | ATTTATTGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 346 | + | 9 | 18 | 0.000148 | 1 | ATTTATGGCC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 409 | + | 19 | 28 | 0.000148 | 1 | ATTTATTAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 420 | − | 16 | 25 | 0.000148 | 1 | ATTTATGGCC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 454 | + | 17 | 26 | 0.000148 | 1 | ATTTATGACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 486 | − | 15 | 24 | 0.000148 | 1 | TTTTATGGTC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 501 | + | 30 | 39 | 0.000148 | 1 | TTTTATGGTC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 737 | + | 26 | 35 | 0.000148 | 1 | GTTTATAAGC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 840 | − | 20 | 29 | 0.000148 | 1 | GTTTATAAGC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1546 | + | 30 | 39 | 0.000148 | 1 | TTTTATGGTC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1708 | + | 19 | 28 | 0.000148 | 1 | ATTTACGGGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 570 | + | 12 | 21 | 0.000158 | 1 | TTTTATAGGA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3548 | + | 16 | 25 | 0.000204 | 1 | TTTTACAGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3860 | + | 26 | 35 | 0.000204 | 1 | ATTTATGGCG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3961 | + | 1 | 10 | 0.000204 | 1 | ATTTATGGCG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 885 | + | 23 | 32 | 0.00022 | 1 | TTTTACAGGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3578 | − | 3 | 12 | 0.00022 | 1 | TTTTACAGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3765 | + | 22 | 31 | 0.00022 | 1 | GTTAATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 4169 | − | 14 | 23 | 0.00022 | 1 | CTTTACTGGC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 6802 | − | 11 | 20 | 0.00022 | 1 | GTTTACGGCG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1496 | − | 8 | 17 | 0.000257 | 1 | TTTTACGGTG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2535 | + | 25 | 34 | 0.000257 | 1 | ATTAATGGGC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 16058 | + | 25 | 34 | 0.000257 | 1 | ATTTACGGCG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1014 | − | 6 | 15 | 0.000291 | 1 | CTTTACGACC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1256 | − | 25 | 34 | 0.000291 | 1 | ATTTACAGGG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1314 | − | 11 | 20 | 0.000291 | 1 | TTTAACGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1327 | + | 16 | 25 | 0.000291 | 1 | GTTAATGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1459 | − | 3 | 12 | 0.000291 | 1 | ATTTATTAGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1491 | + | 22 | 31 | 0.000291 | 1 | GTTTACTAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1746 | + | 3 | 12 | 0.000291 | 1 | CTTTACGACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2107 | − | 4 | 13 | 0.000291 | 1 | GTTTACTGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2604 | − | 4 | 13 | 0.000291 | 1 | TTTTATAACG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 4187 | − | 19 | 28 | 0.000291 | 1 | ATTTACAGGG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 5455 | + | 25 | 34 | 0.000291 | 1 | TTTTATAACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 5647 | + | 22 | 31 | 0.000291 | 1 | TTTAACGGGA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 8311 | − | 21 | 30 | 0.000291 | 1 | CTTTACTGGG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 11261 | + | 26 | 35 | 0.000291 | 1 | CTTTACTGGG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 196 | − | 22 | 31 | 0.000314 | 1 | TTTAATGACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 212 | + | 8 | 17 | 0.000314 | 1 | TTTAATTAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 246 | − | 5 | 14 | 0.000314 | 1 | TTTTATGGAC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 250 | + | 3 | 12 | 0.000314 | 1 | GTTTATTACC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 405 | − | 11 | 20 | 0.000314 | 1 | TTTAATTGGG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 715 | + | 22 | 31 | 0.000314 | 1 | ATTAACGAGC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1011 | + | 13 | 22 | 0.000314 | 1 | GTTTACTAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1076 | − | 20 | 29 | 0.000314 | 1 | TTTTATGAAC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1103 | − | 20 | 29 | 0.000314 | 1 | TTTAATGGCC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1230 | + | 8 | 17 | 0.000314 | 1 | TTTTATGAAC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1347 | − | 5 | 14 | 0.000314 | 1 | GTTTATGACA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1422 | − | 18 | 27 | 0.000314 | 1 | GTTTATGGCA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1838 | + | 19 | 28 | 0.000314 | 1 | GTTTATGACA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1967 | − | 9 | 18 | 0.000314 | 1 | GTTTACTAGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 66 | − | 9 | 18 | 0.00033 | 1 | TTTTATTGCA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 155 | + | 27 | 36 | 0.00033 | 1 | ATTAATGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 231 | − | 9 | 18 | 0.00033 | 1 | ATTAATGAGG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 537 | − | 18 | 27 | 0.000363 | 1 | TTTTATTATC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 680 | − | 26 | 35 | 0.000363 | 1 | GTTAACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 698 | − | 19 | 28 | 0.000363 | 1 | CTTTATAAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 788 | + | 11 | 20 | 0.000363 | 1 | GTTAACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 866 | − | 22 | 31 | 0.000363 | 1 | ATTTATGACA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 957 | + | 24 | 33 | 0.000363 | 1 | ATTTATGACA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1003 | + | 30 | 39 | 0.000363 | 1 | TTTTATTGTC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1008 | + | 25 | 34 | 0.000363 | 1 | TTTAATAAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1084 | − | 20 | 29 | 0.000363 | 1 | GTTTATAGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1151 | + | 15 | 24 | 0.000363 | 1 | ATTTACTGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1156 | − | 9 | 18 | 0.000363 | 1 | ATTTACTAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1195 | + | 3 | 12 | 0.000363 | 1 | ATTTACTAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1244 | + | 19 | 28 | 0.000363 | 1 | TTTTATGATA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1271 | + | 8 | 17 | 0.000363 | 1 | TTTTACAGCG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1343 | − | 18 | 27 | 0.000363 | 1 | TTTTATTGTC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1383 | + | 26 | 35 | 0.000363 | 1 | TTTTATGGTA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1414 | − | 17 | 26 | 0.000363 | 1 | TTTTATGATA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1500 | + | 5 | 14 | 0.000363 | 1 | GTTTATAAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1657 | − | 6 | 15 | 0.000363 | 1 | TTTTACAGCG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1852 | − | 21 | 30 | 0.000363 | 1 | TTTTACAACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2070 | − | 6 | 15 | 0.000363 | 1 | ATTTATGGCA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2112 | + | 11 | 20 | 0.000363 | 1 | ATTTATGGCA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2147 | − | 13 | 22 | 0.000363 | 1 | GTTAACGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2990 | + | 12 | 21 | 0.000363 | 1 | GTTTATAAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3739 | − | 1 | 10 | 0.000363 | 1 | GTTAACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3799 | + | 17 | 26 | 0.000363 | 1 | CTTTATAAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 4037 | + | 22 | 31 | 0.000363 | 1 | TTTTACAACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 5991 | + | 27 | 36 | 0.000363 | 1 | GTTAACGGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 7018 | − | 25 | 34 | 0.000363 | 1 | ATTTACTGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 9030 | + | 1 | 10 | 0.000363 | 1 | TTTTATGGTA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 26895 | + | 2 | 11 | 0.000363 | 1 | GTTAACGGGG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 177 | − | 6 | 15 | 0.000391 | 1 | GTTTACGACA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 185 | − | 3 | 12 | 0.000391 | 1 | GTTTATAGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 200 | − | 5 | 14 | 0.000391 | 1 | ATTTATGACT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 296 | + | 8 | 17 | 0.000391 | 1 | GTTTACGACA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 310 | + | 6 | 15 | 0.000391 | 1 | TTTTATGGTT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 395 | − | 23 | 32 | 0.000391 | 1 | TTTTATGATT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 498 | + | 8 | 17 | 0.000391 | 1 | TTTTACGAAC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 521 | + | 15 | 24 | 0.000391 | 1 | TTTTATGATT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 620 | − | 10 | 19 | 0.000391 | 1 | TTTTACGTGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 701 | + | 7 | 16 | 0.000391 | 1 | ATTTATGACT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 722 | − | 8 | 17 | 0.000391 | 1 | TTTTATGGTT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 731 | − | 7 | 16 | 0.000391 | 1 | CTTAATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 775 | + | 17 | 26 | 0.000391 | 1 | TTTAACGACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 910 | + | 11 | 20 | 0.000391 | 1 | GTTTACTACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 913 | − | 9 | 18 | 0.000391 | 1 | CTTTACGACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 967 | − | 17 | 26 | 0.000391 | 1 | ATTTATGGCT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1216 | + | 29 | 38 | 0.000391 | 1 | GTTTATAAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1242 | + | 3 | 12 | 0.000391 | 1 | GTTTACTGCC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1263 | − | 16 | 25 | 0.000391 | 1 | ATTTATGATC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1285 | + | 19 | 28 | 0.000391 | 1 | GTTTATAAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1365 | + | 26 | 35 | 0.000391 | 1 | ATTTATGGTC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1490 | + | 28 | 37 | 0.000391 | 1 | CTTTACGACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1613 | − | 21 | 30 | 0.000391 | 1 | TTTTACGGAC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1826 | − | 13 | 22 | 0.000391 | 1 | GTTTATAGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1871 | − | 11 | 20 | 0.000391 | 1 | GTTTACTACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1876 | + | 17 | 26 | 0.000391 | 1 | TTTAACTGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1883 | − | 18 | 27 | 0.000391 | 1 | TTTTACGAAC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2110 | − | 4 | 13 | 0.000391 | 1 | GTTTATAAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2222 | + | 30 | 39 | 0.000391 | 1 | ATTTATGGTC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2292 | + | 10 | 19 | 0.000391 | 1 | TTTAACTAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2566 | − | 14 | 23 | 0.000391 | 1 | CTTAATGGGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2617 | + | 29 | 38 | 0.000391 | 1 | GTTTATAAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2727 | + | 30 | 39 | 0.000391 | 1 | ATTTATGGTC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3055 | + | 14 | 23 | 0.000391 | 1 | TTTTACGGAC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3394 | − | 15 | 24 | 0.000391 | 1 | TTTAACTAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3707 | − | 25 | 34 | 0.000391 | 1 | ATTTATGGTC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3820 | − | 20 | 29 | 0.000391 | 1 | TTTAACTGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3890 | − | 28 | 37 | 0.000391 | 1 | CTTAATGAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 4762 | + | 23 | 32 | 0.000391 | 1 | CTTAATGGGC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 5201 | − | 15 | 24 | 0.000391 | 1 | GTTTACTGCC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 5852 | − | 23 | 32 | 0.000391 | 1 | CTTTACGGCG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 13431 | + | 20 | 29 | 0.000391 | 1 | GTTTACGGCA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 133 | + | 9 | 18 | 0.000416 | 1 | ATTAACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 193 | − | 6 | 15 | 0.000416 | 1 | ATTAACGAGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 197 | + | 7 | 16 | 0.000416 | 1 | GTTTACGACT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 234 | − | 5 | 14 | 0.000416 | 1 | TTTTATGGAG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 292 | + | 12 | 21 | 0.000416 | 1 | TTTTACTGCA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 305 | − | 18 | 27 | 0.000416 | 1 | GTTTATTGCG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 321 | − | 26 | 35 | 0.000416 | 1 | ATTTATAAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 325 | + | 28 | 37 | 0.000416 | 1 | TTTTATGGAG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 414 | − | 22 | 31 | 0.000416 | 1 | TTTTACTACA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 416 | − | 28 | 37 | 0.000416 | 1 | CTTTATTGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 425 | − | 11 | 20 | 0.000416 | 1 | TTTTATGAAG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 429 | − | 28 | 37 | 0.000416 | 1 | CTTTATTGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 430 | + | 11 | 20 | 0.000416 | 1 | TTTTACTACA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 467 | − | 6 | 15 | 0.000416 | 1 | GTTTATTACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 483 | − | 5 | 14 | 0.000416 | 1 | GTTTACGATC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 623 | + | 26 | 35 | 0.000416 | 1 | ATTTATAGGA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1009 | − | 25 | 34 | 0.000446 | 1 | GTTTACAGGA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1036 | + | 21 | 30 | 0.000446 | 1 | GTTTACAAGA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1128 | + | 27 | 36 | 0.000446 | 1 | GTTTATGGTG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1241 | − | 7 | 16 | 0.000446 | 1 | ATTTACGGCA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1354 | − | 21 | 30 | 0.000446 | 1 | TTTTACTGCT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1393 | + | 5 | 14 | 0.000446 | 1 | TTTTACTGCT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1474 | − | 3 | 12 | 0.000446 | 1 | TTTTACGATA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2370 | − | 4 | 13 | 0.000446 | 1 | TTTTACTACT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 579 | + | 22 | 31 | 0.00047 | 1 | TTTAATAGGG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 599 | + | 4 | 13 | 0.00047 | 1 | GTTTATAACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 605 | + | 18 | 27 | 0.00047 | 1 | ATTTACGATC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 771 | − | 7 | 16 | 0.00047 | 1 | TTTTACGATT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 4380 | + | 24 | 33 | 0.000497 | 1 | GTTAATTAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 4435 | + | 11 | 20 | 0.000497 | 1 | GTTAATGGGA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 10459 | − | 6 | 15 | 0.000497 | 1 | TTTTACGGAG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 13490 | − | 1 | 10 | 0.000497 | 1 | TTTTATAACA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 129 | + | 9 | 18 | 0.00053 | 1 | TTTTATTTGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 162 | + | 5 | 14 | 0.00053 | 1 | TTTTATGTGA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 239 | + | 21 | 30 | 0.00053 | 1 | TTTAATTGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 249 | − | 4 | 13 | 0.00053 | 1 | TTTAATTAGA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 280 | − | 24 | 33 | 0.00053 | 1 | TTTAATTGGA |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1976 | − | 19 | 28 | 0.00053 | 1 | CTTTATTGCC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2081 | − | 13 | 22 | 0.00053 | 1 | CTTTACTAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2096 | + | 2 | 11 | 0.00053 | 1 | CTTTATGGCA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2101 | − | 17 | 26 | 0.00053 | 1 | TTTTATAACT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2116 | + | 29 | 38 | 0.00053 | 1 | CTTTACTAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2149 | + | 16 | 25 | 0.00053 | 1 | ATTTATAACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2233 | − | 17 | 26 | 0.00053 | 1 | ATTTACAGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2298 | + | 26 | 35 | 0.00053 | 1 | CTTTACTAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2422 | + | 29 | 38 | 0.00053 | 1 | GTTAATGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2756 | + | 29 | 38 | 0.00053 | 1 | GTTAATGAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3378 | − | 13 | 22 | 0.00053 | 1 | CTTTACTGGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3742 | − | 17 | 26 | 0.00053 | 1 | TTTTATAATC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 3859 | + | 7 | 16 | 0.00053 | 1 | GTTAATGGGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 5911 | − | 14 | 23 | 0.00053 | 1 | GTTTACGGTG |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 13360 | + | 29 | 38 | 0.00053 | 1 | CTTTACTGGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 275 | − | 7 | 16 | 0.000558 | 1 | TTTAATTGGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 345 | + | 5 | 14 | 0.000558 | 1 | CTTTATGACT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 383 | − | 26 | 35 | 0.000558 | 1 | ATTTATGTGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 401 | + | 29 | 38 | 0.000558 | 1 | TTTAATTGGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 779 | − | 16 | 25 | 0.000558 | 1 | TTTAATTAGT |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 905 | − | 3 | 12 | 0.000558 | 1 | ATTAATTGGC |
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| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1095 | + | 22 | 31 | 0.000558 | 1 | ATTAATGAGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1188 | + | 5 | 14 | 0.000558 | 1 | TTTTACTATG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1212 | + | 7 | 16 | 0.000558 | 1 | TTTTACTGTG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1218 | − | 7 | 16 | 0.000558 | 1 | CTTTATGGCT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1375 | + | 3 | 12 | 0.000558 | 1 | GTTTACAACC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1501 | − | 14 | 23 | 0.000558 | 1 | CTTTATGGTC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1516 | − | 4 | 13 | 0.000558 | 1 | ATTTACTACG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1536 | + | 29 | 38 | 0.000558 | 1 | TTTAATTAGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1612 | + | 18 | 27 | 0.000558 | 1 | CTTTATGATC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1833 | − | 26 | 35 | 0.000558 | 1 | TTTTACTATG |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1953 | + | 25 | 34 | 0.000558 | 1 | TTTTATGTGT |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 1983 | − | 12 | 21 | 0.000558 | 1 | ATTAATGGGA |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2001 | − | 6 | 15 | 0.000558 | 1 | ATTAATTAGC |
| Hoxa13_3126.1.bml.pwm | 2076 | − | 21 | 30 | 0.000558 | 1 | TTTAACAGGG |
Command line:
/home/yang23/programs/meme_4.9.0/bin/fimo -oc /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssflse7kbdghtv07p1c10u3ravqb49v7np46sqbs1el01a8kf21ha0/descend -thresh 0.001 /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssflse7kbdghtv07p1c10u3ravqb49v7np46sqbs1el01a8kf21ha0/pwm.fimo /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssflse7kbdghtv07p1c10u3ravqb49v7np46sqbs1el01a8kf21ha0/uniprobes.descend.fasta
Settings:
| output directory = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssflse7kbdghtv07p1c10u3ravqb49v7np46sqbs1el01a8kf21ha0/descend | MEME file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssflse7kbdghtv07p1c10u3ravqb49v7np46sqbs1el01a8kf21ha0/pwm.fimo | sequence file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssflse7kbdghtv07p1c10u3ravqb49v7np46sqbs1el01a8kf21ha0/uniprobes.descend.fasta |
| allow clobber = true | compute q-values = true | text only = false |
| scan both strands = true | max sequence length = 250000000 | output threshold = 0.001 |
| threshold type = p-value | max stored scores = 100000 | pseudocount = 0.1 |
| verbosity = 2 |
This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.