| Database and Motifs | High-scoring Motif Occurences | Debugging Information |
FIMO version 4.9.0, (Release date: 6 EST 20)
For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net
If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble,
"FIMO: Scanning for occurrences of a given motif",
Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011.
DATABASE
/srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssnp8b2tobrdi8kv1c109j7m8mm77l821g9qjdvk5khil9hc1kmnf1/uniprobes.shuffled.fasta
Database contains
41595
sequences,
2495700
residues
MOTIFS /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssnp8b2tobrdi8kv1c109j7m8mm77l821g9qjdvk5khil9hc1kmnf1/pwm.fimo (nucleotide)
| MOTIF | WIDTH | BEST POSSIBLE MATCH |
|---|---|---|
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10 | GCTAATTACT |
Random model letter frequencies
(from non-redundant database):
A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275
| Motif | Sequence Name | Strand | Start | End | p-value | q-value | Matched Sequence |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 34344 | − | 1 | 10 | 9.09e-07 | 1 | GCTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35473 | − | 26 | 35 | 9.09e-07 | 1 | GCTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 36594 | − | 5 | 14 | 9.09e-07 | 1 | GCTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 7457 | − | 15 | 24 | 2.02e-06 | 1 | GCTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13731 | + | 19 | 28 | 2.02e-06 | 1 | GCTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6534 | + | 22 | 31 | 3.12e-06 | 1 | GCTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 32636 | − | 17 | 26 | 3.12e-06 | 1 | GCTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15800 | − | 22 | 31 | 7.39e-06 | 1 | GTTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19592 | − | 24 | 33 | 7.39e-06 | 1 | GCTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 20992 | − | 22 | 31 | 7.39e-06 | 1 | GCTAATGACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 22112 | + | 12 | 21 | 7.39e-06 | 1 | GCTAATGACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23448 | + | 7 | 16 | 7.39e-06 | 1 | GTTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23608 | + | 19 | 28 | 7.39e-06 | 1 | CCTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30703 | − | 26 | 35 | 7.39e-06 | 1 | CCTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35376 | − | 1 | 10 | 7.39e-06 | 1 | CCTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 36907 | + | 13 | 22 | 7.39e-06 | 1 | GCTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3615 | − | 19 | 28 | 1.19e-05 | 1 | GCTAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 5873 | − | 28 | 37 | 1.19e-05 | 1 | CCTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6305 | − | 23 | 32 | 1.19e-05 | 1 | GCTAATTACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 8496 | + | 26 | 35 | 1.19e-05 | 1 | GCTAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 18134 | − | 3 | 12 | 1.19e-05 | 1 | CCTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 18468 | − | 7 | 16 | 1.19e-05 | 1 | GTTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 20501 | + | 1 | 10 | 1.19e-05 | 1 | GCTAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 20650 | + | 6 | 15 | 1.19e-05 | 1 | GCTAATTACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27170 | + | 4 | 13 | 1.19e-05 | 1 | GTTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35695 | + | 24 | 33 | 1.19e-05 | 1 | CCTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1786 | + | 18 | 27 | 1.41e-05 | 1 | GCTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1786 | − | 18 | 27 | 1.41e-05 | 1 | GCTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 18401 | + | 19 | 28 | 1.41e-05 | 1 | GCTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27302 | − | 18 | 27 | 1.41e-05 | 1 | GCTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3959 | − | 15 | 24 | 1.79e-05 | 1 | GTTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16746 | + | 4 | 13 | 1.79e-05 | 1 | GTTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 20683 | + | 9 | 18 | 1.79e-05 | 1 | CCTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 26392 | + | 2 | 11 | 1.79e-05 | 1 | GCTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30968 | − | 23 | 32 | 1.79e-05 | 1 | CCTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35454 | + | 27 | 36 | 1.79e-05 | 1 | GCTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40347 | − | 14 | 23 | 1.79e-05 | 1 | GCTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3579 | + | 13 | 22 | 2.51e-05 | 1 | CCTAATGACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 5705 | − | 8 | 17 | 2.51e-05 | 1 | CCTAATGACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9481 | − | 4 | 13 | 2.51e-05 | 1 | GTTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 11500 | + | 5 | 14 | 2.51e-05 | 1 | CTTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 14073 | − | 16 | 25 | 2.51e-05 | 1 | CTTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15108 | + | 11 | 20 | 2.51e-05 | 1 | CCTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16992 | + | 13 | 22 | 2.51e-05 | 1 | GTTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19465 | − | 10 | 19 | 2.51e-05 | 1 | GCTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19615 | − | 9 | 18 | 2.51e-05 | 1 | CCTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 28930 | − | 4 | 13 | 2.51e-05 | 1 | GCTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30025 | + | 8 | 17 | 2.51e-05 | 1 | GTTAATGACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 33792 | − | 12 | 21 | 2.51e-05 | 1 | GTTAATGACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 472 | + | 25 | 34 | 3.59e-05 | 1 | ACTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 594 | − | 21 | 30 | 3.59e-05 | 1 | GCTAATGGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2041 | + | 24 | 33 | 3.59e-05 | 1 | GGTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2745 | − | 9 | 18 | 3.59e-05 | 1 | CTTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2990 | − | 3 | 12 | 3.59e-05 | 1 | GTTAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3169 | + | 11 | 20 | 3.59e-05 | 1 | CTTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3913 | + | 26 | 35 | 3.59e-05 | 1 | CCTAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 4545 | − | 24 | 33 | 3.59e-05 | 1 | GTTAATTACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9696 | − | 7 | 16 | 3.59e-05 | 1 | GCTAATGAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12767 | + | 24 | 33 | 3.59e-05 | 1 | GCTAATTAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16581 | + | 25 | 34 | 3.59e-05 | 1 | GCTAATGGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16905 | − | 17 | 26 | 3.59e-05 | 1 | CCTAATTACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 17679 | + | 29 | 38 | 3.59e-05 | 1 | GCTAATTAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19649 | + | 16 | 25 | 3.59e-05 | 1 | CCTAATTACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23821 | + | 24 | 33 | 3.59e-05 | 1 | GCTAATGAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 24353 | − | 27 | 36 | 3.59e-05 | 1 | CCTAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 26332 | − | 10 | 19 | 3.59e-05 | 1 | ACTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 26891 | + | 22 | 31 | 3.59e-05 | 1 | GTTAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27167 | − | 12 | 21 | 3.59e-05 | 1 | GCTAATTAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 34745 | + | 21 | 30 | 3.59e-05 | 1 | GTTAATTACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 38593 | − | 11 | 20 | 3.59e-05 | 1 | GGTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 38829 | + | 13 | 22 | 3.59e-05 | 1 | CCTAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3997 | − | 24 | 33 | 4.64e-05 | 1 | ACTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6332 | + | 12 | 21 | 4.64e-05 | 1 | GTTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9941 | − | 5 | 14 | 4.64e-05 | 1 | GCTAATTGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10408 | + | 15 | 24 | 4.64e-05 | 1 | GCTAATTGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 11744 | + | 22 | 31 | 4.64e-05 | 1 | ACTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12690 | − | 5 | 14 | 4.64e-05 | 1 | GTTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 17359 | − | 6 | 15 | 4.64e-05 | 1 | GTTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 18560 | − | 6 | 15 | 4.64e-05 | 1 | GATAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19033 | + | 24 | 33 | 4.64e-05 | 1 | GTTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 22120 | + | 23 | 32 | 4.64e-05 | 1 | CCTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 22120 | − | 23 | 32 | 4.64e-05 | 1 | GCTAATTAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29882 | + | 8 | 17 | 4.64e-05 | 1 | CCTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29882 | − | 8 | 17 | 4.64e-05 | 1 | GCTAATTAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 31167 | + | 14 | 23 | 4.64e-05 | 1 | GGTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 31167 | − | 14 | 23 | 4.64e-05 | 1 | GGTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 34133 | + | 2 | 11 | 4.64e-05 | 1 | GATAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35659 | − | 13 | 22 | 4.64e-05 | 1 | CCTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 36106 | + | 25 | 34 | 4.64e-05 | 1 | CCTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1768 | + | 25 | 34 | 5.43e-05 | 1 | CCTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2584 | − | 14 | 23 | 5.43e-05 | 1 | GCTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 4258 | + | 10 | 19 | 5.43e-05 | 1 | GTTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9324 | − | 16 | 25 | 5.43e-05 | 1 | GTTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10238 | + | 17 | 26 | 5.43e-05 | 1 | CTTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 18268 | + | 19 | 28 | 5.43e-05 | 1 | GCTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19406 | + | 2 | 11 | 5.43e-05 | 1 | GCTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 20349 | + | 27 | 36 | 5.43e-05 | 1 | GCTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 24780 | − | 22 | 31 | 5.43e-05 | 1 | CTTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 28737 | − | 14 | 23 | 5.43e-05 | 1 | GCTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 32270 | − | 11 | 20 | 5.43e-05 | 1 | GATAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 37078 | − | 25 | 34 | 5.43e-05 | 1 | CCTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 37732 | − | 13 | 22 | 5.43e-05 | 1 | GATAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1222 | − | 8 | 17 | 6.56e-05 | 1 | GCTAATTATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1983 | + | 15 | 24 | 6.56e-05 | 1 | GCTAATGGCT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3408 | + | 18 | 27 | 6.56e-05 | 1 | GTTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6094 | − | 12 | 21 | 6.56e-05 | 1 | ACTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6706 | − | 10 | 19 | 6.56e-05 | 1 | GCTAATTAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10805 | + | 4 | 13 | 6.56e-05 | 1 | GGTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 11410 | + | 29 | 38 | 6.56e-05 | 1 | CCTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12317 | − | 27 | 36 | 6.56e-05 | 1 | CTTAATGACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12798 | + | 29 | 38 | 6.56e-05 | 1 | GTTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13696 | − | 2 | 11 | 6.56e-05 | 1 | CTTAATGACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15496 | − | 25 | 34 | 6.56e-05 | 1 | GCTAATGGCT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 22128 | + | 29 | 38 | 6.56e-05 | 1 | GTTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 22525 | + | 24 | 33 | 6.56e-05 | 1 | CTTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23142 | + | 29 | 38 | 6.56e-05 | 1 | CCTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 25812 | − | 12 | 21 | 6.56e-05 | 1 | GGTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27509 | − | 6 | 15 | 6.56e-05 | 1 | CTTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27972 | + | 21 | 30 | 6.56e-05 | 1 | GCTAATTAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30412 | + | 15 | 24 | 6.56e-05 | 1 | GCTAATTATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30926 | + | 14 | 23 | 6.56e-05 | 1 | CCTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35705 | + | 12 | 21 | 6.56e-05 | 1 | CTTAATGACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 37015 | − | 4 | 13 | 6.56e-05 | 1 | CCTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 37518 | + | 19 | 28 | 6.56e-05 | 1 | ACTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39425 | − | 10 | 19 | 6.56e-05 | 1 | GTTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 41219 | + | 29 | 38 | 6.56e-05 | 1 | GTTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1388 | − | 6 | 15 | 8.62e-05 | 1 | CCTAATTAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2445 | + | 9 | 18 | 8.62e-05 | 1 | GGTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3156 | + | 3 | 12 | 8.62e-05 | 1 | CTTAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 4162 | − | 7 | 16 | 8.62e-05 | 1 | GTTAATGAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 5358 | + | 29 | 38 | 8.62e-05 | 1 | GTTAATTAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 8379 | − | 16 | 25 | 8.62e-05 | 1 | GGTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 8703 | + | 13 | 22 | 8.62e-05 | 1 | GCTAATGGCG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 11357 | + | 4 | 13 | 8.62e-05 | 1 | GGTAATGACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12233 | − | 25 | 34 | 8.62e-05 | 1 | CCTAATGGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12356 | − | 8 | 17 | 8.62e-05 | 1 | GTTAATTAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13081 | − | 18 | 27 | 8.62e-05 | 1 | ATTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 14297 | + | 7 | 16 | 8.62e-05 | 1 | GTTAATGGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 17237 | + | 25 | 34 | 8.62e-05 | 1 | CTTAATTACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 18607 | + | 1 | 10 | 8.62e-05 | 1 | GCTAATTGCT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19227 | + | 21 | 30 | 8.62e-05 | 1 | TCTAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19364 | − | 13 | 22 | 8.62e-05 | 1 | CTTAATTACG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 5588 | + | 22 | 31 | 0.000109 | 1 | CGTAATTACC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3852 | + | 21 | 30 | 0.00013 | 1 | ACTAATGACA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12780 | − | 26 | 35 | 0.00013 | 1 | GGTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13731 | − | 19 | 28 | 0.00013 | 1 | GGTAATTAGC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 17965 | − | 27 | 36 | 0.00013 | 1 | CATAATTACC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 21162 | − | 12 | 21 | 0.00013 | 1 | GTTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 21652 | + | 12 | 21 | 0.00013 | 1 | GCTAATTGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 21780 | + | 22 | 31 | 0.00013 | 1 | GATAATTACG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 25110 | − | 18 | 27 | 0.00013 | 1 | CTTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 25558 | − | 28 | 37 | 0.00013 | 1 | CATAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27167 | + | 12 | 21 | 0.00013 | 1 | ACTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 28580 | + | 20 | 29 | 0.00013 | 1 | GATAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30217 | + | 23 | 32 | 0.00013 | 1 | CCTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30850 | + | 19 | 28 | 0.00013 | 1 | CATAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 37940 | − | 2 | 11 | 0.00013 | 1 | CATAATTACC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 38164 | + | 24 | 33 | 0.00013 | 1 | CCTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 38303 | − | 13 | 22 | 0.00013 | 1 | GCTAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39938 | − | 12 | 21 | 0.00013 | 1 | CCTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40082 | − | 5 | 14 | 0.00013 | 1 | GATAATTACG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 886 | − | 27 | 36 | 0.000153 | 1 | CCTAATGGCT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1222 | + | 8 | 17 | 0.000153 | 1 | GATAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1595 | − | 8 | 17 | 0.000153 | 1 | CTTAATGAGT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2820 | + | 26 | 35 | 0.000153 | 1 | GGTAATTACA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9350 | − | 26 | 35 | 0.000153 | 1 | GGTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 14926 | + | 6 | 15 | 0.000153 | 1 | CGTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15479 | + | 11 | 20 | 0.000153 | 1 | GATAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16127 | − | 27 | 36 | 0.000153 | 1 | CCTAATTAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16271 | − | 2 | 11 | 0.000153 | 1 | GTTAATTATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 17359 | + | 6 | 15 | 0.000153 | 1 | GCTAATTAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19033 | − | 24 | 33 | 0.000153 | 1 | GCTAATTAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19759 | − | 27 | 36 | 0.000153 | 1 | GTTAATTATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 20720 | − | 18 | 27 | 0.000153 | 1 | GCTAATTGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 22846 | − | 13 | 22 | 0.000153 | 1 | GTTAATTAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 22966 | + | 8 | 17 | 0.000153 | 1 | CCTAATTAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23129 | − | 1 | 10 | 0.000153 | 1 | GGTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23243 | + | 20 | 29 | 0.000153 | 1 | GCTAATTGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 25270 | − | 14 | 23 | 0.000153 | 1 | ATTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 25927 | − | 29 | 38 | 0.000153 | 1 | ACTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27608 | − | 22 | 31 | 0.000153 | 1 | TCTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29181 | + | 14 | 23 | 0.000153 | 1 | CCTAATTATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29341 | − | 17 | 26 | 0.000153 | 1 | CGTAATGACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29457 | − | 29 | 38 | 0.000153 | 1 | ACTAATTACA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30332 | − | 19 | 28 | 0.000153 | 1 | GCTAATTATG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40301 | − | 7 | 16 | 0.000213 | 1 | CATAATTACT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40887 | + | 24 | 33 | 0.000213 | 1 | GCTAATTATA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35 | − | 2 | 11 | 0.000253 | 1 | CCTAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1388 | + | 6 | 15 | 0.000253 | 1 | ACTAATTAGG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2885 | + | 15 | 24 | 0.000253 | 1 | CGTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3196 | + | 19 | 28 | 0.000253 | 1 | AATAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3315 | − | 18 | 27 | 0.000253 | 1 | GTTAATGAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 5287 | − | 12 | 21 | 0.000253 | 1 | GATAATGGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 5873 | + | 28 | 37 | 0.000253 | 1 | GGTAATTAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6121 | + | 11 | 20 | 0.000253 | 1 | GATAATGGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6305 | + | 23 | 32 | 0.000253 | 1 | CGTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6706 | + | 10 | 19 | 0.000253 | 1 | TCTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6878 | − | 4 | 13 | 0.000253 | 1 | GCTAATTAAT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6878 | + | 4 | 13 | 0.000253 | 1 | ATTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 7632 | − | 29 | 38 | 0.000253 | 1 | ACTAATTGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 7688 | − | 22 | 31 | 0.000253 | 1 | CCTAATGGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 8379 | + | 16 | 25 | 0.000253 | 1 | AGTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10601 | + | 7 | 16 | 0.000253 | 1 | GATAATGAGG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16643 | − | 21 | 30 | 0.000253 | 1 | GTTAATGGCA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 18339 | − | 15 | 24 | 0.000253 | 1 | GTTAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19423 | − | 24 | 33 | 0.000253 | 1 | CATAATTACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19918 | − | 22 | 31 | 0.000253 | 1 | GTTAATTGGC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27972 | − | 21 | 30 | 0.000253 | 1 | TCTAATTAGC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29759 | − | 26 | 35 | 0.000253 | 1 | CCTAATTATT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30663 | − | 15 | 24 | 0.000253 | 1 | GCTAATTGGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 31392 | + | 13 | 22 | 0.000253 | 1 | GCTAATGAAG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35075 | + | 7 | 16 | 0.000253 | 1 | CCTAATTGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35695 | − | 24 | 33 | 0.000253 | 1 | GGTAATTAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 37446 | + | 18 | 27 | 0.000253 | 1 | CCTAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 38156 | − | 24 | 33 | 0.000253 | 1 | CATAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 38284 | + | 24 | 33 | 0.000253 | 1 | GTTAATGAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39097 | + | 22 | 31 | 0.000253 | 1 | TCTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39448 | + | 2 | 11 | 0.000253 | 1 | GCTAATTGGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39504 | + | 5 | 14 | 0.000253 | 1 | GGTAATTGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40115 | + | 18 | 27 | 0.000253 | 1 | CCTAATGGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40157 | + | 23 | 32 | 0.000253 | 1 | GATAATTAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 41155 | + | 12 | 21 | 0.000253 | 1 | GTTAATGGCA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 5152 | − | 6 | 15 | 0.000287 | 1 | CTTAATTATC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6816 | − | 24 | 33 | 0.000287 | 1 | CATAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 7523 | + | 18 | 27 | 0.000287 | 1 | GATAATTAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 7796 | + | 30 | 39 | 0.000287 | 1 | GCTAATGGTC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9239 | − | 21 | 30 | 0.000287 | 1 | CGTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10165 | + | 5 | 14 | 0.000287 | 1 | CTTAATGGCT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10415 | + | 20 | 29 | 0.000287 | 1 | GCTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 11893 | − | 1 | 10 | 0.000287 | 1 | CTTAATGGCT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12232 | − | 21 | 30 | 0.000287 | 1 | GTTAATTATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12455 | − | 22 | 31 | 0.000287 | 1 | CCTAATTATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12688 | + | 16 | 25 | 0.000287 | 1 | CTTAATTAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13061 | + | 12 | 21 | 0.000287 | 1 | GCTAATTAAG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15112 | − | 10 | 19 | 0.000287 | 1 | GCTAATGGGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15286 | − | 22 | 31 | 0.000287 | 1 | TCTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15997 | + | 2 | 11 | 0.000287 | 1 | ATTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16019 | + | 12 | 21 | 0.000287 | 1 | AATAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16344 | − | 13 | 22 | 0.000287 | 1 | ACTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19094 | − | 22 | 31 | 0.000287 | 1 | ACTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19350 | − | 14 | 23 | 0.000287 | 1 | GTTAATTAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19350 | + | 14 | 23 | 0.000287 | 1 | GTTAATTAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19457 | − | 6 | 15 | 0.000287 | 1 | CATAATGACA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19844 | + | 6 | 15 | 0.000287 | 1 | GTTAATTGCA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 24706 | + | 5 | 14 | 0.000287 | 1 | CATAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 28389 | + | 18 | 27 | 0.000287 | 1 | CCTAATTAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29181 | − | 14 | 23 | 0.000287 | 1 | GATAATTAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29186 | − | 6 | 15 | 0.000287 | 1 | TTTAATGACT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 31379 | − | 16 | 25 | 0.000287 | 1 | GCTAATTAAG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 31454 | + | 11 | 20 | 0.000287 | 1 | ACTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 31488 | + | 7 | 16 | 0.000287 | 1 | GGTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 31713 | − | 29 | 38 | 0.000287 | 1 | ACTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 32207 | + | 13 | 22 | 0.000287 | 1 | CCTAATTGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 32480 | + | 27 | 36 | 0.000287 | 1 | ATTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 32809 | − | 12 | 21 | 0.000287 | 1 | GCTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 33672 | − | 21 | 30 | 0.000287 | 1 | GGTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 34154 | − | 3 | 12 | 0.000287 | 1 | GGTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35400 | + | 15 | 24 | 0.000287 | 1 | GGTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35956 | − | 3 | 12 | 0.000287 | 1 | ATTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 36428 | − | 20 | 29 | 0.000287 | 1 | CCTAATTAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 38049 | + | 17 | 26 | 0.000287 | 1 | CGTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 38946 | + | 30 | 39 | 0.000287 | 1 | GCTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39228 | − | 22 | 31 | 0.000287 | 1 | GATAATTGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39596 | − | 27 | 36 | 0.000287 | 1 | CCTAATTGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 41162 | + | 10 | 19 | 0.000287 | 1 | TTTAATGACT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3225 | + | 10 | 19 | 0.000319 | 1 | TCTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3663 | − | 28 | 37 | 0.000319 | 1 | CTTAATTGCT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 4734 | − | 12 | 21 | 0.000319 | 1 | TCTAATGAGT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 8512 | − | 24 | 33 | 0.000319 | 1 | CATAATTACA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10002 | − | 29 | 38 | 0.000319 | 1 | ACTAATTAGA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23728 | + | 23 | 32 | 0.000319 | 1 | GCTAATTGGA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 34482 | + | 7 | 16 | 0.000319 | 1 | GTTAATGGGT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6946 | + | 26 | 35 | 0.000366 | 1 | GATAATTATC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 14444 | − | 28 | 37 | 0.000366 | 1 | CGTAATGGCC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 20068 | − | 29 | 38 | 0.000366 | 1 | ACTAATGGCG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 22569 | + | 1 | 10 | 0.000366 | 1 | GATAATTATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23099 | + | 14 | 23 | 0.000366 | 1 | TCTAATGAGG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 25865 | − | 28 | 37 | 0.000366 | 1 | CGTAATTAGT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29284 | + | 26 | 35 | 0.000366 | 1 | TCTAATGGCC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 32816 | + | 18 | 27 | 0.000366 | 1 | AGTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 33135 | − | 5 | 14 | 0.000366 | 1 | GATAATGGCT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35330 | + | 3 | 12 | 0.000366 | 1 | GTTAATTGGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35533 | − | 27 | 36 | 0.000366 | 1 | TCTAATGGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35590 | + | 11 | 20 | 0.000366 | 1 | CGTAATTAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 36406 | + | 27 | 36 | 0.000366 | 1 | ATTAATGAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 37005 | − | 9 | 18 | 0.000366 | 1 | ATTAATGAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 37086 | − | 28 | 37 | 0.000366 | 1 | CATAATGAGT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39154 | + | 23 | 32 | 0.000366 | 1 | GCTAATCACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39523 | + | 4 | 13 | 0.000366 | 1 | CCTAATGAAT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39817 | + | 15 | 24 | 0.000366 | 1 | GATAATTAGA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40401 | − | 15 | 24 | 0.000366 | 1 | TTTAATTACG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 482 | + | 28 | 37 | 0.000414 | 1 | CATAATGAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 916 | − | 25 | 34 | 0.000414 | 1 | CTTAATTGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1248 | − | 6 | 15 | 0.000414 | 1 | GCTAATGGTT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1669 | + | 10 | 19 | 0.000414 | 1 | CCTAATTGGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2757 | + | 21 | 30 | 0.000414 | 1 | GTTAATTAAT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2820 | − | 26 | 35 | 0.000414 | 1 | TGTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3277 | + | 10 | 19 | 0.000414 | 1 | GTTAATGAAG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3595 | + | 23 | 32 | 0.000414 | 1 | GATAATTGCT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3870 | + | 10 | 19 | 0.000414 | 1 | TCTAATTGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 4326 | − | 4 | 13 | 0.000414 | 1 | CTTAATGAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 4409 | − | 4 | 13 | 0.000414 | 1 | AGTAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 4594 | − | 13 | 22 | 0.000414 | 1 | GGTAATGGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 4947 | − | 11 | 20 | 0.000414 | 1 | ATTAATTAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 4947 | + | 11 | 20 | 0.000414 | 1 | CCTAATTAAT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 4995 | − | 6 | 15 | 0.000414 | 1 | ATTAATTGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 5441 | − | 25 | 34 | 0.000414 | 1 | ACTAATTGCG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6100 | − | 18 | 27 | 0.000414 | 1 | CATAATGAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6250 | + | 2 | 11 | 0.000414 | 1 | GATAATGGCG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6525 | + | 14 | 23 | 0.000414 | 1 | TTTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 7235 | − | 9 | 18 | 0.000414 | 1 | TATAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9261 | − | 15 | 24 | 0.000414 | 1 | GTTAATTGGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9330 | + | 18 | 27 | 0.000414 | 1 | ACTAATGATT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9350 | + | 26 | 35 | 0.000414 | 1 | TGTAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9462 | − | 6 | 15 | 0.000414 | 1 | TTTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9633 | − | 7 | 16 | 0.000414 | 1 | AGTAATTACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10912 | − | 23 | 32 | 0.000414 | 1 | AATAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 11062 | − | 16 | 25 | 0.000414 | 1 | CTTAATTATT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 11756 | + | 26 | 35 | 0.000414 | 1 | CATAATTAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12066 | + | 23 | 32 | 0.000414 | 1 | TATAATGACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12215 | + | 19 | 28 | 0.000414 | 1 | TTTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12627 | − | 25 | 34 | 0.000414 | 1 | GTTAATTAAT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12881 | + | 22 | 31 | 0.000414 | 1 | GTTAATTGGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13037 | − | 14 | 23 | 0.000414 | 1 | GATAATGGCG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13394 | − | 9 | 18 | 0.000414 | 1 | TTTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13432 | + | 8 | 17 | 0.000414 | 1 | ACTAATTGCG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13770 | − | 24 | 33 | 0.000414 | 1 | GGTAATGATT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 36635 | + | 19 | 28 | 0.000414 | 1 | ATTAATTAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 36935 | + | 12 | 21 | 0.000414 | 1 | GGTAATGGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 37732 | + | 24 | 33 | 0.000414 | 1 | CATAATGAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 38833 | − | 16 | 25 | 0.000414 | 1 | CCTAATGAAG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39851 | − | 12 | 21 | 0.000414 | 1 | AGTAATGAGC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 41073 | + | 17 | 26 | 0.000414 | 1 | GGTAATTGCG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 41220 | − | 11 | 20 | 0.000414 | 1 | GGTAATTGCG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 436 | − | 28 | 37 | 0.000465 | 1 | CCTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 854 | − | 29 | 38 | 0.000465 | 1 | ACTAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1118 | − | 9 | 18 | 0.000465 | 1 | CTTAATTGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1255 | − | 29 | 38 | 0.000465 | 1 | ACTAATTGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1399 | − | 7 | 16 | 0.000465 | 1 | TCTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1656 | + | 22 | 31 | 0.000465 | 1 | AGTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2148 | + | 21 | 30 | 0.000465 | 1 | CATAATTAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2601 | − | 29 | 38 | 0.000465 | 1 | ACTAATTATT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 2947 | + | 17 | 26 | 0.000465 | 1 | TTTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3211 | − | 4 | 13 | 0.000465 | 1 | TTTAATTACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3318 | − | 26 | 35 | 0.000465 | 1 | ATTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3678 | − | 12 | 21 | 0.000465 | 1 | ACTAATTGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 4078 | + | 30 | 39 | 0.000465 | 1 | GTTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 5311 | − | 24 | 33 | 0.000465 | 1 | CGTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 5494 | + | 14 | 23 | 0.000465 | 1 | TATAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6297 | − | 29 | 38 | 0.000465 | 1 | ACTAATTGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6378 | + | 20 | 29 | 0.000465 | 1 | ACTAATGAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 7059 | + | 6 | 15 | 0.000465 | 1 | CTTAATTGCA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 7671 | + | 10 | 19 | 0.000465 | 1 | GCTAATTGTT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 7971 | + | 9 | 18 | 0.000465 | 1 | GGTAATTATT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 8238 | + | 3 | 12 | 0.000465 | 1 | GGTAATTGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 8762 | − | 6 | 15 | 0.000465 | 1 | CCTAATTAAG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9351 | − | 13 | 22 | 0.000465 | 1 | TCTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9795 | + | 9 | 18 | 0.000465 | 1 | GGTAATGAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 9937 | + | 30 | 39 | 0.000465 | 1 | CCTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10390 | + | 21 | 30 | 0.000465 | 1 | GGTAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10708 | + | 30 | 39 | 0.000465 | 1 | CCTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10773 | + | 11 | 20 | 0.000465 | 1 | GATAATGATT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 10909 | − | 3 | 12 | 0.000465 | 1 | ACTAATGAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 11190 | + | 7 | 16 | 0.000465 | 1 | ACTAATTGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 11375 | − | 16 | 25 | 0.000465 | 1 | AATAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 11610 | + | 7 | 16 | 0.000465 | 1 | CCTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12455 | + | 22 | 31 | 0.000465 | 1 | CATAATTAGG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12775 | − | 29 | 38 | 0.000465 | 1 | ACTAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13629 | − | 16 | 25 | 0.000465 | 1 | GGTAATGGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 14958 | + | 24 | 33 | 0.000465 | 1 | GGTAATGGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15469 | − | 7 | 16 | 0.000465 | 1 | GATAATGGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15546 | − | 6 | 15 | 0.000465 | 1 | GCTAATGGAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15760 | − | 9 | 18 | 0.000465 | 1 | AATAATTACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16019 | − | 12 | 21 | 0.000465 | 1 | GGTAATTATT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16247 | + | 13 | 22 | 0.000465 | 1 | GTTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16278 | − | 9 | 18 | 0.000465 | 1 | CCTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16663 | + | 20 | 29 | 0.000465 | 1 | AATAATGAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 17238 | + | 5 | 14 | 0.000465 | 1 | AATAATTACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 17728 | + | 25 | 34 | 0.000465 | 1 | TCTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 17746 | + | 12 | 21 | 0.000465 | 1 | CGTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 18455 | + | 13 | 22 | 0.000465 | 1 | CCTAATGGGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 18762 | − | 7 | 16 | 0.000465 | 1 | GATAATTGCG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 18991 | − | 29 | 38 | 0.000465 | 1 | ACTAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19577 | + | 27 | 36 | 0.000465 | 1 | ACTAATGGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 19592 | + | 24 | 33 | 0.000465 | 1 | AGTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 20565 | − | 6 | 15 | 0.000465 | 1 | CCTAATGGGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 21232 | + | 2 | 11 | 0.000465 | 1 | ACTAATGGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 21760 | + | 14 | 23 | 0.000465 | 1 | ATTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 21797 | − | 28 | 37 | 0.000465 | 1 | CGTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 22680 | + | 30 | 39 | 0.000465 | 1 | GTTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23298 | + | 20 | 29 | 0.000465 | 1 | GATAATTGCG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23481 | − | 1 | 10 | 0.000465 | 1 | ATTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23732 | + | 20 | 29 | 0.000465 | 1 | CGTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23833 | − | 11 | 20 | 0.000465 | 1 | GCTAATGGTG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23850 | − | 18 | 27 | 0.000465 | 1 | CTTAATTAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23850 | + | 18 | 27 | 0.000465 | 1 | GTTAATTAAG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 24373 | + | 5 | 14 | 0.000465 | 1 | ACTAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 24501 | − | 9 | 18 | 0.000465 | 1 | CATAATTGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 25618 | + | 13 | 22 | 0.000465 | 1 | GATAATGGGC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27105 | + | 28 | 37 | 0.000465 | 1 | GTTAATTAAG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27109 | − | 9 | 18 | 0.000465 | 1 | ACTAATTATT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27360 | + | 11 | 20 | 0.000465 | 1 | GCTAATGGAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 27801 | − | 4 | 13 | 0.000465 | 1 | CGTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 28085 | − | 29 | 38 | 0.000465 | 1 | ACTAATGAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 28677 | − | 16 | 25 | 0.000465 | 1 | ACTAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 28866 | + | 11 | 20 | 0.000465 | 1 | GTTAATGGGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29058 | + | 13 | 22 | 0.000465 | 1 | GCTAATGGTG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29427 | − | 10 | 19 | 0.000465 | 1 | GGTAATTGGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29485 | − | 7 | 16 | 0.000465 | 1 | ACTAATGGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 29713 | − | 16 | 25 | 0.000465 | 1 | AGTAATGACA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30101 | − | 29 | 38 | 0.000465 | 1 | ACTAATGAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30250 | + | 30 | 39 | 0.000465 | 1 | CCTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 30561 | − | 18 | 27 | 0.000465 | 1 | GGTAATGAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 31726 | − | 6 | 15 | 0.000465 | 1 | GTTAATGGGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 34520 | + | 13 | 22 | 0.000465 | 1 | ACTAATTATT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 34605 | − | 3 | 12 | 0.000465 | 1 | TATAATTACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35273 | − | 21 | 30 | 0.000465 | 1 | ATTAATGATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 35560 | − | 16 | 25 | 0.000465 | 1 | GCTAATTGTT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 36424 | + | 12 | 21 | 0.000465 | 1 | CCTAATTAAG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 36611 | + | 30 | 39 | 0.000465 | 1 | GTTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 36907 | − | 13 | 22 | 0.000465 | 1 | AGTAATTAGC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 37835 | + | 21 | 30 | 0.000465 | 1 | TCTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 38841 | + | 22 | 31 | 0.000465 | 1 | ATTAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39225 | + | 19 | 28 | 0.000465 | 1 | CTTAATTATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 39434 | − | 14 | 23 | 0.000465 | 1 | GATAATGATT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40107 | − | 27 | 36 | 0.000465 | 1 | GTTAATTAAG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40107 | + | 27 | 36 | 0.000465 | 1 | CTTAATTAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40227 | − | 17 | 26 | 0.000465 | 1 | GGTAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40241 | − | 5 | 14 | 0.000465 | 1 | GTTAATGGTC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40981 | − | 2 | 11 | 0.000465 | 1 | GTTAATTAAG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40981 | + | 2 | 11 | 0.000465 | 1 | CTTAATTAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 41079 | + | 3 | 12 | 0.000465 | 1 | CATAATTGCC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 404 | − | 26 | 35 | 0.000519 | 1 | TCTAATTAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 404 | + | 26 | 35 | 0.000519 | 1 | TCTAATTAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 583 | + | 18 | 27 | 0.000519 | 1 | CATAATGAGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1019 | − | 27 | 36 | 0.000519 | 1 | CGTAATGGCT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 1287 | − | 6 | 15 | 0.000519 | 1 | TCTAATGGCT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 20393 | + | 21 | 30 | 0.000519 | 1 | TCTAATGGCT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 21767 | − | 14 | 23 | 0.000519 | 1 | CCTAATTGGA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 21780 | − | 22 | 31 | 0.000519 | 1 | CGTAATTATC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 22985 | + | 4 | 13 | 0.000519 | 1 | GATAATGATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 23342 | + | 15 | 24 | 0.000519 | 1 | ACTAATTATG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 25116 | + | 7 | 16 | 0.000519 | 1 | GGTAATTGCA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 25197 | − | 24 | 33 | 0.000519 | 1 | GCTAATTGAC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 25558 | + | 28 | 37 | 0.000519 | 1 | GGTAATTATG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 36519 | + | 21 | 30 | 0.000519 | 1 | GATAATGAAC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 40683 | + | 1 | 10 | 0.000519 | 1 | TCTAATTAGA |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 3807 | − | 8 | 17 | 0.000567 | 1 | GCTAATGTCC |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 6888 | + | 11 | 20 | 0.000567 | 1 | GGTAATGGGT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 12625 | − | 25 | 34 | 0.000567 | 1 | CTTAATGGGG |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13527 | + | 22 | 31 | 0.000567 | 1 | CCTAATCACC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 13898 | − | 14 | 23 | 0.000567 | 1 | CTTAATTATA |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 14134 | + | 2 | 11 | 0.000567 | 1 | TCTAATTGCT |
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| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15261 | + | 29 | 38 | 0.000567 | 1 | AGTAATGAGT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 15332 | + | 28 | 37 | 0.000567 | 1 | GCTAATCACG |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16205 | + | 21 | 30 | 0.000567 | 1 | TGTAATTACT |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16271 | + | 2 | 11 | 0.000567 | 1 | GATAATTAAC |
| Hoxa2_3079.1.bml.pwm | 16288 | − | 22 | 31 | 0.000567 | 1 | GCTAATGGTA |
Command line:
/home/yang23/programs/meme_4.9.0/bin/fimo -oc /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssnp8b2tobrdi8kv1c109j7m8mm77l821g9qjdvk5khil9hc1kmnf1/shuffled -thresh 0.001 /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssnp8b2tobrdi8kv1c109j7m8mm77l821g9qjdvk5khil9hc1kmnf1/pwm.fimo /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssnp8b2tobrdi8kv1c109j7m8mm77l821g9qjdvk5khil9hc1kmnf1/uniprobes.shuffled.fasta
Settings:
| output directory = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssnp8b2tobrdi8kv1c109j7m8mm77l821g9qjdvk5khil9hc1kmnf1/shuffled | MEME file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssnp8b2tobrdi8kv1c109j7m8mm77l821g9qjdvk5khil9hc1kmnf1/pwm.fimo | sequence file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssnp8b2tobrdi8kv1c109j7m8mm77l821g9qjdvk5khil9hc1kmnf1/uniprobes.shuffled.fasta |
| allow clobber = true | compute q-values = true | text only = false |
| scan both strands = true | max sequence length = 250000000 | output threshold = 0.001 |
| threshold type = p-value | max stored scores = 100000 | pseudocount = 0.1 |
| verbosity = 2 |
This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.