| Database and Motifs | High-scoring Motif Occurences | Debugging Information |
FIMO version 4.9.0, (Release date: 6 EST 20)
For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net
If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble,
"FIMO: Scanning for occurrences of a given motif",
Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011.
DATABASE
/srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss9262rfqm4gmh9rme0if0o5vt294sgv86qc96oqfufpvjus0m54e1/uniprobes.descend.fasta
Database contains
41735
sequences,
2504100
residues
MOTIFS /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss9262rfqm4gmh9rme0if0o5vt294sgv86qc96oqfufpvjus0m54e1/pwm.fimo (nucleotide)
| MOTIF | WIDTH | BEST POSSIBLE MATCH |
|---|---|---|
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 10 | TTAATGACTT |
Random model letter frequencies
(from non-redundant database):
A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275
| Motif | Sequence Name | Strand | Start | End | p-value | q-value | Matched Sequence |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 32 | + | 8 | 17 | 3.67e-06 | 1 | TTAATGACCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 47 | + | 1 | 10 | 3.67e-06 | 1 | CTAATGACCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 48 | + | 20 | 29 | 3.67e-06 | 1 | TTAATGGCCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 220 | − | 15 | 24 | 3.67e-06 | 1 | TTAATGACCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 646 | + | 26 | 35 | 3.67e-06 | 1 | CTAATGACCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1638 | − | 11 | 20 | 3.67e-06 | 1 | CTAATGGCCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2079 | − | 19 | 28 | 3.67e-06 | 1 | TTAATGGCCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3376 | − | 25 | 34 | 3.67e-06 | 1 | CTAATGACCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3637 | + | 1 | 10 | 3.67e-06 | 1 | CTAATGGCCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4949 | + | 26 | 35 | 3.67e-06 | 1 | CTAATGGCCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 65 | + | 6 | 15 | 8.14e-06 | 1 | TTAATGACCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 67 | − | 17 | 26 | 8.14e-06 | 1 | TTAATGACCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 190 | − | 5 | 14 | 8.14e-06 | 1 | TTAATGGCCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 960 | − | 25 | 34 | 8.14e-06 | 1 | CTAATGACCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2491 | + | 22 | 31 | 8.14e-06 | 1 | CTAATGACCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2629 | + | 9 | 18 | 8.14e-06 | 1 | CTAATGGCCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5018 | + | 20 | 29 | 8.14e-06 | 1 | TTAATGGCCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 12095 | − | 24 | 33 | 8.14e-06 | 1 | CTAATGGCCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 95 | − | 21 | 30 | 1.18e-05 | 1 | TTAATGACCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 169 | + | 13 | 22 | 1.18e-05 | 1 | TTAATGACCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 585 | − | 9 | 18 | 1.18e-05 | 1 | CTAATGACCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 789 | + | 14 | 23 | 1.18e-05 | 1 | TTAATGGCCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1527 | − | 15 | 24 | 1.18e-05 | 1 | TTAATGGCCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1688 | − | 20 | 29 | 1.18e-05 | 1 | CTAATGGCCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2956 | + | 20 | 29 | 1.18e-05 | 1 | CTAATGACCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 11106 | − | 26 | 35 | 1.18e-05 | 1 | CTAATGGCCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 26343 | + | 27 | 36 | 1.18e-05 | 1 | CTAATGGCCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 72 | + | 11 | 20 | 1.63e-05 | 1 | TTAATGACTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 447 | + | 6 | 15 | 1.63e-05 | 1 | TTAATGGCTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 563 | − | 13 | 22 | 1.63e-05 | 1 | TTAATGACTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 584 | + | 10 | 19 | 1.63e-05 | 1 | CTAATGACTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1515 | − | 21 | 30 | 1.63e-05 | 1 | CTAATGACTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1938 | − | 12 | 21 | 1.63e-05 | 1 | TTAATGGCTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2670 | − | 1 | 10 | 1.63e-05 | 1 | CTAATGGCTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3380 | − | 26 | 35 | 1.63e-05 | 1 | CTAATGGCTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3472 | + | 22 | 31 | 1.63e-05 | 1 | CTAATGGCTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 28 | + | 8 | 17 | 2.17e-05 | 1 | TTAATGACTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 145 | + | 4 | 13 | 2.17e-05 | 1 | TTAATGGCTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 581 | − | 16 | 25 | 2.17e-05 | 1 | CTAATGACTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 834 | + | 23 | 32 | 2.17e-05 | 1 | CTAATGACTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1117 | − | 5 | 14 | 2.17e-05 | 1 | TTAATGGCTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1126 | − | 21 | 30 | 2.17e-05 | 1 | TTAATGACTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3967 | + | 23 | 32 | 2.17e-05 | 1 | CTAATGGCTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 8348 | − | 24 | 33 | 2.17e-05 | 1 | CTAATGGCTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 36 | + | 5 | 14 | 3.07e-05 | 1 | TTAATGACTG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 215 | − | 4 | 13 | 3.07e-05 | 1 | CTAATGACCA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 344 | + | 20 | 29 | 3.07e-05 | 1 | CTAATGACTG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 346 | + | 15 | 24 | 3.07e-05 | 1 | TTAATGACCA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 362 | + | 8 | 17 | 3.07e-05 | 1 | TTAATGGCCA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 430 | + | 7 | 16 | 3.07e-05 | 1 | CTAATGGCCA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 782 | − | 21 | 30 | 3.07e-05 | 1 | TTAATGACCA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1012 | − | 14 | 23 | 3.07e-05 | 1 | TTAATGACTG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1172 | − | 24 | 33 | 3.07e-05 | 1 | TTAATGGCTG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1312 | + | 16 | 25 | 3.07e-05 | 1 | CTAATGGCTG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2759 | − | 25 | 34 | 3.07e-05 | 1 | CTAATGACCA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2769 | − | 5 | 14 | 3.07e-05 | 1 | CTAATGGCTG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3587 | − | 13 | 22 | 3.07e-05 | 1 | CTAATGGCCA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3749 | − | 22 | 31 | 3.07e-05 | 1 | CTAATGACTG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5787 | − | 28 | 37 | 3.07e-05 | 1 | CTAATGGCTG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 6822 | − | 20 | 29 | 3.07e-05 | 1 | TTAATGGCCA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 11953 | + | 24 | 33 | 3.07e-05 | 1 | TTAATGGCTG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 175 | − | 11 | 20 | 4.25e-05 | 1 | TTAATGATCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 201 | + | 10 | 19 | 4.25e-05 | 1 | TTAATGACGC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 336 | − | 7 | 16 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGACGC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 359 | + | 8 | 17 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGGTCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 421 | − | 10 | 19 | 4.25e-05 | 1 | TTAATGAGCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 437 | + | 13 | 22 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGACGC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 640 | + | 4 | 13 | 4.25e-05 | 1 | TTAATGGCGC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 851 | − | 14 | 23 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGGCGC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1201 | + | 26 | 35 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGGGCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1246 | + | 25 | 34 | 4.25e-05 | 1 | TTAATGATCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1288 | − | 25 | 34 | 4.25e-05 | 1 | TTAATGGTCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1308 | − | 8 | 17 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGGTCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1582 | − | 14 | 23 | 4.25e-05 | 1 | TTAATGACGC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1683 | + | 16 | 25 | 4.25e-05 | 1 | TTAATGGTCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1899 | + | 10 | 19 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGGCGC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2115 | − | 14 | 23 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGATCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2495 | − | 15 | 24 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGAGCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2845 | + | 14 | 23 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGAGCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3398 | + | 22 | 31 | 4.25e-05 | 1 | TTAATGAGCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3804 | + | 26 | 35 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGATCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4663 | + | 1 | 10 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGATCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5633 | + | 24 | 33 | 4.25e-05 | 1 | TTAATGGGCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 6556 | − | 8 | 17 | 4.25e-05 | 1 | TTAATGGCGC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 10474 | − | 17 | 26 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGGGCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 30195 | + | 1 | 10 | 4.25e-05 | 1 | CTAATGGGCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 11 | + | 5 | 14 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGATCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 14 | − | 6 | 15 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGAGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 100 | + | 12 | 21 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGATCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 158 | − | 11 | 20 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGACGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 192 | + | 2 | 11 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGAGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 237 | − | 13 | 22 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGCGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 246 | − | 13 | 22 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 266 | − | 10 | 19 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGATCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 486 | + | 26 | 35 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGAGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 624 | + | 11 | 20 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 711 | + | 14 | 23 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 813 | − | 18 | 27 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGAGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 820 | − | 11 | 20 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 919 | − | 7 | 16 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGACGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1095 | + | 14 | 23 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGACGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1156 | + | 9 | 18 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGACGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1263 | − | 21 | 30 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGATCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1327 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1757 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1874 | + | 21 | 30 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1998 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2213 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2324 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2566 | − | 24 | 33 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2661 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2725 | + | 1 | 10 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGAGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2814 | + | 29 | 38 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGCGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3141 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3260 | + | 24 | 33 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGCGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3266 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3428 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3641 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3678 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3705 | + | 27 | 36 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGAGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3722 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3949 | + | 29 | 38 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGCGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4305 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4509 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4616 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4642 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4853 | + | 17 | 26 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGCGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4901 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5220 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5488 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5658 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5995 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 6286 | + | 16 | 25 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 7270 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 8106 | + | 23 | 32 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 10795 | − | 5 | 14 | 5.68e-05 | 1 | CTAATGGCGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 10815 | + | 31 | 40 | 5.68e-05 | 1 | TTAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 81 | + | 3 | 12 | 7.31e-05 | 1 | CTAATGATCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 204 | − | 4 | 13 | 7.31e-05 | 1 | TTAATGGTCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 342 | − | 17 | 26 | 7.31e-05 | 1 | TTAATTACCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 441 | + | 3 | 12 | 7.31e-05 | 1 | CTAATGGGCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 467 | − | 10 | 19 | 7.31e-05 | 1 | TTAATGGGCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 504 | + | 10 | 19 | 7.31e-05 | 1 | CTAATGGTCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 533 | − | 2 | 11 | 7.31e-05 | 1 | TTAATGAGCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 696 | + | 17 | 26 | 7.31e-05 | 1 | TTAATTGCCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 719 | − | 12 | 21 | 7.31e-05 | 1 | TTAATTGCCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 743 | − | 4 | 13 | 7.31e-05 | 1 | CTAATTGCCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 765 | − | 2 | 11 | 7.31e-05 | 1 | CTAATGGCGG |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4517 | − | 21 | 30 | 7.31e-05 | 1 | CTAATGACGG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5617 | + | 26 | 35 | 7.31e-05 | 1 | CTAATGACGG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5902 | + | 28 | 37 | 7.31e-05 | 1 | CTAATGGGCG |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 6493 | + | 28 | 37 | 7.31e-05 | 1 | TTAATGGCGG |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 14364 | + | 1 | 10 | 7.31e-05 | 1 | TTAATGGGCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 15176 | − | 18 | 27 | 7.31e-05 | 1 | CTAATGGGCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 17331 | − | 17 | 26 | 7.31e-05 | 1 | TTAATGGCGG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 27722 | + | 1 | 10 | 7.31e-05 | 1 | CTAATGACGG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 31011 | − | 27 | 36 | 7.31e-05 | 1 | CTAATGGCGG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 19 | + | 4 | 13 | 9.29e-05 | 1 | TTAATTGCCT |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 31 | + | 11 | 20 | 9.29e-05 | 1 | TTAATTACCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 38 | + | 8 | 17 | 9.29e-05 | 1 | TTAATGACAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 53 | − | 6 | 15 | 9.29e-05 | 1 | TTAATTACCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 86 | − | 4 | 13 | 9.29e-05 | 1 | TTAATGACAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 136 | − | 2 | 11 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGAACC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 217 | − | 2 | 11 | 9.29e-05 | 1 | CTAATTACCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 228 | + | 17 | 26 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGGACC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 382 | − | 5 | 14 | 9.29e-05 | 1 | TTAATGACTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 436 | − | 5 | 14 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGGACC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 486 | − | 20 | 29 | 9.29e-05 | 1 | TTAATGGCAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 492 | + | 12 | 21 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGACTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 623 | − | 12 | 21 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGACAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 637 | − | 5 | 14 | 9.29e-05 | 1 | TTAATTGCCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 647 | − | 9 | 18 | 9.29e-05 | 1 | CTAATTGCCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 721 | + | 5 | 14 | 9.29e-05 | 1 | TTAATGGCAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 736 | − | 25 | 34 | 9.29e-05 | 1 | TTAATGGCTA |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 997 | + | 18 | 27 | 9.29e-05 | 1 | TTAATGACTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1074 | + | 22 | 31 | 9.29e-05 | 1 | CTAATTGCCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1285 | − | 11 | 20 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGACTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1476 | − | 27 | 36 | 9.29e-05 | 1 | CTAATTACCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1566 | + | 19 | 28 | 9.29e-05 | 1 | TTAATGGCTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1687 | + | 23 | 32 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGACAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1752 | − | 26 | 35 | 9.29e-05 | 1 | TTAATGAACC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2212 | + | 22 | 31 | 9.29e-05 | 1 | TTAATGGACC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2267 | + | 22 | 31 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGGCTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 6762 | − | 16 | 25 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGGCAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 6918 | + | 1 | 10 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGAACC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 16910 | + | 19 | 28 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGGCAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 18232 | − | 24 | 33 | 9.29e-05 | 1 | CTAATGGCTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 7 | + | 10 | 19 | 0.00012 | 1 | TTAATGATTC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 23 | − | 8 | 17 | 0.00012 | 1 | TTAATTACCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 48 | − | 9 | 18 | 0.00012 | 1 | TTAATGGGTC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 128 | + | 6 | 15 | 0.00012 | 1 | TTAATGGTTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 177 | + | 4 | 13 | 0.00012 | 1 | TTAATGAACT |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 448 | − | 5 | 14 | 0.00012 | 1 | CTAATGGTTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 457 | − | 7 | 16 | 0.00012 | 1 | TTAATGAGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 475 | − | 7 | 16 | 0.00012 | 1 | TTAATGATTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 499 | − | 8 | 17 | 0.00012 | 1 | TTAATGACAT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 548 | + | 23 | 32 | 0.00012 | 1 | CTAATTACCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 619 | + | 10 | 19 | 0.00012 | 1 | CTAATGAACT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 712 | − | 5 | 14 | 0.00012 | 1 | TTAATGGCAT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 777 | + | 30 | 39 | 0.00012 | 1 | CTAATGAGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 822 | + | 17 | 26 | 0.00012 | 1 | TTAATGGACT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 832 | + | 12 | 21 | 0.00012 | 1 | TTAATGGCAT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 835 | − | 14 | 23 | 0.00012 | 1 | TTAATGGTTC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 885 | + | 30 | 39 | 0.00012 | 1 | CTAATGAGTC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1025 | + | 22 | 31 | 0.00012 | 1 | GTAATGGCCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1082 | − | 17 | 26 | 0.00012 | 1 | TTAATGAACT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1094 | + | 30 | 39 | 0.00012 | 1 | TTAATGAGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1128 | + | 1 | 10 | 0.00012 | 1 | TTAATTGCCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1160 | − | 5 | 14 | 0.00012 | 1 | GTAATGACCC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1171 | − | 3 | 12 | 0.00012 | 1 | TTAATGGACT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1182 | + | 7 | 16 | 0.00012 | 1 | CTAATGGACT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1340 | + | 23 | 32 | 0.00012 | 1 | CTAATGATTC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2354 | + | 30 | 39 | 0.00012 | 1 | CTAATGAGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2866 | − | 6 | 15 | 0.00012 | 1 | CTAATGGACT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3052 | + | 30 | 39 | 0.00012 | 1 | CTAATGAGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3114 | − | 28 | 37 | 0.00012 | 1 | CTAATTGCCG |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 23292 | + | 1 | 10 | 0.00012 | 1 | GTAATGACCC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 608 | − | 24 | 33 | 0.000274 | 1 | CTAATTGCGC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 776 | + | 11 | 20 | 0.000274 | 1 | TTAATTGTCC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 866 | + | 16 | 25 | 0.000274 | 1 | CTAATTATCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 877 | − | 26 | 35 | 0.000274 | 1 | TTAATTGCGC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1033 | − | 7 | 16 | 0.000274 | 1 | CTAATTGTCC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1208 | − | 27 | 36 | 0.000274 | 1 | TTAATTGGCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1261 | + | 21 | 30 | 0.000274 | 1 | GTAATGGCTT |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 56 | − | 10 | 19 | 0.000325 | 1 | TTAATGGGTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 78 | + | 12 | 21 | 0.000325 | 1 | CTAATTACGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 104 | − | 3 | 12 | 0.000325 | 1 | CTAATGAGTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 107 | − | 7 | 16 | 0.000325 | 1 | CTAATTATCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 126 | + | 15 | 24 | 0.000325 | 1 | CTAATTATCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 140 | + | 6 | 15 | 0.000325 | 1 | CTAATGGTTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 162 | + | 19 | 28 | 0.000325 | 1 | CTAATGATTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 219 | − | 5 | 14 | 0.000325 | 1 | TTAATTATCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 229 | − | 4 | 13 | 0.000325 | 1 | ATAATGGCTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 236 | − | 3 | 12 | 0.000325 | 1 | CTAATGAGTA |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 355 | − | 2 | 11 | 0.000325 | 1 | TTAATGGTTA |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 544 | + | 11 | 20 | 0.000325 | 1 | TTAATGAAGC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 549 | − | 23 | 32 | 0.000325 | 1 | CTAATTAGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 561 | + | 23 | 32 | 0.000325 | 1 | TTAATGAGTA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 595 | + | 12 | 21 | 0.000325 | 1 | TTAATGGGAC |
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| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 966 | − | 6 | 15 | 0.000475 | 1 | CTAATGAGGA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 973 | + | 30 | 39 | 0.000475 | 1 | TTAATTAGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 978 | + | 13 | 22 | 0.000475 | 1 | GTAATGATCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 996 | − | 15 | 24 | 0.000475 | 1 | TTAATTATTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1002 | + | 30 | 39 | 0.000475 | 1 | CTAATTAGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1047 | + | 5 | 14 | 0.000475 | 1 | ATAATGGGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1148 | + | 2 | 11 | 0.000475 | 1 | ATAATGACGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1219 | + | 13 | 22 | 0.000475 | 1 | TTAATGGTGA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1258 | − | 12 | 21 | 0.000475 | 1 | TTAATGGTGA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1318 | + | 21 | 30 | 0.000475 | 1 | TTAATGAATA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1321 | + | 31 | 40 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1361 | − | 15 | 24 | 0.000475 | 1 | CTAATTGTTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1408 | − | 2 | 11 | 0.000475 | 1 | CTAATGGATA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1426 | + | 24 | 33 | 0.000475 | 1 | CTAATTGACT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1452 | − | 20 | 29 | 0.000475 | 1 | CTAATTGACT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1474 | − | 5 | 14 | 0.000475 | 1 | TTAATTGGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1478 | + | 30 | 39 | 0.000475 | 1 | CTAATTAGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1493 | − | 3 | 12 | 0.000475 | 1 | CTAATGGAAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1510 | + | 24 | 33 | 0.000475 | 1 | ATAATGATCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1552 | + | 13 | 22 | 0.000475 | 1 | GTAATGACGG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1633 | + | 1 | 10 | 0.000475 | 1 | CTAATTACAT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1734 | − | 14 | 23 | 0.000475 | 1 | TTAATGAGGA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1748 | − | 17 | 26 | 0.000475 | 1 | GTAATGGCGG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1861 | + | 30 | 39 | 0.000475 | 1 | TTAATTGGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1881 | + | 3 | 12 | 0.000475 | 1 | TTAATGAAAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1907 | + | 13 | 22 | 0.000475 | 1 | GTAATGAGCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1911 | − | 18 | 27 | 0.000475 | 1 | GTAATTGCCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 1978 | + | 14 | 23 | 0.000475 | 1 | CTAATGAGGA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2280 | − | 11 | 20 | 0.000475 | 1 | GTAATGAGCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2315 | + | 26 | 35 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2318 | + | 10 | 19 | 0.000475 | 1 | TTAATGAGGA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2507 | + | 27 | 36 | 0.000475 | 1 | ATAATGACGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2541 | − | 15 | 24 | 0.000475 | 1 | ATAATGAGCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2554 | − | 28 | 37 | 0.000475 | 1 | CTAATTGGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2720 | + | 13 | 22 | 0.000475 | 1 | GTAATTGCCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2739 | + | 30 | 39 | 0.000475 | 1 | CTAATTGGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 2990 | + | 30 | 39 | 0.000475 | 1 | CTAATTAGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3042 | + | 30 | 39 | 0.000475 | 1 | TTAATTGGTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3054 | + | 15 | 24 | 0.000475 | 1 | CTAATGGAAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3133 | − | 19 | 28 | 0.000475 | 1 | TTAATGAATA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3180 | − | 12 | 21 | 0.000475 | 1 | GTAATGACGG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3261 | − | 23 | 32 | 0.000475 | 1 | ATAATGACGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3436 | + | 21 | 30 | 0.000475 | 1 | CTAATTGCAT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3545 | − | 22 | 31 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 3696 | + | 31 | 40 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4407 | − | 10 | 19 | 0.000475 | 1 | CTAATGGTGA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4597 | + | 31 | 40 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4624 | + | 21 | 30 | 0.000475 | 1 | CTAATGGTGA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 4810 | + | 6 | 15 | 0.000475 | 1 | GTAATGGCGG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5301 | − | 18 | 27 | 0.000475 | 1 | CTAATGAATA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5344 | − | 28 | 37 | 0.000475 | 1 | CTAATTACAT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5380 | + | 1 | 10 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 5771 | − | 27 | 36 | 0.000475 | 1 | CTAATGGATA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 6180 | − | 22 | 31 | 0.000475 | 1 | TTAATGGGGA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 6289 | − | 1 | 10 | 0.000475 | 1 | CTAATGAAAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 6852 | + | 31 | 40 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 7042 | + | 31 | 40 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 7699 | − | 4 | 13 | 0.000475 | 1 | TTAATTGTTC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 8237 | − | 28 | 37 | 0.000475 | 1 | CTAATGGAAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 9036 | − | 28 | 37 | 0.000475 | 1 | CTAATGGATA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 9274 | + | 31 | 40 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 9476 | − | 25 | 34 | 0.000475 | 1 | TTAATGGAAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 9630 | − | 12 | 21 | 0.000475 | 1 | GTAATGGGCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 9749 | + | 24 | 33 | 0.000475 | 1 | GTAATGGGCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 10005 | − | 17 | 26 | 0.000475 | 1 | ATAATGGCGT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 10017 | + | 31 | 40 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 11354 | + | 22 | 31 | 0.000475 | 1 | CTAATGGGGA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 12397 | + | 28 | 37 | 0.000475 | 1 | GTAATGAGCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 16195 | + | 31 | 40 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 16324 | − | 25 | 34 | 0.000475 | 1 | GTAATGGTCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 18008 | − | 26 | 35 | 0.000475 | 1 | CTAATGAAAC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 18211 | + | 31 | 40 | 0.000475 | 1 | ATAATGGTCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 25090 | + | 25 | 34 | 0.000475 | 1 | GTAATGGTCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 32445 | + | 28 | 37 | 0.000475 | 1 | GTAATGGCGG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 35111 | − | 21 | 30 | 0.000475 | 1 | CTAATGGGGA |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 6 | − | 5 | 14 | 0.000525 | 1 | TTAATTGCAG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 34 | + | 21 | 30 | 0.000525 | 1 | TTAATTAGTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 44 | + | 14 | 23 | 0.000525 | 1 | CTAATTATTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 52 | − | 5 | 14 | 0.000525 | 1 | CTAATTAGTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 54 | − | 7 | 16 | 0.000525 | 1 | TTAATTAGTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 73 | − | 2 | 11 | 0.000525 | 1 | TTAATTAACG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 75 | + | 4 | 13 | 0.000525 | 1 | TTAATTGTTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 101 | − | 12 | 21 | 0.000525 | 1 | ATAATTACCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 120 | + | 7 | 16 | 0.000525 | 1 | CTAATTAACG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 163 | − | 8 | 17 | 0.000525 | 1 | GTAATTACCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 165 | + | 28 | 37 | 0.000525 | 1 | TTAATTACAG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 165 | − | 22 | 31 | 0.000525 | 1 | TTAATTATTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 168 | − | 11 | 20 | 0.000525 | 1 | CTAATTAACG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 207 | + | 28 | 37 | 0.000525 | 1 | CTAATTACAG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 271 | + | 20 | 29 | 0.000525 | 1 | CTAATGGAAT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 275 | − | 25 | 34 | 0.000525 | 1 | GTAATTGCCT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 296 | + | 4 | 13 | 0.000525 | 1 | TTAATTGGTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 299 | − | 4 | 13 | 0.000525 | 1 | CTAATGGAAT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 338 | + | 6 | 15 | 0.000525 | 1 | ATAATGATCG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 347 | + | 13 | 22 | 0.000525 | 1 | ATAATTACCC |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 352 | − | 15 | 24 | 0.000525 | 1 | TTAATTACAG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 443 | + | 17 | 26 | 0.000525 | 1 | CTAATTGGTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 466 | + | 18 | 27 | 0.000525 | 1 | TTAATTACAG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 497 | − | 14 | 23 | 0.000525 | 1 | TTAATTGGTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 520 | + | 25 | 34 | 0.000525 | 1 | TTAATTATTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 549 | + | 25 | 34 | 0.000525 | 1 | CTAATTAGTT |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 596 | + | 26 | 35 | 0.000525 | 1 | TTAATTAACG |
| Hoxb4_2627.1.bml.pwm | 654 | − | 25 | 34 | 0.000525 | 1 | CTAATTGGTT |
Command line:
/home/yang23/programs/meme_4.9.0/bin/fimo -oc /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss9262rfqm4gmh9rme0if0o5vt294sgv86qc96oqfufpvjus0m54e1/descend -thresh 0.001 /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss9262rfqm4gmh9rme0if0o5vt294sgv86qc96oqfufpvjus0m54e1/pwm.fimo /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss9262rfqm4gmh9rme0if0o5vt294sgv86qc96oqfufpvjus0m54e1/uniprobes.descend.fasta
Settings:
| output directory = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss9262rfqm4gmh9rme0if0o5vt294sgv86qc96oqfufpvjus0m54e1/descend | MEME file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss9262rfqm4gmh9rme0if0o5vt294sgv86qc96oqfufpvjus0m54e1/pwm.fimo | sequence file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss9262rfqm4gmh9rme0if0o5vt294sgv86qc96oqfufpvjus0m54e1/uniprobes.descend.fasta |
| allow clobber = true | compute q-values = true | text only = false |
| scan both strands = true | max sequence length = 250000000 | output threshold = 0.001 |
| threshold type = p-value | max stored scores = 100000 | pseudocount = 0.1 |
| verbosity = 2 |
This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.