| Database and Motifs | High-scoring Motif Occurences | Debugging Information |
FIMO version 4.9.0, (Release date: 6 EST 20)
For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net
If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble,
"FIMO: Scanning for occurrences of a given motif",
Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011.
DATABASE
/srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss6lth2k4lcpdmdicqqa2k011hsut1e9ogfb4j96baf8te7bpo3k01/uniprobes.shuffled.fasta
Database contains
41925
sequences,
2515500
residues
MOTIFS /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss6lth2k4lcpdmdicqqa2k011hsut1e9ogfb4j96baf8te7bpo3k01/pwm.fimo (nucleotide)
| MOTIF | WIDTH | BEST POSSIBLE MATCH |
|---|---|---|
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 10 | GTTAATTGGT |
Random model letter frequencies
(from non-redundant database):
A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275
| Motif | Sequence Name | Strand | Start | End | p-value | q-value | Matched Sequence |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 29526 | + | 25 | 34 | 9.09e-07 | 1 | GCTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 40340 | + | 12 | 21 | 9.09e-07 | 1 | GCTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18172 | − | 25 | 34 | 3.83e-06 | 1 | CCTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 24377 | + | 15 | 24 | 3.83e-06 | 1 | GCTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26352 | + | 9 | 18 | 3.83e-06 | 1 | GCTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 28406 | − | 4 | 13 | 3.83e-06 | 1 | GCTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 34912 | + | 7 | 16 | 3.83e-06 | 1 | CCTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 36603 | − | 5 | 14 | 3.83e-06 | 1 | GCTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 1582 | + | 26 | 35 | 8.06e-06 | 1 | GCTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 7286 | − | 22 | 31 | 8.06e-06 | 1 | GTTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 7682 | − | 3 | 12 | 8.06e-06 | 1 | CCTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 22571 | − | 28 | 37 | 8.06e-06 | 1 | CCTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 25965 | + | 1 | 10 | 8.06e-06 | 1 | GCTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26353 | − | 28 | 37 | 8.06e-06 | 1 | CCTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 28105 | + | 16 | 25 | 8.06e-06 | 1 | CCTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30623 | − | 7 | 16 | 8.06e-06 | 1 | GCTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 34559 | + | 11 | 20 | 8.06e-06 | 1 | CCTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 37236 | + | 11 | 20 | 8.06e-06 | 1 | GTTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 39557 | − | 3 | 12 | 8.06e-06 | 1 | CCTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 5963 | + | 3 | 12 | 1.47e-05 | 1 | GTTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 6003 | + | 3 | 12 | 1.47e-05 | 1 | GTTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 11113 | + | 12 | 21 | 1.47e-05 | 1 | GATAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 12210 | + | 2 | 11 | 1.47e-05 | 1 | GCTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 13987 | + | 27 | 36 | 1.47e-05 | 1 | GCTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 14197 | + | 11 | 20 | 1.47e-05 | 1 | CTTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 21543 | − | 6 | 15 | 1.47e-05 | 1 | CCTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 22755 | − | 21 | 30 | 1.47e-05 | 1 | GTTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 25457 | − | 6 | 15 | 1.47e-05 | 1 | GTTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 28328 | − | 15 | 24 | 1.47e-05 | 1 | GCTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 33389 | − | 4 | 13 | 1.47e-05 | 1 | GATAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 36505 | + | 13 | 22 | 1.47e-05 | 1 | CCTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38965 | − | 28 | 37 | 1.47e-05 | 1 | CTTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 41774 | − | 25 | 34 | 1.47e-05 | 1 | CTTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 3819 | + | 8 | 17 | 2.48e-05 | 1 | CTTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 4174 | + | 8 | 17 | 2.48e-05 | 1 | GCTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 11794 | + | 17 | 26 | 2.48e-05 | 1 | GTTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 13470 | + | 23 | 32 | 2.48e-05 | 1 | GATAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 16819 | − | 24 | 33 | 2.48e-05 | 1 | CCTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 20330 | + | 10 | 19 | 2.48e-05 | 1 | GATAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 21293 | − | 10 | 19 | 2.48e-05 | 1 | GGTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 21447 | − | 20 | 29 | 2.48e-05 | 1 | GTTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26668 | + | 10 | 19 | 2.48e-05 | 1 | CCTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26871 | + | 16 | 25 | 2.48e-05 | 1 | CTTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 27000 | − | 8 | 17 | 2.48e-05 | 1 | GCTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 27061 | − | 11 | 20 | 2.48e-05 | 1 | GATAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 28399 | − | 6 | 15 | 2.48e-05 | 1 | CTTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 32816 | + | 11 | 20 | 2.48e-05 | 1 | CATAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 33098 | + | 3 | 12 | 2.48e-05 | 1 | GGTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 36495 | − | 13 | 22 | 2.48e-05 | 1 | CTTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 36823 | − | 22 | 31 | 2.48e-05 | 1 | GATAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 40167 | − | 17 | 26 | 2.48e-05 | 1 | CATAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 399 | − | 12 | 21 | 3.71e-05 | 1 | GGTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 609 | + | 4 | 13 | 3.71e-05 | 1 | CATAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 2789 | + | 5 | 14 | 3.71e-05 | 1 | GGTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 3106 | − | 10 | 19 | 3.71e-05 | 1 | CCTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 3511 | − | 27 | 36 | 3.71e-05 | 1 | TCTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 4267 | − | 28 | 37 | 3.71e-05 | 1 | CTTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 5143 | − | 26 | 35 | 3.71e-05 | 1 | CTTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 8655 | + | 23 | 32 | 3.71e-05 | 1 | GCTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 9327 | − | 23 | 32 | 3.71e-05 | 1 | GATAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 9719 | − | 9 | 18 | 3.71e-05 | 1 | CATAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 11039 | + | 28 | 37 | 3.71e-05 | 1 | GTTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 14330 | − | 13 | 22 | 3.71e-05 | 1 | CGTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 14893 | + | 27 | 36 | 3.71e-05 | 1 | CGTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 15052 | − | 6 | 15 | 3.71e-05 | 1 | CATAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 15446 | + | 29 | 38 | 3.71e-05 | 1 | CATAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17078 | − | 26 | 35 | 3.71e-05 | 1 | GGTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 21481 | + | 23 | 32 | 3.71e-05 | 1 | GATAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 22913 | − | 1 | 10 | 3.71e-05 | 1 | CTTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23047 | − | 23 | 32 | 3.71e-05 | 1 | GCTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 28887 | + | 2 | 11 | 3.71e-05 | 1 | CGTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31105 | + | 14 | 23 | 3.71e-05 | 1 | GGTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31815 | + | 7 | 16 | 3.71e-05 | 1 | CTTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 32924 | − | 2 | 11 | 3.71e-05 | 1 | TCTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 33490 | + | 22 | 31 | 3.71e-05 | 1 | GTTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 34920 | + | 22 | 31 | 3.71e-05 | 1 | CCTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 34975 | + | 3 | 12 | 3.71e-05 | 1 | CATAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 35799 | + | 12 | 21 | 3.71e-05 | 1 | TCTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38983 | − | 15 | 24 | 3.71e-05 | 1 | GTTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 40420 | − | 1 | 10 | 3.71e-05 | 1 | GGTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 2313 | + | 1 | 10 | 4.96e-05 | 1 | GATAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 5039 | − | 26 | 35 | 4.96e-05 | 1 | TCTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 6108 | − | 14 | 23 | 4.96e-05 | 1 | CGTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 6504 | − | 10 | 19 | 4.96e-05 | 1 | TCTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 7139 | − | 3 | 12 | 4.96e-05 | 1 | CTTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 9004 | − | 1 | 10 | 4.96e-05 | 1 | TCTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 11129 | + | 28 | 37 | 4.96e-05 | 1 | GTTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 11547 | + | 7 | 16 | 4.96e-05 | 1 | GTTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 12978 | − | 28 | 37 | 4.96e-05 | 1 | CTTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 13714 | + | 20 | 29 | 4.96e-05 | 1 | GCTAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 16041 | + | 27 | 36 | 4.96e-05 | 1 | CGTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 16186 | + | 20 | 29 | 4.96e-05 | 1 | CGTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18105 | − | 19 | 28 | 4.96e-05 | 1 | CATAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 19611 | − | 18 | 27 | 4.96e-05 | 1 | GCTAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 20228 | − | 18 | 27 | 4.96e-05 | 1 | CGTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 22104 | − | 16 | 25 | 4.96e-05 | 1 | GGTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26613 | − | 8 | 17 | 4.96e-05 | 1 | GATAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 27713 | + | 5 | 14 | 4.96e-05 | 1 | GGTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 27818 | + | 6 | 15 | 4.96e-05 | 1 | CCTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 27905 | + | 27 | 36 | 4.96e-05 | 1 | CATAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 29601 | + | 26 | 35 | 4.96e-05 | 1 | GATAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 29711 | + | 2 | 11 | 4.96e-05 | 1 | CATAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30424 | + | 2 | 11 | 4.96e-05 | 1 | CGTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 34207 | − | 24 | 33 | 4.96e-05 | 1 | GTTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 35455 | + | 10 | 19 | 4.96e-05 | 1 | TCTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 35928 | − | 14 | 23 | 4.96e-05 | 1 | CCTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 37593 | + | 6 | 15 | 4.96e-05 | 1 | TCTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38563 | + | 7 | 16 | 4.96e-05 | 1 | CTTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 884 | − | 12 | 21 | 6.12e-05 | 1 | ACTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 2356 | − | 29 | 38 | 6.12e-05 | 1 | ACTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 7701 | + | 22 | 31 | 6.12e-05 | 1 | CGTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 16732 | − | 20 | 29 | 6.12e-05 | 1 | CTTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17394 | − | 26 | 35 | 6.12e-05 | 1 | TCTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18173 | + | 27 | 36 | 6.12e-05 | 1 | TCTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18255 | + | 20 | 29 | 6.12e-05 | 1 | GATAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 20926 | + | 13 | 22 | 6.12e-05 | 1 | CCTAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 21472 | − | 1 | 10 | 6.12e-05 | 1 | TCTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 21594 | − | 20 | 29 | 6.12e-05 | 1 | GGTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 22047 | − | 5 | 14 | 6.12e-05 | 1 | CGTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 22213 | − | 15 | 24 | 6.12e-05 | 1 | GTTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23470 | − | 29 | 38 | 6.12e-05 | 1 | ACTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23526 | − | 11 | 20 | 6.12e-05 | 1 | TTTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 25226 | + | 2 | 11 | 6.12e-05 | 1 | TCTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 25510 | + | 7 | 16 | 6.12e-05 | 1 | ACTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 25797 | + | 28 | 37 | 6.12e-05 | 1 | GGTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 27038 | + | 16 | 25 | 6.12e-05 | 1 | CTTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30096 | + | 5 | 14 | 6.12e-05 | 1 | GTTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30917 | − | 2 | 11 | 6.12e-05 | 1 | CCTAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31008 | − | 14 | 23 | 6.12e-05 | 1 | CATAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 32124 | + | 28 | 37 | 6.12e-05 | 1 | GGTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 32495 | − | 27 | 36 | 6.12e-05 | 1 | CCTAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 34042 | + | 10 | 19 | 6.12e-05 | 1 | CATAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 36453 | − | 25 | 34 | 6.12e-05 | 1 | GGTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38066 | + | 24 | 33 | 6.12e-05 | 1 | TTTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 39589 | − | 7 | 16 | 6.12e-05 | 1 | GATAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 40549 | + | 28 | 37 | 6.12e-05 | 1 | GGTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 373 | + | 3 | 12 | 7.6e-05 | 1 | TCTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 710 | + | 10 | 19 | 7.6e-05 | 1 | GATAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 789 | − | 9 | 18 | 7.6e-05 | 1 | GTTAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 2550 | − | 1 | 10 | 7.6e-05 | 1 | CTTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 3983 | + | 16 | 25 | 7.6e-05 | 1 | ACTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 11233 | − | 16 | 25 | 7.6e-05 | 1 | TCTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 11248 | + | 12 | 21 | 7.6e-05 | 1 | CGTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 14179 | − | 4 | 13 | 7.6e-05 | 1 | TTTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 14852 | − | 11 | 20 | 7.6e-05 | 1 | TATAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 14920 | − | 29 | 38 | 7.6e-05 | 1 | ACTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 16571 | + | 11 | 20 | 7.6e-05 | 1 | TTTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17009 | − | 11 | 20 | 7.6e-05 | 1 | GGTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17020 | − | 13 | 22 | 7.6e-05 | 1 | ACTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18575 | − | 7 | 16 | 7.6e-05 | 1 | TTTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18803 | + | 14 | 23 | 7.6e-05 | 1 | CTTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 19638 | + | 29 | 38 | 7.6e-05 | 1 | TTTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 20371 | + | 26 | 35 | 7.6e-05 | 1 | TTTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 20698 | + | 1 | 10 | 7.6e-05 | 1 | TTTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 21712 | + | 29 | 38 | 7.6e-05 | 1 | ACTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 22670 | − | 13 | 22 | 7.6e-05 | 1 | CGTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 24555 | + | 28 | 37 | 7.6e-05 | 1 | TCTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26043 | − | 29 | 38 | 7.6e-05 | 1 | ACTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26749 | + | 17 | 26 | 7.6e-05 | 1 | GGTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 28428 | − | 14 | 23 | 7.6e-05 | 1 | ACTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 33169 | + | 28 | 37 | 7.6e-05 | 1 | CATAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 33250 | + | 21 | 30 | 7.6e-05 | 1 | ACTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 33257 | − | 14 | 23 | 7.6e-05 | 1 | GATAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 33552 | + | 13 | 22 | 7.6e-05 | 1 | TATAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 34307 | − | 29 | 38 | 7.6e-05 | 1 | ACTAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 34444 | + | 6 | 15 | 7.6e-05 | 1 | GTTAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 34853 | − | 26 | 35 | 7.6e-05 | 1 | CTTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38208 | − | 7 | 16 | 7.6e-05 | 1 | CATAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 40383 | − | 6 | 15 | 7.6e-05 | 1 | CATAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 2413 | + | 18 | 27 | 9.38e-05 | 1 | GCTAATTAGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 2413 | − | 18 | 27 | 9.38e-05 | 1 | GCTAATTAGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 3474 | − | 3 | 12 | 9.38e-05 | 1 | ATTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 4348 | + | 3 | 12 | 9.38e-05 | 1 | GGTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 4523 | + | 6 | 15 | 9.38e-05 | 1 | CTTAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 5274 | + | 20 | 29 | 9.38e-05 | 1 | TATAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 6188 | + | 8 | 17 | 9.38e-05 | 1 | CGTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 6682 | + | 15 | 24 | 9.38e-05 | 1 | TATAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 11727 | + | 23 | 32 | 9.38e-05 | 1 | GCTAATTGAC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 12353 | + | 10 | 19 | 9.38e-05 | 1 | TTTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 12590 | − | 24 | 33 | 9.38e-05 | 1 | GCTAATTGAC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 13136 | + | 13 | 22 | 9.38e-05 | 1 | TGTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 14705 | + | 6 | 15 | 9.38e-05 | 1 | GATAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17680 | − | 17 | 26 | 9.38e-05 | 1 | ACTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18085 | − | 9 | 18 | 9.38e-05 | 1 | CTTAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18637 | − | 3 | 12 | 9.38e-05 | 1 | TTTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 21259 | + | 20 | 29 | 9.38e-05 | 1 | ACTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 22971 | − | 4 | 13 | 9.38e-05 | 1 | TATAATTGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23958 | − | 22 | 31 | 9.38e-05 | 1 | TCTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 24751 | − | 9 | 18 | 9.38e-05 | 1 | CATAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 28338 | − | 23 | 32 | 9.38e-05 | 1 | GATAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 29925 | − | 3 | 12 | 9.38e-05 | 1 | CGTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30335 | + | 17 | 26 | 9.38e-05 | 1 | CATAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30467 | − | 10 | 19 | 9.38e-05 | 1 | GGTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30691 | − | 29 | 38 | 9.38e-05 | 1 | ACTAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30986 | − | 28 | 37 | 9.38e-05 | 1 | CGTAATTGCG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31770 | + | 24 | 33 | 9.38e-05 | 1 | ATTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 33887 | − | 4 | 13 | 9.38e-05 | 1 | TGTAATTGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 36082 | − | 22 | 31 | 9.38e-05 | 1 | TATAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38062 | + | 10 | 19 | 9.38e-05 | 1 | TCTAATTGCG |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 4896 | − | 7 | 16 | 0.000117 | 1 | TCTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 6092 | + | 12 | 21 | 0.000117 | 1 | CATAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 6771 | + | 20 | 29 | 0.000117 | 1 | TATAATTGCT |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 14375 | + | 16 | 25 | 0.000117 | 1 | CGTAATTGGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 15325 | − | 6 | 15 | 0.000117 | 1 | ATTAATTGCC |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38706 | + | 15 | 24 | 0.000117 | 1 | TGTAATTGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38846 | − | 23 | 32 | 0.000117 | 1 | GGTAATTGCA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38938 | + | 29 | 38 | 0.000117 | 1 | GCTAATTAGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 39749 | + | 18 | 27 | 0.000117 | 1 | TTTAATTGGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 40203 | − | 11 | 20 | 0.000117 | 1 | TATAATTGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 41017 | − | 15 | 24 | 0.000117 | 1 | CATAATTGCA |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 12299 | − | 24 | 33 | 0.00014 | 1 | TCTAATTGCA |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26118 | + | 12 | 21 | 0.00014 | 1 | ATTAATTGCT |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 29711 | + | 23 | 32 | 0.000202 | 1 | CATAATTGAC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 29805 | + | 8 | 17 | 0.000202 | 1 | ACTAATTGCA |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23738 | − | 13 | 22 | 0.000239 | 1 | GCTAATTGAA |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 14097 | + | 5 | 14 | 0.000344 | 1 | CTTAATTGAA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 14959 | + | 4 | 13 | 0.000344 | 1 | ACTAATTGTC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 15025 | + | 10 | 19 | 0.000344 | 1 | ACTAATTAGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 15025 | − | 10 | 19 | 0.000344 | 1 | ACTAATTAGT |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 2052 | − | 28 | 37 | 0.000383 | 1 | CTTAATTACA |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 40031 | + | 14 | 23 | 0.000383 | 1 | TATAATTACC |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 40518 | + | 19 | 28 | 0.000383 | 1 | TATAATTAGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 40680 | − | 11 | 20 | 0.000383 | 1 | TATAATTGAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 41781 | + | 1 | 10 | 0.000383 | 1 | CGTAATTACG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 41781 | − | 1 | 10 | 0.000383 | 1 | CGTAATTACG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 41894 | − | 22 | 31 | 0.000383 | 1 | ACTAATTACT |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 1275 | − | 3 | 12 | 0.000426 | 1 | TGTAATTAGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 1517 | − | 5 | 14 | 0.000426 | 1 | ACTAATTAGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 1810 | + | 29 | 38 | 0.000426 | 1 | TGTAATTAGT |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 5639 | + | 26 | 35 | 0.000426 | 1 | TGTAATTGAT |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 8717 | + | 1 | 10 | 0.000426 | 1 | TGTAATTGAT |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 10962 | + | 26 | 35 | 0.000426 | 1 | TGTAATTACC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 10962 | − | 26 | 35 | 0.000426 | 1 | GGTAATTACA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 10977 | + | 20 | 29 | 0.000426 | 1 | ATTAATTAGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 11189 | + | 6 | 15 | 0.000426 | 1 | ACTAATTAGG |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 13339 | + | 1 | 10 | 0.000426 | 1 | TCTAATTAGA |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 13358 | − | 4 | 13 | 0.000426 | 1 | GCTAATTAAT |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26406 | + | 30 | 39 | 0.000426 | 1 | ATTAATTGTC |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 29364 | + | 30 | 39 | 0.000426 | 1 | ATTAATTGTC |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 10484 | + | 6 | 15 | 0.000465 | 1 | AGTAATTGAC |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 32486 | − | 21 | 30 | 0.000465 | 1 | CGTAATTACA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 33232 | + | 23 | 32 | 0.000465 | 1 | TATAATTAGG |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 35101 | − | 9 | 18 | 0.000465 | 1 | AGTAATTGAC |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 40058 | + | 4 | 13 | 0.000465 | 1 | GCTAATTATT |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 1278 | − | 11 | 20 | 0.000502 | 1 | ATTAATTAGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 2203 | + | 22 | 31 | 0.000502 | 1 | AGTAATTGTC |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 4589 | − | 25 | 34 | 0.000502 | 1 | AGTAATTAGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 5299 | − | 29 | 38 | 0.000502 | 1 | ACTAATTAGA |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 6801 | + | 16 | 25 | 0.000502 | 1 | AGTAATTACC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 7014 | − | 16 | 25 | 0.000502 | 1 | ACTAATTAGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 8051 | − | 25 | 34 | 0.000502 | 1 | GTTAATTAAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 10055 | − | 23 | 32 | 0.000502 | 1 | AATAATTACT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 10762 | + | 21 | 30 | 0.000502 | 1 | TTTAATTGAA |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 13905 | − | 25 | 34 | 0.000502 | 1 | TTTAATTGAA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 15599 | − | 9 | 18 | 0.000502 | 1 | AGTAATTACC |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17518 | + | 27 | 36 | 0.000502 | 1 | CCTAATTATT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17639 | + | 27 | 36 | 0.000502 | 1 | GATAATTAAC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17639 | − | 27 | 36 | 0.000502 | 1 | GTTAATTATC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17708 | − | 29 | 38 | 0.000502 | 1 | ACTAATTAGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18816 | + | 2 | 11 | 0.000502 | 1 | GCTAATGGGC |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 22615 | + | 30 | 39 | 0.000502 | 1 | AGTAATTGTC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 22681 | − | 6 | 15 | 0.000502 | 1 | ACTAATTGAA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23219 | + | 14 | 23 | 0.000502 | 1 | TGTAATTGAG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23251 | − | 14 | 23 | 0.000502 | 1 | AGTAATTGTC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23832 | − | 22 | 31 | 0.000502 | 1 | GCTAATGGGC |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 25662 | − | 2 | 11 | 0.000502 | 1 | GTTAATTATC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 25697 | + | 16 | 25 | 0.000502 | 1 | TTTAATTAGA |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 29009 | − | 25 | 34 | 0.000502 | 1 | TGTAATTAGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 29325 | + | 24 | 33 | 0.000502 | 1 | ATTAATTGAG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 29756 | + | 15 | 24 | 0.000502 | 1 | ACTAATTGAA |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31180 | + | 26 | 35 | 0.000502 | 1 | AGTAATTGAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31537 | + | 21 | 30 | 0.000502 | 1 | GTTAATTAAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 32447 | − | 28 | 37 | 0.000502 | 1 | CTTAATTAAC |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 35125 | + | 21 | 30 | 0.000502 | 1 | ACTAATTAGA |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 4625 | − | 18 | 27 | 0.000544 | 1 | CCTAATGGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 4635 | − | 5 | 14 | 0.000544 | 1 | CATAATTAAC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 5528 | − | 28 | 37 | 0.000544 | 1 | CTTAATTAAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 6696 | + | 25 | 34 | 0.000544 | 1 | GATAATTAAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 7898 | − | 13 | 22 | 0.000544 | 1 | AATAATTGAG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 8278 | + | 10 | 19 | 0.000544 | 1 | GCTAATGGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 8728 | + | 4 | 13 | 0.000544 | 1 | CTTAATTAAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 8992 | + | 15 | 24 | 0.000544 | 1 | TATAATTAGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 9932 | − | 18 | 27 | 0.000544 | 1 | GTTAATTATT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 10549 | + | 24 | 33 | 0.000544 | 1 | GTTAATTATT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 10586 | + | 3 | 12 | 0.000544 | 1 | AATAATTGAG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 10633 | + | 12 | 21 | 0.000544 | 1 | CCTAATTAAG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 12656 | + | 26 | 35 | 0.000544 | 1 | GATAATTATC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 12656 | − | 26 | 35 | 0.000544 | 1 | GATAATTATC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 13701 | + | 28 | 37 | 0.000544 | 1 | AATAATTGAG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 15563 | − | 6 | 15 | 0.000544 | 1 | CCTAATTAAG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17137 | + | 29 | 38 | 0.000544 | 1 | GCTAATGGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17213 | − | 10 | 19 | 0.000544 | 1 | CTTAATTAAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17518 | − | 27 | 36 | 0.000544 | 1 | AATAATTAGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18261 | + | 22 | 31 | 0.000544 | 1 | CCTAATGGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18599 | + | 25 | 34 | 0.000544 | 1 | TGTAATTGTG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18613 | − | 4 | 13 | 0.000544 | 1 | TTTAATTACA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18624 | − | 29 | 38 | 0.000544 | 1 | ACTAATTACA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18654 | + | 4 | 13 | 0.000544 | 1 | ATTAATTGTG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 19187 | − | 29 | 38 | 0.000544 | 1 | ACTAATTACA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 19295 | + | 9 | 18 | 0.000544 | 1 | AGTAATTGTT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 19920 | + | 11 | 20 | 0.000544 | 1 | ACTAATTGTA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 19962 | + | 5 | 14 | 0.000544 | 1 | TTTAATTGTA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 20087 | − | 16 | 25 | 0.000544 | 1 | AATAATTAGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 24350 | − | 6 | 15 | 0.000544 | 1 | TATAATTAGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 25983 | + | 18 | 27 | 0.000544 | 1 | AGTAATTACT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 25983 | − | 18 | 27 | 0.000544 | 1 | AGTAATTACT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26471 | − | 19 | 28 | 0.000544 | 1 | ATTAATTACG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26710 | − | 4 | 13 | 0.000544 | 1 | GGTAATTAAC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26907 | − | 17 | 26 | 0.000544 | 1 | TGTAATTACG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 27248 | − | 12 | 21 | 0.000544 | 1 | AGTAATTGTT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 28314 | + | 28 | 37 | 0.000544 | 1 | ATTAATTGTG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 28687 | + | 1 | 10 | 0.000544 | 1 | GATAATTATC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 28687 | − | 1 | 10 | 0.000544 | 1 | GATAATTATC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30229 | + | 17 | 26 | 0.000544 | 1 | TTTAATTACA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30875 | − | 9 | 18 | 0.000544 | 1 | ATTAATTGTG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31231 | − | 11 | 20 | 0.000544 | 1 | TATAATTGAA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31403 | − | 23 | 32 | 0.000544 | 1 | ACTAATTGTA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31466 | − | 5 | 14 | 0.000544 | 1 | TTTAATTGTA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31528 | + | 24 | 33 | 0.000544 | 1 | GCTAATTATG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31717 | + | 11 | 20 | 0.000544 | 1 | ATTAATTACG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 31928 | + | 9 | 18 | 0.000544 | 1 | GCTAATTTGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 32486 | + | 21 | 30 | 0.000544 | 1 | TGTAATTACG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 33236 | + | 7 | 16 | 0.000544 | 1 | GGTAATTAAC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 34857 | − | 19 | 28 | 0.000544 | 1 | GCTAATTATG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 36287 | + | 21 | 30 | 0.000544 | 1 | CATAATTAAC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 36514 | − | 5 | 14 | 0.000544 | 1 | GCTAATTTGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38055 | − | 21 | 30 | 0.000544 | 1 | GCTAATGGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38412 | + | 25 | 34 | 0.000544 | 1 | GCTAATGGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38509 | + | 20 | 29 | 0.000544 | 1 | CTTAATTATC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38703 | + | 5 | 14 | 0.000544 | 1 | TATAATTGAA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 38823 | − | 4 | 13 | 0.000544 | 1 | ACTAATTACA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 39167 | − | 23 | 32 | 0.000544 | 1 | GCTAATGGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 39400 | − | 16 | 25 | 0.000544 | 1 | GATAATTAAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 39646 | + | 26 | 35 | 0.000544 | 1 | AATAATTAGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 41 | + | 6 | 15 | 0.000587 | 1 | GCTAATTAAA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 788 | − | 9 | 18 | 0.000587 | 1 | AATAATTACG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 1227 | + | 8 | 17 | 0.000587 | 1 | CCTAATGGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 1376 | − | 22 | 31 | 0.000587 | 1 | ATTAATTAGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 1661 | − | 22 | 31 | 0.000587 | 1 | CCTAATTATG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 1742 | + | 19 | 28 | 0.000587 | 1 | AGTAATTGAG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 2752 | − | 25 | 34 | 0.000587 | 1 | GCTAATGGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 3063 | − | 6 | 15 | 0.000587 | 1 | CATAATTATC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 3279 | − | 26 | 35 | 0.000587 | 1 | GCTAATTTGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 3320 | + | 11 | 20 | 0.000587 | 1 | GGTAATTATC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 3732 | + | 6 | 15 | 0.000587 | 1 | CATAATTAAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 5002 | − | 4 | 13 | 0.000587 | 1 | TGTAATTGAA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 5939 | + | 14 | 23 | 0.000587 | 1 | CCTAATTTGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 6638 | − | 2 | 11 | 0.000587 | 1 | TATAATTACA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 7221 | − | 18 | 27 | 0.000587 | 1 | AGTAATTGAG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 7361 | − | 21 | 30 | 0.000587 | 1 | CCTAATTATG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 7513 | + | 5 | 14 | 0.000587 | 1 | CCTAATGGGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 7687 | + | 9 | 18 | 0.000587 | 1 | AGTAATTAGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 10197 | + | 16 | 25 | 0.000587 | 1 | AATAATTGTG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 11166 | − | 11 | 20 | 0.000587 | 1 | AGTAATTAGG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 11896 | − | 25 | 34 | 0.000587 | 1 | CCTAATGGCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 13988 | + | 10 | 19 | 0.000587 | 1 | CATAATTATC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 14626 | + | 8 | 17 | 0.000587 | 1 | ATTAATTAGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 15066 | + | 20 | 29 | 0.000587 | 1 | GGTAATTAAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 16205 | + | 13 | 22 | 0.000587 | 1 | GGTAATTATC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 16581 | − | 26 | 35 | 0.000587 | 1 | AATAATTGTG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 17640 | + | 19 | 28 | 0.000587 | 1 | GATAATTATT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 18544 | + | 22 | 31 | 0.000587 | 1 | TGTAATTAGA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 19092 | + | 11 | 20 | 0.000587 | 1 | TATAATTGTA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 20082 | + | 24 | 33 | 0.000587 | 1 | CGTAATTAAC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 20278 | − | 18 | 27 | 0.000587 | 1 | CATAATTAAT |
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| Msx3_3206.1.bml.pwm | 21519 | − | 10 | 19 | 0.000587 | 1 | GGTAATTAAT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23046 | + | 10 | 19 | 0.000587 | 1 | TGTAATTGAA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23102 | − | 14 | 23 | 0.000587 | 1 | GCTAATTAAA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23379 | − | 14 | 23 | 0.000587 | 1 | GCTAATTTCC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 23568 | − | 21 | 30 | 0.000587 | 1 | CGTAATTAAC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 24199 | − | 1 | 10 | 0.000587 | 1 | GCTAATTTGT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 24723 | − | 1 | 10 | 0.000587 | 1 | AATAATTGTG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 24763 | + | 13 | 22 | 0.000587 | 1 | ATTAATTGAA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 26761 | + | 12 | 21 | 0.000587 | 1 | TATAATTACA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 27236 | + | 15 | 24 | 0.000587 | 1 | GCTAATGGCT |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 28723 | + | 18 | 27 | 0.000587 | 1 | GTTAATTAAG |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 29079 | − | 27 | 36 | 0.000587 | 1 | TATAATTACA |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30104 | − | 12 | 21 | 0.000587 | 1 | GTTAATGGGC |
| Msx3_3206.1.bml.pwm | 30328 | − | 20 | 29 | 0.000587 | 1 | TCTAATTAAC |
Command line:
/home/yang23/programs/meme_4.9.0/bin/fimo -oc /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss6lth2k4lcpdmdicqqa2k011hsut1e9ogfb4j96baf8te7bpo3k01/shuffled -thresh 0.001 /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss6lth2k4lcpdmdicqqa2k011hsut1e9ogfb4j96baf8te7bpo3k01/pwm.fimo /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss6lth2k4lcpdmdicqqa2k011hsut1e9ogfb4j96baf8te7bpo3k01/uniprobes.shuffled.fasta
Settings:
| output directory = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss6lth2k4lcpdmdicqqa2k011hsut1e9ogfb4j96baf8te7bpo3k01/shuffled | MEME file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss6lth2k4lcpdmdicqqa2k011hsut1e9ogfb4j96baf8te7bpo3k01/pwm.fimo | sequence file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss6lth2k4lcpdmdicqqa2k011hsut1e9ogfb4j96baf8te7bpo3k01/uniprobes.shuffled.fasta |
| allow clobber = true | compute q-values = true | text only = false |
| scan both strands = true | max sequence length = 250000000 | output threshold = 0.001 |
| threshold type = p-value | max stored scores = 100000 | pseudocount = 0.1 |
| verbosity = 2 |
This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.