| Database and Motifs | High-scoring Motif Occurences | Debugging Information |
FIMO version 4.9.0, (Release date: 6 EST 20)
For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net
If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble,
"FIMO: Scanning for occurrences of a given motif",
Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011.
DATABASE
/srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssupbf4didobvura4b233fotkaen07l1r01or4drk5jok3k5rb5ki0/uniprobes.descend.fasta
Database contains
41636
sequences,
2498160
residues
MOTIFS /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssupbf4didobvura4b233fotkaen07l1r01or4drk5jok3k5rb5ki0/pwm.fimo (nucleotide)
| MOTIF | WIDTH | BEST POSSIBLE MATCH |
|---|---|---|
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 10 | GTTAATTACC |
Random model letter frequencies
(from non-redundant database):
A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275
| Motif | Sequence Name | Strand | Start | End | p-value | q-value | Matched Sequence |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 87 | − | 5 | 14 | 3.67e-06 | 1 | GCTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 233 | − | 1 | 10 | 3.67e-06 | 1 | GCTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 238 | − | 15 | 24 | 3.67e-06 | 1 | GCTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 480 | + | 15 | 24 | 3.67e-06 | 1 | GCTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 579 | − | 5 | 14 | 3.67e-06 | 1 | GCTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 713 | + | 19 | 28 | 3.67e-06 | 1 | GCTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2499 | − | 26 | 35 | 3.67e-06 | 1 | GCTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3162 | − | 21 | 30 | 3.67e-06 | 1 | GCTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4305 | + | 25 | 34 | 3.67e-06 | 1 | GCTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 10 | + | 18 | 27 | 7.34e-06 | 1 | GCTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 10 | − | 18 | 27 | 7.34e-06 | 1 | GCTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 117 | + | 2 | 11 | 7.34e-06 | 1 | GCTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 256 | + | 1 | 10 | 7.34e-06 | 1 | GCTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 431 | − | 19 | 28 | 7.34e-06 | 1 | GCTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1975 | + | 12 | 21 | 7.34e-06 | 1 | GCTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3052 | + | 26 | 35 | 7.34e-06 | 1 | GCTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4130 | + | 27 | 36 | 7.34e-06 | 1 | GCTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6283 | + | 25 | 34 | 7.34e-06 | 1 | GCTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 7292 | − | 22 | 31 | 7.34e-06 | 1 | GCTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 177 | − | 1 | 10 | 1.1e-05 | 1 | CCTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 249 | + | 11 | 20 | 1.1e-05 | 1 | CCTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 259 | − | 3 | 12 | 1.1e-05 | 1 | CCTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 493 | + | 24 | 33 | 1.1e-05 | 1 | CCTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 963 | − | 3 | 12 | 1.1e-05 | 1 | CCTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1046 | − | 28 | 37 | 1.1e-05 | 1 | CCTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1682 | + | 19 | 28 | 1.1e-05 | 1 | CCTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1914 | + | 8 | 17 | 1.1e-05 | 1 | CCTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4232 | − | 26 | 35 | 1.1e-05 | 1 | CCTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 19278 | − | 28 | 37 | 1.1e-05 | 1 | CCTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 28414 | − | 25 | 34 | 1.1e-05 | 1 | CCTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 190 | + | 8 | 17 | 1.47e-05 | 1 | CCTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 702 | + | 7 | 16 | 1.47e-05 | 1 | CCTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1010 | + | 23 | 32 | 1.47e-05 | 1 | CCTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1034 | + | 13 | 22 | 1.47e-05 | 1 | CCTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1524 | − | 25 | 34 | 1.47e-05 | 1 | CCTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4836 | − | 18 | 27 | 1.47e-05 | 1 | CCTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5594 | + | 26 | 35 | 1.47e-05 | 1 | CCTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 7134 | − | 27 | 36 | 1.47e-05 | 1 | CCTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 9807 | + | 22 | 31 | 1.47e-05 | 1 | CCTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1 | + | 4 | 13 | 1.91e-05 | 1 | GTTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 34 | + | 7 | 16 | 1.91e-05 | 1 | GTTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 45 | − | 7 | 16 | 1.91e-05 | 1 | GTTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 123 | + | 3 | 12 | 1.91e-05 | 1 | GTTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 266 | − | 6 | 15 | 1.91e-05 | 1 | GTTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 497 | − | 21 | 30 | 1.91e-05 | 1 | GTTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1004 | − | 22 | 31 | 1.91e-05 | 1 | GTTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1120 | + | 7 | 16 | 1.91e-05 | 1 | GTTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 9 | − | 6 | 15 | 2.36e-05 | 1 | GTTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 67 | − | 3 | 12 | 2.36e-05 | 1 | GTTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 533 | + | 11 | 20 | 2.36e-05 | 1 | GTTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 738 | + | 24 | 33 | 2.36e-05 | 1 | GTTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 846 | − | 12 | 21 | 2.36e-05 | 1 | GTTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 894 | + | 10 | 19 | 2.36e-05 | 1 | GTTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3233 | + | 22 | 31 | 2.36e-05 | 1 | GTTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 7976 | − | 22 | 31 | 2.36e-05 | 1 | GTTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 7 | + | 5 | 14 | 3.26e-05 | 1 | CTTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 33 | + | 1 | 10 | 3.26e-05 | 1 | GCTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 62 | − | 9 | 18 | 3.26e-05 | 1 | CTTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 119 | + | 11 | 20 | 3.26e-05 | 1 | CTTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 218 | − | 16 | 25 | 3.26e-05 | 1 | CTTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 301 | + | 13 | 22 | 3.26e-05 | 1 | GCTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 338 | + | 16 | 25 | 3.26e-05 | 1 | CTTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 400 | − | 7 | 16 | 3.26e-05 | 1 | GCTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 416 | − | 13 | 22 | 3.26e-05 | 1 | CTTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 880 | − | 17 | 26 | 3.26e-05 | 1 | GCTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 964 | + | 13 | 22 | 3.26e-05 | 1 | CTTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1007 | − | 24 | 33 | 3.26e-05 | 1 | GCTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1878 | + | 15 | 24 | 3.26e-05 | 1 | GCTAATGGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2245 | + | 26 | 35 | 3.26e-05 | 1 | GCTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2705 | + | 22 | 31 | 3.26e-05 | 1 | GCTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3685 | − | 16 | 25 | 3.26e-05 | 1 | CTTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 27053 | − | 25 | 34 | 3.26e-05 | 1 | GCTAATGGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 83 | + | 6 | 15 | 3.62e-05 | 1 | GCTAATTACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 122 | + | 8 | 17 | 3.62e-05 | 1 | GCTAATTGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 172 | + | 12 | 21 | 3.62e-05 | 1 | GCTAATGACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 592 | − | 23 | 32 | 3.62e-05 | 1 | GCTAATTACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 855 | − | 8 | 17 | 3.62e-05 | 1 | GCTAATTGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1563 | + | 13 | 22 | 3.62e-05 | 1 | GCTAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1669 | − | 15 | 24 | 3.62e-05 | 1 | GCTAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2684 | − | 22 | 31 | 3.62e-05 | 1 | GCTAATGACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5 | − | 12 | 21 | 4.52e-05 | 1 | GCTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 23 | − | 10 | 19 | 4.52e-05 | 1 | GCTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 72 | − | 7 | 16 | 4.52e-05 | 1 | CTTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 158 | + | 16 | 25 | 4.52e-05 | 1 | CTTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 273 | − | 12 | 21 | 4.52e-05 | 1 | CTTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 277 | − | 4 | 13 | 4.52e-05 | 1 | GCTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 311 | + | 3 | 12 | 4.52e-05 | 1 | CTTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 339 | − | 4 | 13 | 4.52e-05 | 1 | GCTAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 446 | + | 24 | 33 | 4.52e-05 | 1 | GCTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 514 | + | 9 | 18 | 4.52e-05 | 1 | GCTAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 614 | + | 29 | 38 | 4.52e-05 | 1 | GCTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 631 | + | 11 | 20 | 4.52e-05 | 1 | CTTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1130 | − | 28 | 37 | 4.52e-05 | 1 | CTTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1190 | − | 14 | 23 | 4.52e-05 | 1 | CTTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1513 | − | 25 | 34 | 4.52e-05 | 1 | CTTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1980 | + | 10 | 19 | 4.52e-05 | 1 | GCTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3510 | − | 28 | 37 | 4.52e-05 | 1 | CTTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3705 | + | 29 | 38 | 4.52e-05 | 1 | GCTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4947 | + | 23 | 32 | 4.52e-05 | 1 | CTTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 10598 | − | 23 | 32 | 4.52e-05 | 1 | GCTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 52 | + | 11 | 20 | 5.33e-05 | 1 | CCTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 79 | + | 2 | 11 | 5.33e-05 | 1 | GCTAATTGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 171 | − | 9 | 18 | 5.33e-05 | 1 | CCTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 182 | − | 6 | 15 | 5.33e-05 | 1 | CCTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 190 | − | 8 | 17 | 5.33e-05 | 1 | GCTAATTAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 261 | − | 7 | 16 | 5.33e-05 | 1 | GCTAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 396 | + | 13 | 22 | 5.33e-05 | 1 | CCTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 566 | − | 6 | 15 | 5.33e-05 | 1 | GCTAATGGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 682 | − | 15 | 24 | 5.33e-05 | 1 | GCTAATTGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 850 | + | 9 | 18 | 5.33e-05 | 1 | CCTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 991 | + | 27 | 36 | 5.33e-05 | 1 | GCTAATTGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1010 | − | 23 | 32 | 5.33e-05 | 1 | GCTAATTAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1474 | − | 2 | 11 | 5.33e-05 | 1 | CCTAATGGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1992 | + | 9 | 18 | 5.33e-05 | 1 | GCTAATGGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2409 | + | 24 | 33 | 5.33e-05 | 1 | GCTAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4817 | + | 21 | 30 | 5.33e-05 | 1 | CCTAATGGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4903 | − | 27 | 36 | 5.33e-05 | 1 | CCTAATGGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6489 | − | 23 | 32 | 5.33e-05 | 1 | CCTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 9 | + | 6 | 15 | 6.51e-05 | 1 | GCTAATTAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 147 | + | 14 | 23 | 6.51e-05 | 1 | GGTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 147 | − | 14 | 23 | 6.51e-05 | 1 | GGTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 297 | + | 23 | 32 | 6.51e-05 | 1 | GCTAATTGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 463 | + | 5 | 14 | 6.51e-05 | 1 | GGTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 607 | − | 17 | 26 | 6.51e-05 | 1 | CCTAATTACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 655 | + | 22 | 31 | 6.51e-05 | 1 | GCTAATGAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 730 | − | 26 | 35 | 6.51e-05 | 1 | GGTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 733 | − | 6 | 15 | 6.51e-05 | 1 | GCTAATGGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 738 | − | 24 | 33 | 6.51e-05 | 1 | GCTAATTAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 808 | − | 8 | 17 | 6.51e-05 | 1 | CCTAATGACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 830 | − | 11 | 20 | 6.51e-05 | 1 | GGTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 834 | + | 16 | 25 | 6.51e-05 | 1 | CCTAATTACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 948 | + | 13 | 22 | 6.51e-05 | 1 | CCTAATGACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1232 | − | 10 | 19 | 6.51e-05 | 1 | CCTAATTGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1249 | + | 11 | 20 | 6.51e-05 | 1 | GCTAATGGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1569 | − | 18 | 27 | 6.51e-05 | 1 | GCTAATGAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1640 | − | 24 | 33 | 6.51e-05 | 1 | GCTAATTGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1962 | − | 1 | 10 | 6.51e-05 | 1 | GGTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3238 | − | 10 | 19 | 6.51e-05 | 1 | GGTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3491 | + | 1 | 10 | 6.51e-05 | 1 | GGTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3691 | + | 26 | 35 | 6.51e-05 | 1 | GGTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4971 | + | 24 | 33 | 6.51e-05 | 1 | GGTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5587 | + | 19 | 28 | 6.51e-05 | 1 | CCTAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 10209 | − | 1 | 10 | 6.51e-05 | 1 | CCTAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 26663 | − | 28 | 37 | 6.51e-05 | 1 | CCTAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 27589 | − | 26 | 35 | 6.51e-05 | 1 | CCTAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 12 | + | 5 | 14 | 7.4e-05 | 1 | CCTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 53 | − | 4 | 13 | 7.4e-05 | 1 | CCTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 109 | − | 6 | 15 | 7.4e-05 | 1 | CCTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 300 | + | 25 | 34 | 7.4e-05 | 1 | ACTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 377 | + | 5 | 14 | 7.4e-05 | 1 | CCTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 417 | + | 22 | 31 | 7.4e-05 | 1 | ACTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 523 | − | 3 | 12 | 7.4e-05 | 1 | CCTAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 706 | − | 10 | 19 | 7.4e-05 | 1 | ACTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 721 | + | 6 | 15 | 7.4e-05 | 1 | ACTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 784 | + | 16 | 25 | 7.4e-05 | 1 | CCTAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 904 | − | 24 | 33 | 7.4e-05 | 1 | ACTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1087 | + | 21 | 30 | 7.4e-05 | 1 | ACTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1166 | + | 29 | 38 | 7.4e-05 | 1 | CCTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1620 | + | 14 | 23 | 7.4e-05 | 1 | CCTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1904 | − | 14 | 23 | 7.4e-05 | 1 | ACTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1946 | − | 28 | 37 | 7.4e-05 | 1 | CCTAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2772 | − | 12 | 21 | 7.4e-05 | 1 | ACTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4892 | − | 29 | 38 | 7.4e-05 | 1 | ACTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 11493 | − | 29 | 38 | 7.4e-05 | 1 | ACTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 12779 | − | 21 | 30 | 7.4e-05 | 1 | CCTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 8 | − | 4 | 13 | 8.68e-05 | 1 | GTTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 55 | + | 13 | 22 | 8.68e-05 | 1 | GTTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 59 | + | 4 | 13 | 8.68e-05 | 1 | GTTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 70 | + | 3 | 12 | 8.68e-05 | 1 | GGTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 238 | + | 15 | 24 | 8.68e-05 | 1 | GGTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 254 | − | 14 | 23 | 8.68e-05 | 1 | CCTAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 495 | + | 19 | 28 | 8.68e-05 | 1 | CCTAATTAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 495 | − | 19 | 28 | 8.68e-05 | 1 | CCTAATTAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 599 | + | 17 | 26 | 8.68e-05 | 1 | GTTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 656 | + | 3 | 12 | 8.68e-05 | 1 | GTTAATGGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 686 | + | 12 | 21 | 8.68e-05 | 1 | GGTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 713 | − | 19 | 28 | 8.68e-05 | 1 | GGTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 758 | + | 1 | 10 | 8.68e-05 | 1 | GGTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 782 | + | 10 | 19 | 8.68e-05 | 1 | CCTAATTGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 801 | − | 10 | 19 | 8.68e-05 | 1 | GGTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1049 | − | 13 | 22 | 8.68e-05 | 1 | GTTAATGGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1159 | + | 10 | 19 | 8.68e-05 | 1 | CCTAATGGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1278 | + | 13 | 22 | 8.68e-05 | 1 | CCTAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1317 | − | 20 | 29 | 8.68e-05 | 1 | GTTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1754 | − | 10 | 19 | 8.68e-05 | 1 | GGTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3040 | + | 26 | 35 | 8.68e-05 | 1 | GGTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4368 | − | 15 | 24 | 8.68e-05 | 1 | GTTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4730 | − | 24 | 33 | 8.68e-05 | 1 | CCTAATTGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 9262 | − | 13 | 22 | 8.68e-05 | 1 | GGTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 14425 | − | 17 | 26 | 8.68e-05 | 1 | CCTAATGGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5 | + | 12 | 21 | 0.000108 | 1 | ACTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 94 | + | 18 | 27 | 0.000108 | 1 | CCTAATTAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 121 | + | 13 | 22 | 0.000108 | 1 | CCTAATTGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 187 | − | 13 | 22 | 0.000108 | 1 | TCTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 197 | − | 20 | 29 | 0.000108 | 1 | CCTAATTAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 206 | − | 10 | 19 | 0.000108 | 1 | TCTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 219 | − | 10 | 19 | 0.000108 | 1 | CGTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 226 | + | 2 | 11 | 0.000108 | 1 | CGTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 245 | + | 7 | 16 | 0.000108 | 1 | GTTAATTGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 285 | − | 14 | 23 | 0.000108 | 1 | ACTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 330 | − | 1 | 10 | 0.000108 | 1 | TCTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 373 | + | 10 | 19 | 0.000108 | 1 | TCTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 422 | + | 14 | 23 | 0.000108 | 1 | TCTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 432 | − | 18 | 27 | 0.000108 | 1 | ACTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 446 | − | 24 | 33 | 0.000108 | 1 | ACTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 491 | + | 7 | 16 | 0.000108 | 1 | ACTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 505 | + | 14 | 23 | 0.000108 | 1 | CGTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 518 | + | 21 | 30 | 0.000108 | 1 | GTTAATTACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 529 | − | 21 | 30 | 0.000108 | 1 | CCTAATTGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 581 | − | 26 | 35 | 0.000108 | 1 | TCTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 614 | − | 29 | 38 | 0.000108 | 1 | ACTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 661 | + | 9 | 18 | 0.000108 | 1 | CCTAATGAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 664 | + | 7 | 16 | 0.000108 | 1 | CCTAATGGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 762 | + | 20 | 29 | 0.000108 | 1 | ACTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 814 | − | 12 | 21 | 0.000108 | 1 | GTTAATGACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 833 | + | 22 | 31 | 0.000108 | 1 | CGTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 891 | + | 21 | 30 | 0.000108 | 1 | CGTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1248 | + | 13 | 22 | 0.000108 | 1 | ACTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1335 | + | 8 | 17 | 0.000108 | 1 | GTTAATGACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1548 | + | 21 | 30 | 0.000108 | 1 | TCTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1695 | + | 3 | 12 | 0.000108 | 1 | GTTAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1824 | − | 27 | 36 | 0.000108 | 1 | CCTAATGAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1894 | − | 29 | 38 | 0.000108 | 1 | ACTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2496 | − | 12 | 21 | 0.000108 | 1 | ACTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2533 | − | 3 | 12 | 0.000108 | 1 | CGTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2607 | − | 14 | 23 | 0.000108 | 1 | TCTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2622 | − | 24 | 33 | 0.000108 | 1 | GTTAATTACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3270 | − | 17 | 26 | 0.000108 | 1 | CGTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3639 | + | 26 | 35 | 0.000108 | 1 | CCTAATGAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3810 | − | 29 | 38 | 0.000108 | 1 | ACTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3954 | − | 28 | 37 | 0.000108 | 1 | CGTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5923 | − | 24 | 33 | 0.000108 | 1 | GTTAATTGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6045 | − | 20 | 29 | 0.000108 | 1 | CCTAATGGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6554 | + | 28 | 37 | 0.000108 | 1 | GTTAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6945 | − | 29 | 38 | 0.000108 | 1 | ACTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 7306 | + | 28 | 37 | 0.000108 | 1 | GTTAATTGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 8599 | + | 28 | 37 | 0.000108 | 1 | GTTAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 9368 | − | 12 | 21 | 0.000108 | 1 | GTTAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 17525 | + | 27 | 36 | 0.000108 | 1 | CGTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 18319 | − | 27 | 36 | 0.000108 | 1 | TCTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 21006 | + | 26 | 35 | 0.000108 | 1 | TCTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 23392 | − | 18 | 27 | 0.000108 | 1 | CGTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3 | + | 2 | 11 | 0.000118 | 1 | GCTAATGATC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 19 | − | 8 | 17 | 0.000118 | 1 | GTTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 29 | + | 3 | 12 | 0.000118 | 1 | GTTAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 73 | + | 12 | 21 | 0.000118 | 1 | GTTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 86 | − | 8 | 17 | 0.000118 | 1 | GCTAATTATC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 193 | − | 10 | 19 | 0.000118 | 1 | GTTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 235 | − | 3 | 12 | 0.000118 | 1 | GCTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 239 | − | 6 | 15 | 0.000118 | 1 | GTTAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 240 | + | 9 | 18 | 0.000118 | 1 | GCTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 411 | − | 14 | 23 | 0.000118 | 1 | GCTAATGATC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 811 | + | 7 | 16 | 0.000118 | 1 | GTTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 840 | + | 29 | 38 | 0.000118 | 1 | GTTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 887 | + | 18 | 27 | 0.000118 | 1 | GTTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 974 | − | 12 | 21 | 0.000118 | 1 | GCTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1258 | + | 29 | 38 | 0.000118 | 1 | GTTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1442 | + | 29 | 38 | 0.000118 | 1 | GTTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1731 | + | 27 | 36 | 0.000118 | 1 | GCTAATGATC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2463 | + | 29 | 38 | 0.000118 | 1 | GTTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3007 | + | 30 | 39 | 0.000118 | 1 | GCTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3343 | + | 20 | 29 | 0.000118 | 1 | GCTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5010 | − | 19 | 28 | 0.000118 | 1 | GTTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5339 | + | 30 | 39 | 0.000118 | 1 | GCTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6431 | + | 30 | 39 | 0.000118 | 1 | GCTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 8525 | + | 30 | 39 | 0.000118 | 1 | GCTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 17 | + | 7 | 16 | 0.000141 | 1 | CTTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 56 | − | 6 | 15 | 0.000141 | 1 | CTTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 83 | − | 6 | 15 | 0.000141 | 1 | CGTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 93 | + | 10 | 19 | 0.000141 | 1 | TCTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 94 | − | 18 | 27 | 0.000141 | 1 | GTTAATTAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 180 | − | 14 | 23 | 0.000141 | 1 | GCTAATTACA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 186 | − | 7 | 16 | 0.000141 | 1 | GTTAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 197 | + | 20 | 29 | 0.000141 | 1 | GTTAATTAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 203 | + | 2 | 11 | 0.000141 | 1 | GCTAATTACA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 236 | + | 2 | 11 | 0.000141 | 1 | CGTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 384 | − | 12 | 21 | 0.000141 | 1 | GTTAATGGGG |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 537 | + | 5 | 14 | 0.000141 | 1 | CTTAATGGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 592 | + | 23 | 32 | 0.000141 | 1 | CGTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 646 | + | 17 | 26 | 0.000141 | 1 | CTTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 703 | − | 21 | 30 | 0.000141 | 1 | TCTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 707 | + | 27 | 36 | 0.000141 | 1 | GCTAATTACA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 788 | + | 24 | 33 | 0.000141 | 1 | CTTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 813 | + | 12 | 21 | 0.000141 | 1 | TCTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 831 | + | 16 | 25 | 0.000141 | 1 | GTTAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 892 | − | 22 | 31 | 0.000141 | 1 | CTTAATGACT |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1519 | + | 25 | 34 | 0.000141 | 1 | TCTAATGGGC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1585 | − | 9 | 18 | 0.000141 | 1 | GTTAATGGGG |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2170 | − | 18 | 27 | 0.000141 | 1 | GCTAATGACA |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2439 | − | 10 | 19 | 0.000141 | 1 | CGTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2549 | − | 13 | 22 | 0.000141 | 1 | CGTAATGAGC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3243 | − | 26 | 35 | 0.000141 | 1 | CTTAATGGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3379 | − | 18 | 27 | 0.000141 | 1 | GCTAATTGCA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3739 | + | 23 | 32 | 0.000141 | 1 | CGTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3964 | + | 22 | 31 | 0.000141 | 1 | GTTAATTGGG |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1607 | − | 21 | 30 | 0.000155 | 1 | GTTAATGGAC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1735 | + | 21 | 30 | 0.000155 | 1 | GTTAATGGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1807 | + | 27 | 36 | 0.000155 | 1 | GATAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2248 | + | 24 | 33 | 0.000155 | 1 | GTTAATGAAC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3091 | − | 27 | 36 | 0.000155 | 1 | CTTAATGACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5534 | + | 11 | 20 | 0.000155 | 1 | GATAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6109 | + | 23 | 32 | 0.000155 | 1 | GATAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6534 | − | 22 | 31 | 0.000155 | 1 | GATAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 8692 | + | 23 | 32 | 0.000155 | 1 | CTTAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 9340 | − | 12 | 21 | 0.000155 | 1 | GATAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 16 | + | 10 | 19 | 0.000175 | 1 | ATTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 21 | − | 6 | 15 | 0.000175 | 1 | ATTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 64 | + | 24 | 33 | 0.000175 | 1 | CCTAATGATC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 85 | + | 19 | 28 | 0.000175 | 1 | ATTAATGGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 93 | − | 10 | 19 | 0.000175 | 1 | GCTAATTAGA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 107 | + | 8 | 17 | 0.000175 | 1 | CTTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 144 | + | 14 | 23 | 0.000175 | 1 | CCTAATTATC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 146 | − | 8 | 17 | 0.000175 | 1 | CTTAATTAGT |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 323 | + | 29 | 38 | 0.000175 | 1 | CTTAATTAGT |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1722 | − | 15 | 24 | 0.000175 | 1 | CCTAATGATC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2195 | − | 28 | 37 | 0.000175 | 1 | CCTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2534 | − | 23 | 32 | 0.000175 | 1 | CTTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2592 | − | 23 | 32 | 0.000175 | 1 | GCTAATTGGA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3318 | − | 10 | 19 | 0.000175 | 1 | GCTAATGGGA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3349 | + | 7 | 16 | 0.000175 | 1 | CCTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4224 | + | 25 | 34 | 0.000175 | 1 | GCTAATGGGA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4607 | + | 30 | 39 | 0.000175 | 1 | CCTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5327 | − | 9 | 18 | 0.000175 | 1 | CCTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5453 | + | 30 | 39 | 0.000175 | 1 | CCTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6084 | + | 30 | 39 | 0.000175 | 1 | CCTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6964 | − | 28 | 37 | 0.000175 | 1 | CCTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 7763 | − | 21 | 30 | 0.000175 | 1 | ATTAATGGCC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 162 | − | 22 | 31 | 0.000188 | 1 | CCTAATGGCA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 282 | − | 2 | 11 | 0.000188 | 1 | CCTAATTGCA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 369 | + | 13 | 22 | 0.000188 | 1 | GATAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 420 | − | 7 | 16 | 0.000188 | 1 | GATAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 473 | − | 4 | 13 | 0.000188 | 1 | GATAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 478 | + | 19 | 28 | 0.000188 | 1 | CTTAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 561 | + | 7 | 16 | 0.000188 | 1 | CTTAATTGGG |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 635 | − | 3 | 12 | 0.000188 | 1 | CTTAATTGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 680 | − | 13 | 22 | 0.000188 | 1 | CCTAATGACA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 697 | − | 9 | 18 | 0.000188 | 1 | GATAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 975 | + | 28 | 37 | 0.000188 | 1 | CTTAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1222 | + | 5 | 14 | 0.000188 | 1 | CTTAATGGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1352 | + | 25 | 34 | 0.000188 | 1 | CCTAATTACA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1437 | − | 15 | 24 | 0.000188 | 1 | CTTAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1466 | + | 25 | 34 | 0.000188 | 1 | CCTAATGACA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1994 | + | 13 | 22 | 0.000188 | 1 | CCTAATTGCA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2106 | − | 28 | 37 | 0.000188 | 1 | CTTAATTGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2203 | + | 20 | 29 | 0.000188 | 1 | GATAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2523 | − | 25 | 34 | 0.000188 | 1 | CCTAATTACA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3131 | + | 12 | 21 | 0.000188 | 1 | GATAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4203 | − | 27 | 36 | 0.000188 | 1 | CCTAATTGCA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6728 | + | 18 | 27 | 0.000188 | 1 | CCTAATGGCA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 11844 | − | 25 | 34 | 0.000188 | 1 | CTTAATGGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 15 | − | 3 | 12 | 0.000221 | 1 | ATTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 22 | + | 4 | 13 | 0.000221 | 1 | ATTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 22 | − | 4 | 13 | 0.000221 | 1 | GCTAATTAAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 75 | − | 18 | 27 | 0.000221 | 1 | TTTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 89 | + | 4 | 13 | 0.000221 | 1 | GGTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 95 | + | 6 | 15 | 0.000221 | 1 | GCTAATTAAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 95 | − | 6 | 15 | 0.000221 | 1 | ATTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 101 | + | 1 | 10 | 0.000221 | 1 | GCTAATTGAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 115 | − | 2 | 11 | 0.000221 | 1 | CATAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 126 | + | 20 | 29 | 0.000221 | 1 | TTTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 128 | − | 22 | 31 | 0.000221 | 1 | TTTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 130 | + | 2 | 11 | 0.000221 | 1 | CTTAATTAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 136 | − | 11 | 20 | 0.000221 | 1 | ATTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 149 | − | 7 | 16 | 0.000221 | 1 | CATAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 160 | + | 12 | 21 | 0.000221 | 1 | TTTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 278 | − | 4 | 13 | 0.000221 | 1 | CTTAATGAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 289 | − | 4 | 13 | 0.000221 | 1 | TTTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 310 | + | 9 | 18 | 0.000221 | 1 | GGTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 325 | + | 19 | 28 | 0.000221 | 1 | CATAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 331 | − | 16 | 25 | 0.000221 | 1 | GGTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 344 | + | 23 | 32 | 0.000221 | 1 | CATAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 354 | − | 11 | 20 | 0.000221 | 1 | ATTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 385 | + | 1 | 10 | 0.000221 | 1 | TTTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 405 | + | 4 | 13 | 0.000221 | 1 | GCTAATGGAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 423 | − | 18 | 27 | 0.000221 | 1 | CTTAATTAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 449 | − | 17 | 26 | 0.000221 | 1 | GCTAATAGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 452 | + | 16 | 25 | 0.000221 | 1 | CTTAATGAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 476 | + | 3 | 12 | 0.000221 | 1 | CATAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 569 | − | 28 | 37 | 0.000221 | 1 | CATAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 597 | + | 6 | 15 | 0.000221 | 1 | GCTAATAACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 649 | + | 11 | 20 | 0.000221 | 1 | GCTAATGAAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 678 | − | 18 | 27 | 0.000221 | 1 | CTTAATTGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 688 | − | 13 | 22 | 0.000221 | 1 | GCTAATTGAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 722 | − | 12 | 21 | 0.000221 | 1 | GGTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 795 | + | 26 | 35 | 0.000221 | 1 | GCTAATTGAT |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1103 | + | 25 | 34 | 0.000221 | 1 | ATTAATGAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1181 | + | 16 | 25 | 0.000221 | 1 | CTTAATGGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1347 | − | 28 | 37 | 0.000221 | 1 | CTTAATTAAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1368 | − | 9 | 18 | 0.000221 | 1 | CATAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1520 | − | 4 | 13 | 0.000221 | 1 | GGTAATGGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1602 | + | 26 | 35 | 0.000221 | 1 | TTTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1782 | − | 27 | 36 | 0.000221 | 1 | CATAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1853 | − | 24 | 33 | 0.000221 | 1 | CTTAATGGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2374 | + | 24 | 33 | 0.000221 | 1 | ATTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2474 | + | 25 | 34 | 0.000221 | 1 | ATTAATGGGC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2881 | − | 15 | 24 | 0.000221 | 1 | GCTAATGGAT |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1282 | − | 27 | 36 | 0.000245 | 1 | CCTAATTAGA |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1441 | − | 21 | 30 | 0.000271 | 1 | CATAATGGGC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 6647 | − | 9 | 18 | 0.000271 | 1 | GGTAATGGGT |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 209 | + | 10 | 19 | 0.000297 | 1 | ACTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 209 | − | 10 | 19 | 0.000297 | 1 | ACTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 212 | + | 3 | 12 | 0.000297 | 1 | GGTAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 259 | + | 3 | 12 | 0.000297 | 1 | GGTAATTAGG |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 376 | + | 16 | 25 | 0.000297 | 1 | ACTAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 379 | + | 2 | 11 | 0.000297 | 1 | TCTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 391 | + | 11 | 20 | 0.000297 | 1 | TCTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 430 | − | 10 | 19 | 0.000297 | 1 | CCTAATAACC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 455 | + | 28 | 37 | 0.000297 | 1 | GGTAATTGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 493 | − | 24 | 33 | 0.000297 | 1 | GGTAATTAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 590 | − | 6 | 15 | 0.000297 | 1 | CCTAATGAAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 679 | + | 1 | 10 | 0.000297 | 1 | ACTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 710 | − | 5 | 14 | 0.000297 | 1 | CGTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 871 | + | 4 | 13 | 0.000297 | 1 | CCTAATGAAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 895 | − | 2 | 11 | 0.000297 | 1 | ACTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 967 | − | 20 | 29 | 0.000297 | 1 | ACTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 996 | − | 22 | 31 | 0.000297 | 1 | TCTAATTACT |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 11230 | − | 25 | 34 | 0.000335 | 1 | CGTAATGACG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 11358 | − | 23 | 32 | 0.000335 | 1 | CCTAATGGAG |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 14254 | − | 22 | 31 | 0.000335 | 1 | TCTAATTGCG |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 28266 | − | 22 | 31 | 0.000335 | 1 | ACTAATGGGG |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 214 | − | 18 | 27 | 0.000367 | 1 | CTTAATTACA |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 243 | + | 8 | 17 | 0.000367 | 1 | CGTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 310 | − | 9 | 18 | 0.000367 | 1 | AGTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 328 | + | 11 | 20 | 0.000367 | 1 | AGTAATGACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 331 | + | 16 | 25 | 0.000367 | 1 | AGTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 356 | − | 13 | 22 | 0.000367 | 1 | GCTAATGATG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 433 | − | 28 | 37 | 0.000367 | 1 | CGTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 434 | + | 10 | 19 | 0.000367 | 1 | TCTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 485 | − | 2 | 11 | 0.000367 | 1 | AGTAATGACC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 551 | + | 24 | 33 | 0.000367 | 1 | GCTAATTATG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 604 | − | 6 | 15 | 0.000367 | 1 | ACTAATGGAC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 696 | − | 9 | 18 | 0.000367 | 1 | CTTAATTGCA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 744 | + | 16 | 25 | 0.000367 | 1 | ACTAATGGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 824 | − | 7 | 16 | 0.000367 | 1 | AGTAATTGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 840 | − | 29 | 38 | 0.000367 | 1 | ACTAATTAAC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 906 | + | 17 | 26 | 0.000367 | 1 | CTTAATTACA |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1656 | − | 14 | 23 | 0.000367 | 1 | CGTAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1676 | + | 18 | 27 | 0.000367 | 1 | ACTAATTGAC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1264 | + | 23 | 32 | 0.000438 | 1 | GCTAATCACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1287 | − | 28 | 37 | 0.000438 | 1 | CCTAATGATT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1314 | + | 2 | 11 | 0.000438 | 1 | GATAATGGCG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1325 | − | 5 | 14 | 0.000438 | 1 | TCTAATTGAC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1329 | − | 14 | 23 | 0.000438 | 1 | AGTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1347 | + | 28 | 37 | 0.000438 | 1 | GTTAATTAAG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1369 | + | 26 | 35 | 0.000438 | 1 | TGTAATTACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1419 | − | 7 | 16 | 0.000438 | 1 | GATAATTGCG |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 9501 | − | 21 | 30 | 0.000438 | 1 | GATAATGACG |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 19151 | − | 19 | 28 | 0.000438 | 1 | CGTAATGGAC |
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| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1134 | − | 5 | 14 | 0.00046 | 1 | GTTAATAGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1198 | + | 20 | 29 | 0.00046 | 1 | CCTAATGGTG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1199 | − | 15 | 24 | 0.00046 | 1 | GATAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1399 | − | 22 | 31 | 0.00046 | 1 | CCTAATTATG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2003 | + | 25 | 34 | 0.00046 | 1 | GTTAATAAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2140 | + | 7 | 16 | 0.00046 | 1 | GGTAATGATC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2160 | − | 27 | 36 | 0.00046 | 1 | CCTAATGATG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2729 | − | 11 | 20 | 0.00046 | 1 | GATAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2811 | − | 15 | 24 | 0.00046 | 1 | GGTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 2856 | + | 22 | 31 | 0.00046 | 1 | GGTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3307 | + | 30 | 39 | 0.00046 | 1 | GGTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3355 | − | 21 | 30 | 0.00046 | 1 | CCTAATTATG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3624 | − | 12 | 21 | 0.00046 | 1 | CCTAATGGTG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 3699 | − | 21 | 30 | 0.00046 | 1 | GATAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4040 | + | 19 | 28 | 0.00046 | 1 | GATAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4234 | + | 19 | 28 | 0.00046 | 1 | GGTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 4921 | + | 30 | 39 | 0.00046 | 1 | GGTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5243 | + | 30 | 39 | 0.00046 | 1 | GGTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 5714 | + | 30 | 39 | 0.00046 | 1 | GGTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 7436 | + | 30 | 39 | 0.00046 | 1 | GGTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 8147 | − | 15 | 24 | 0.00046 | 1 | GATAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 8755 | + | 29 | 38 | 0.00046 | 1 | GATAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 9719 | + | 25 | 34 | 0.00046 | 1 | CCTAATTGTG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 12004 | + | 29 | 38 | 0.00046 | 1 | GATAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 13382 | + | 30 | 39 | 0.00046 | 1 | GGTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 15324 | − | 25 | 34 | 0.00046 | 1 | GTTAATAAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 17349 | + | 28 | 37 | 0.00046 | 1 | CCTAATGGTG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 22316 | − | 25 | 34 | 0.00046 | 1 | CCTAATTGTG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 25969 | + | 30 | 39 | 0.00046 | 1 | GGTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 27 | − | 10 | 19 | 0.000516 | 1 | CTTAATTAAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 35 | − | 7 | 16 | 0.000516 | 1 | CATAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 40 | + | 10 | 19 | 0.000516 | 1 | CTTAATTGAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 42 | − | 11 | 20 | 0.000516 | 1 | ATTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 61 | + | 20 | 29 | 0.000516 | 1 | ATTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 78 | + | 1 | 10 | 0.000516 | 1 | GGTAATTACA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 82 | + | 4 | 13 | 0.000516 | 1 | ACTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 98 | − | 14 | 23 | 0.000516 | 1 | GCTAATTAAA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 99 | + | 6 | 15 | 0.000516 | 1 | CTTAATAACC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 110 | − | 23 | 32 | 0.000516 | 1 | ATTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 118 | − | 3 | 12 | 0.000516 | 1 | TTTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 143 | + | 4 | 13 | 0.000516 | 1 | CTTAATTAAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 144 | − | 14 | 23 | 0.000516 | 1 | GATAATTAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 169 | + | 10 | 19 | 0.000516 | 1 | TTTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 180 | + | 14 | 23 | 0.000516 | 1 | TGTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 183 | + | 2 | 11 | 0.000516 | 1 | CATAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 203 | − | 2 | 11 | 0.000516 | 1 | TGTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 204 | − | 14 | 23 | 0.000516 | 1 | GATAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 216 | + | 1 | 10 | 0.000516 | 1 | GATAATTGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 221 | + | 4 | 13 | 0.000516 | 1 | GCTAATAGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 228 | + | 8 | 17 | 0.000516 | 1 | ATTAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 253 | + | 1 | 10 | 0.000516 | 1 | GCTAATTGAA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 262 | + | 10 | 19 | 0.000516 | 1 | CATAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 299 | + | 6 | 15 | 0.000516 | 1 | GCTAATTAAA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 314 | + | 8 | 17 | 0.000516 | 1 | CTTAATGAAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 317 | + | 11 | 20 | 0.000516 | 1 | ACTAATGATC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 357 | − | 6 | 15 | 0.000516 | 1 | TTTAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 453 | − | 8 | 17 | 0.000516 | 1 | ACTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 466 | + | 7 | 16 | 0.000516 | 1 | GATAATGAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 494 | + | 18 | 27 | 0.000516 | 1 | CTTAATGGAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 494 | + | 29 | 38 | 0.000516 | 1 | ATTAATGGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 521 | − | 9 | 18 | 0.000516 | 1 | CTTAATAGCC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 556 | + | 10 | 19 | 0.000516 | 1 | TTTAATTGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 595 | − | 5 | 14 | 0.000516 | 1 | CATAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 610 | − | 8 | 17 | 0.000516 | 1 | GATAATTGGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 667 | + | 22 | 31 | 0.000516 | 1 | ATTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 689 | − | 23 | 32 | 0.000516 | 1 | ACTAATTATC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 699 | − | 18 | 27 | 0.000516 | 1 | TTTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 707 | − | 27 | 36 | 0.000516 | 1 | TGTAATTAGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 709 | − | 1 | 10 | 0.000516 | 1 | GGTAATTACA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 745 | − | 4 | 13 | 0.000516 | 1 | TGTAATTGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 751 | + | 10 | 19 | 0.000516 | 1 | CATAATGACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 763 | + | 26 | 35 | 0.000516 | 1 | GGTAATTACA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 793 | + | 29 | 38 | 0.000516 | 1 | ATTAATTAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 802 | + | 20 | 29 | 0.000516 | 1 | TTTAATTACT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 804 | + | 30 | 39 | 0.000516 | 1 | ACTAATTGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 825 | − | 15 | 24 | 0.000516 | 1 | ATTAATTGGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 849 | − | 3 | 12 | 0.000516 | 1 | ACTAATGGTC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 899 | + | 18 | 27 | 0.000516 | 1 | GATAATTAGG |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 978 | − | 22 | 31 | 0.000516 | 1 | CTTAATTGAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 992 | + | 1 | 10 | 0.000516 | 1 | GCTAATGGAA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1001 | − | 28 | 37 | 0.000516 | 1 | CTTAATGAAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1026 | − | 11 | 20 | 0.000516 | 1 | CTTAATGGAT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1039 | − | 6 | 15 | 0.000516 | 1 | TTTAATGGCT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1054 | + | 7 | 16 | 0.000516 | 1 | GGTAATTGCA |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1113 | + | 15 | 24 | 0.000516 | 1 | TGTAATGGGC |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1148 | − | 18 | 27 | 0.000516 | 1 | ATTAATGAGT |
| Vax1_3499.1.bml.pwm | 1199 | + | 15 | 24 | 0.000516 | 1 | ACTAATTATC |
Command line:
/home/yang23/programs/meme_4.9.0/bin/fimo -oc /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssupbf4didobvura4b233fotkaen07l1r01or4drk5jok3k5rb5ki0/descend -thresh 0.001 /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssupbf4didobvura4b233fotkaen07l1r01or4drk5jok3k5rb5ki0/pwm.fimo /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssupbf4didobvura4b233fotkaen07l1r01or4drk5jok3k5rb5ki0/uniprobes.descend.fasta
Settings:
| output directory = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssupbf4didobvura4b233fotkaen07l1r01or4drk5jok3k5rb5ki0/descend | MEME file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssupbf4didobvura4b233fotkaen07l1r01or4drk5jok3k5rb5ki0/pwm.fimo | sequence file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ssupbf4didobvura4b233fotkaen07l1r01or4drk5jok3k5rb5ki0/uniprobes.descend.fasta |
| allow clobber = true | compute q-values = true | text only = false |
| scan both strands = true | max sequence length = 250000000 | output threshold = 0.001 |
| threshold type = p-value | max stored scores = 100000 | pseudocount = 0.1 |
| verbosity = 2 |
This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.