Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information



FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.9.0, (Release date: 6 EST 20)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011.


DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/uniprobes.descend.fasta
Database contains 41871 sequences, 2512260 residues

MOTIFS /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/pwm.fimo (nucleotide)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
MDL-1.pwm 14 AATATTAAAAATAA

Random model letter frequencies (from non-redundant database):
A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275


SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES

Motif Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
MDL-1.pwm 1303 4 17 1.96e-06 1 AAGAATTAAAAAAA
MDL-1.pwm 32764 + 4 17 2.06e-06 1 AATATTGAAAAAAA
MDL-1.pwm 8478 20 33 2.5e-06 1 ACGATTAAAAACAA
MDL-1.pwm 39113 + 3 16 4.46e-06 1 AGTATTAAAAAGAA
MDL-1.pwm 30797 7 20 4.94e-06 1 AACATTAAAAATAT
MDL-1.pwm 1870 21 34 5.26e-06 1 ATCAGTAAAAAAAA
MDL-1.pwm 5725 20 33 6.23e-06 1 ATGAATAAAAATAG
MDL-1.pwm 18016 + 14 27 6.23e-06 1 ATTATTCAAAATAA
MDL-1.pwm 13863 2 15 6.67e-06 1 ATTATTAAAAAGAC
MDL-1.pwm 17829 + 24 37 9.9e-06 1 AATATTAAAATTAG
MDL-1.pwm 12787 + 16 29 1.13e-05 1 ACTATTTAAAACAA
MDL-1.pwm 34126 + 20 33 1.13e-05 1 AACAATAAAAACTA
MDL-1.pwm 9186 6 19 1.31e-05 1 AATAGTAAAAACAG
MDL-1.pwm 36979 16 29 1.42e-05 1 AACAATGAAAATAA
MDL-1.pwm 10416 21 34 1.62e-05 1 ATTAGTTAAAAGAA
MDL-1.pwm 11856 9 22 1.62e-05 1 AAAAATAAAAAGAA
MDL-1.pwm 28849 + 13 26 1.62e-05 1 AATAATAAAGAAAA
MDL-1.pwm 608 16 29 1.74e-05 1 AAGATTTAAATATA
MDL-1.pwm 14391 22 35 1.74e-05 1 ATCATTTAAAAAAC
MDL-1.pwm 22536 + 13 26 1.74e-05 1 ATTATTTAAATAAA
MDL-1.pwm 36786 17 30 1.86e-05 1 ATGATTGAAAATAC
MDL-1.pwm 19422 + 22 35 2e-05 1 AATATTAATAAAAA
MDL-1.pwm 8201 4 17 2.16e-05 1 AATATGAAAATGAA
MDL-1.pwm 19375 22 35 2.29e-05 1 AACAGTTAAAATAG
MDL-1.pwm 30189 9 22 2.29e-05 1 ACTATTGAAAAAAA
MDL-1.pwm 6228 25 38 2.46e-05 1 ACGATTTAAAACTA
MDL-1.pwm 1738 8 21 2.8e-05 1 AAGATGAAAAATTT
MDL-1.pwm 11019 23 36 2.8e-05 1 AATAAGAAAAAGTA
MDL-1.pwm 19239 4 17 3.02e-05 1 ATGAGGAAAAAATA
MDL-1.pwm 30792 + 8 21 3.02e-05 1 AAGATTTAAGATAC
MDL-1.pwm 35405 + 9 22 3.02e-05 1 ATTATTAAGAATAA
MDL-1.pwm 12049 25 38 3.21e-05 1 ACAATTTAAAATAA
MDL-1.pwm 14554 8 21 3.42e-05 1 AATAATCAAAACAA
MDL-1.pwm 15177 + 10 23 3.42e-05 1 ATGATTAAAGAAAC
MDL-1.pwm 5868 + 6 19 3.66e-05 1 ATCTTTAAAAACAG
MDL-1.pwm 15706 + 13 26 3.88e-05 1 AAGATTAAAAATCG
MDL-1.pwm 8213 3 16 4.14e-05 1 AGGATTTAAAAGAG
MDL-1.pwm 33645 + 16 29 4.14e-05 1 ATTATAAAAAAGTA
MDL-1.pwm 1537 + 23 36 4.42e-05 1 AGGATTAGAAATAA
MDL-1.pwm 4836 2 15 4.42e-05 1 ATGATTAAAATTTG
MDL-1.pwm 36638 + 7 20 4.42e-05 1 AACTTTTAAAAGAG
MDL-1.pwm 37059 + 14 27 4.42e-05 1 ATCAGTAAAAAGAG
MDL-1.pwm 39486 + 8 21 4.42e-05 1 AATAATATAAATTA
MDL-1.pwm 5086 13 26 4.68e-05 1 AAGATTCAAAAAAT
MDL-1.pwm 12103 6 19 4.68e-05 1 AAGAGTGAAAAAAG
MDL-1.pwm 13491 2 15 4.99e-05 1 AACATGTAAATAAA
MDL-1.pwm 24577 + 5 18 4.99e-05 1 AATATTTAGAAAAA
MDL-1.pwm 34523 + 2 15 4.99e-05 1 AATATATAAAACTA
MDL-1.pwm 17319 17 30 5.32e-05 1 AAGATGGAAATTAA
MDL-1.pwm 20058 16 29 5.32e-05 1 ACTATGTAAAATTA
MDL-1.pwm 28454 + 13 26 5.32e-05 1 AACAGTTAAAACAG
MDL-1.pwm 39218 + 9 22 5.32e-05 1 AACATTAAATACAG
MDL-1.pwm 40423 + 1 14 5.65e-05 1 AAGATGGAAAACAG
MDL-1.pwm 8063 + 19 32 6.05e-05 1 ATTAATTAAGATAA
MDL-1.pwm 11337 + 10 23 6.05e-05 1 ATCAATTAAAAGTA
MDL-1.pwm 22996 + 5 18 6.05e-05 1 AAGAATCAAAATAC
MDL-1.pwm 39513 20 33 6.05e-05 1 ATTATTAAAAGCAA
MDL-1.pwm 4330 12 25 6.4e-05 1 AACAAGTAAAAATA
MDL-1.pwm 24750 + 6 19 6.4e-05 1 AAATTGTAAAATAA
MDL-1.pwm 27618 + 23 36 6.4e-05 1 AAGATGAAAATGAG
MDL-1.pwm 37814 + 2 15 6.4e-05 1 ATAAGGAAAAATAA
MDL-1.pwm 3413 + 14 27 6.79e-05 1 ACTATTAAAACAAA
MDL-1.pwm 33645 + 13 26 6.79e-05 1 AGCATTATAAAAAA
MDL-1.pwm 5325 22 35 7.21e-05 1 AATTTTAACAACAA
MDL-1.pwm 12347 1 14 7.21e-05 1 AAGACTAAAAAAAC
MDL-1.pwm 14570 + 19 32 7.21e-05 1 ATTATTTATAATAA
MDL-1.pwm 19412 + 12 25 7.21e-05 1 AATATTTAAAGGAA
MDL-1.pwm 24750 + 7 20 7.21e-05 1 AATTGTAAAATAAA
MDL-1.pwm 30466 4 17 7.21e-05 1 AAGCTTAAAATGAA
MDL-1.pwm 32764 + 5 18 7.21e-05 1 ATATTGAAAAAAAA
MDL-1.pwm 7037 + 24 37 7.64e-05 1 ATGAATGAAAAAAG
MDL-1.pwm 8034 3 16 7.64e-05 1 ACCATGAAAAACTA
MDL-1.pwm 14612 25 38 7.64e-05 1 ACGATTAAATATAG
MDL-1.pwm 31964 + 9 22 7.64e-05 1 ACGATGTAAAAAAG
MDL-1.pwm 571 + 9 22 8.11e-05 1 ACGAATAAAAAGAC
MDL-1.pwm 1303 3 16 8.11e-05 1 AGAATTAAAAAAAG
MDL-1.pwm 16552 20 33 8.11e-05 1 ATGATGTAAAAATC
MDL-1.pwm 1583 + 10 23 8.62e-05 1 ATGATTATAAATTC
MDL-1.pwm 4205 + 18 31 8.62e-05 1 ATGAATAAAATTAC
MDL-1.pwm 30482 20 33 8.62e-05 1 ATGTTGAAAGAAAA
MDL-1.pwm 35384 19 32 8.62e-05 1 AACATTGAAATTTA
MDL-1.pwm 1239 19 32 9.12e-05 1 ACCATTCAAAAGAA
MDL-1.pwm 15709 + 17 30 9.12e-05 1 AACGTTAAAAATTA
MDL-1.pwm 35968 5 18 9.12e-05 1 AAGCATAAAAAGTA
MDL-1.pwm 36456 + 12 25 9.12e-05 1 AAGATTGGAAACAA
MDL-1.pwm 10483 17 30 9.65e-05 1 AAAATTAAAATGTA
MDL-1.pwm 24061 19 32 9.65e-05 1 AATAATATAAAGTA
MDL-1.pwm 28296 11 24 9.65e-05 1 AAGATTATAAATTT
MDL-1.pwm 33065 + 13 26 9.65e-05 1 ATCATAAAAGATAA
MDL-1.pwm 3685 + 14 27 0.000103 1 AATATGAAAAAGCA
MDL-1.pwm 5719 + 6 19 0.000103 1 AACATTGTAAAGAA
MDL-1.pwm 7863 7 20 0.000103 1 AAGATTAGAATGAA
MDL-1.pwm 7942 5 18 0.000103 1 ATGAGTATAAAATA
MDL-1.pwm 7950 14 27 0.000103 1 AGTACTAAAAATAA
MDL-1.pwm 12164 22 35 0.000103 1 AAGAGGTAAAATTG
MDL-1.pwm 14211 + 17 30 0.000103 1 AAAAGGTAAAAAAA
MDL-1.pwm 18346 + 7 20 0.000103 1 AGCATTAAAGATTA
MDL-1.pwm 31943 + 21 34 0.000103 1 ACCATTTTAAATAA
MDL-1.pwm 40568 + 1 14 0.000103 1 AAAATGAAATAAAA
MDL-1.pwm 8225 + 21 34 0.000108 1 AGTTGTAAAAACAA
MDL-1.pwm 1303 1 14 0.000115 1 AATTAAAAAAAGAA
MDL-1.pwm 3456 2 15 0.000115 1 AACTTTTACAATAA
MDL-1.pwm 8701 21 34 0.000115 1 AAGTTAAAAAATAT
MDL-1.pwm 15808 16 29 0.000115 1 ATGTATAAATAAAA
MDL-1.pwm 22671 + 2 15 0.000115 1 AACATTATAATCAA
MDL-1.pwm 28813 6 19 0.000115 1 AGTATTCAAAATAG
MDL-1.pwm 32791 1 14 0.000115 1 ATCATGAAAATTAG
MDL-1.pwm 40508 + 23 36 0.000115 1 ATTATTGACAATAA
MDL-1.pwm 4631 + 21 34 0.000122 1 ATTTTTATAAATAG
MDL-1.pwm 7543 + 12 25 0.000122 1 ACGATTTGAAAAAA
MDL-1.pwm 15273 2 15 0.000122 1 ATGTGAAAAAAAAA
MDL-1.pwm 15508 + 13 26 0.000122 1 ATAATTAAAAACTC
MDL-1.pwm 32648 + 10 23 0.000122 1 AATATTCACAAAAA
MDL-1.pwm 36098 + 13 26 0.000122 1 AAGTACAAAAATAA
MDL-1.pwm 37952 + 1 14 0.000122 1 ACTATTAACAACAA
MDL-1.pwm 11127 11 24 0.000128 1 AGTATGAAAAAATG
MDL-1.pwm 11981 9 22 0.000128 1 AGTAATTAAAATAC
MDL-1.pwm 26558 19 32 0.000128 1 ATGATTAAGAACTA
MDL-1.pwm 37434 + 23 36 0.000128 1 AGTATTTAAACTAA
MDL-1.pwm 9370 7 20 0.000136 1 GAGTTTAAAAAAAA
MDL-1.pwm 10366 3 16 0.000136 1 AAGATATACAATAA
MDL-1.pwm 15968 + 9 22 0.000136 1 AAGATTTTAAAATC
MDL-1.pwm 20988 23 36 0.000136 1 AACCGTAAAAAATA
MDL-1.pwm 24572 + 18 31 0.000136 1 AAGAATTAAATAAC
MDL-1.pwm 29888 11 24 0.000136 1 ATCTTTAAAGAATA
MDL-1.pwm 30794 + 22 35 0.000136 1 AACATGTAAAATTT
MDL-1.pwm 5804 23 36 0.000143 1 ACTAATAAAAAAAT
MDL-1.pwm 8097 25 38 0.000143 1 ACTATTTAAAACAT
MDL-1.pwm 8439 + 18 31 0.000143 1 AAAATTTAAAAGTC
MDL-1.pwm 27855 11 24 0.000143 1 ATCAAGAAAAATTG
MDL-1.pwm 29120 + 15 28 0.000143 1 AAGAATACAAAGTA
MDL-1.pwm 2363 15 28 0.000152 1 AATTGTAAATAGAA
MDL-1.pwm 4200 25 38 0.000152 1 ACCTTTCAAAATAA
MDL-1.pwm 6902 + 15 28 0.000152 1 AATATTTACATTAA
MDL-1.pwm 7669 + 5 18 0.000152 1 AACATATAAGAAAA
MDL-1.pwm 8711 10 23 0.000152 1 ACGATGATAAACAA
MDL-1.pwm 34325 + 19 32 0.000152 1 ATCATGAAAAAATT
MDL-1.pwm 1921 7 20 0.00016 1 ATGATAAAAGAATA
MDL-1.pwm 2269 19 32 0.00016 1 AACTTTAAATAAAC
MDL-1.pwm 3184 + 22 35 0.00016 1 AACTTTAAAACTAG
MDL-1.pwm 11289 14 27 0.00016 1 AACATTTTAATAAA
MDL-1.pwm 19054 + 6 19 0.00016 1 ATGATCAAAAATTG
MDL-1.pwm 20351 + 2 15 0.00016 1 AATTTTCAATATAA
MDL-1.pwm 29101 4 17 0.00016 1 AATCTTAAAAATTT
MDL-1.pwm 29729 + 20 33 0.00016 1 ATGATGCAAAAGAG
MDL-1.pwm 40426 + 18 31 0.00016 1 ATTAATGAAAAGAG
MDL-1.pwm 2452 + 23 36 0.000169 1 AATATTATATATAG
MDL-1.pwm 7518 8 21 0.000169 1 AAGATTGTAATTAA
MDL-1.pwm 8950 + 24 37 0.000169 1 AATTGTGAAAATAG
MDL-1.pwm 11255 + 20 33 0.000169 1 ATTATTAACATAAA
MDL-1.pwm 11338 22 35 0.000169 1 ATTCGTAAAAAATA
MDL-1.pwm 15516 + 5 18 0.000169 1 ATGTTGATAAAGAA
MDL-1.pwm 17502 + 18 31 0.000169 1 AATATTCAAACCAA
MDL-1.pwm 22465 25 38 0.000169 1 ACCTTGAAAAAATA
MDL-1.pwm 25905 2 15 0.000169 1 ACTATTTTAAATTA
MDL-1.pwm 35935 + 7 20 0.000169 1 AATAGTTTAAATAG
MDL-1.pwm 8442 6 19 0.000178 1 AAGAGTAAAATATC
MDL-1.pwm 28038 17 30 0.000178 1 TTTATGAAAAATAA
MDL-1.pwm 30922 20 33 0.000178 1 AATATTCAAATCTA
MDL-1.pwm 7982 + 18 31 0.000189 1 AACTAGAAAAAAAC
MDL-1.pwm 11929 + 19 32 0.000189 1 AATTTTTTAAAAAG
MDL-1.pwm 15895 + 16 29 0.000189 1 ATTAGTATAAAAAG
MDL-1.pwm 24481 + 26 39 0.000189 1 AAGATGGAAAAGTC
MDL-1.pwm 24893 9 22 0.000189 1 AAGATAAAATAAAC
MDL-1.pwm 3270 + 23 36 0.000199 1 AACATTGAAGACTA
MDL-1.pwm 12709 + 6 19 0.000199 1 AGGAATTAAAACAC
MDL-1.pwm 13571 + 19 32 0.000199 1 ATGAGGATAAACAA
MDL-1.pwm 23217 8 21 0.000199 1 ACTTTATAAAATAA
MDL-1.pwm 35498 1 14 0.000199 1 AACAATTTAAAATA
MDL-1.pwm 36254 + 1 14 0.000199 1 AAGTTGTTAAACAA
MDL-1.pwm 1870 22 35 0.00021 1 AATCAGTAAAAAAA
MDL-1.pwm 11081 + 10 23 0.00021 1 ACTTTTAAATAGAA
MDL-1.pwm 11140 + 11 24 0.00021 1 ATCAATAAAACTTA
MDL-1.pwm 13794 8 21 0.00021 1 AAGAATGTAAATTA
MDL-1.pwm 17775 11 24 0.00021 1 ACGAGTTAAAACAC
MDL-1.pwm 19747 + 10 23 0.00021 1 ATTTTGACAAATAA
MDL-1.pwm 20294 + 23 36 0.00021 1 ACTTGTTAAAAGAA
MDL-1.pwm 26153 + 8 21 0.00021 1 AAGAATAAGAATAC
MDL-1.pwm 30974 + 11 24 0.00021 1 ATTATTGAAACGAA
MDL-1.pwm 5787 2 15 0.000222 1 AACCAGAAAAAGAA
MDL-1.pwm 5971 + 20 33 0.000222 1 ATTTTTAAATTTAA
MDL-1.pwm 8754 7 20 0.000222 1 ATTATGTAGAATAA
MDL-1.pwm 9446 6 19 0.000222 1 ATCAATCAAAAAAG
MDL-1.pwm 15797 18 31 0.000222 1 AGGAGTAAAAAGAT
MDL-1.pwm 19241 25 38 0.000222 1 ACGAGTTAAGAAAA
MDL-1.pwm 19846 + 14 27 0.000222 1 ATGATTTAAAAACG
MDL-1.pwm 20675 + 20 33 0.000222 1 ATTTGTTAAATTAA
MDL-1.pwm 24095 + 12 25 0.000222 1 AACATTAAAGTGTA
MDL-1.pwm 25059 + 14 27 0.000222 1 ATCATTTAATAGAG
MDL-1.pwm 28601 + 1 14 0.000222 1 ATCCATAAAAATAG
MDL-1.pwm 7074 18 31 0.000233 1 AATTATAGAAAGAA
MDL-1.pwm 8201 13 26 0.000233 1 AACATGATAAATAT
MDL-1.pwm 8212 + 26 39 0.000233 1 AAGAAGTAAAAGTC
MDL-1.pwm 9815 16 29 0.000233 1 ATTTTGAAAACAAA
MDL-1.pwm 14591 + 13 26 0.000233 1 ATTAGTGAATATAA
MDL-1.pwm 21651 + 9 22 0.000233 1 AAGATGATATAGAA
MDL-1.pwm 22419 + 23 36 0.000233 1 AAGTTTAAAATTTT
MDL-1.pwm 27335 + 17 30 0.000233 1 AATATAAAAACATA
MDL-1.pwm 28416 + 6 19 0.000233 1 AAGAGGTTAAAGAA
MDL-1.pwm 31183 16 29 0.000233 1 ACCATTATAAACTA
MDL-1.pwm 33828 5 18 0.000233 1 AGCATTGAAAACAG
MDL-1.pwm 38805 3 16 0.000233 1 AAGTTTAGAAATAT
MDL-1.pwm 2103 19 32 0.000246 1 ATCATTAACTATAA
MDL-1.pwm 5675 17 30 0.000246 1 AATATGAAGAAAAG
MDL-1.pwm 13470 + 12 25 0.000246 1 ACTAGTAAATACAA
MDL-1.pwm 13643 21 34 0.000246 1 ACTCTGAAAAACAA
MDL-1.pwm 14860 14 27 0.000246 1 ATCAGGATAAAAAA
MDL-1.pwm 15968 11 24 0.000246 1 ATGATTTTAAAATC
MDL-1.pwm 16643 + 8 21 0.000246 1 ATGATTCGAAAGAA
MDL-1.pwm 17407 17 30 0.000246 1 AGTAGTAAAATTTA
MDL-1.pwm 18705 + 16 29 0.000246 1 AATCTAAAAAAAAG
MDL-1.pwm 25070 12 25 0.000246 1 AAGTAAGAAAATAA
MDL-1.pwm 25243 + 7 20 0.000246 1 AACAGTAAAACAAG
MDL-1.pwm 28849 + 7 20 0.000246 1 AATTGTAATAATAA
MDL-1.pwm 29523 + 3 16 0.000246 1 AAGAAGAAAGACAG
MDL-1.pwm 33698 + 20 33 0.000246 1 AAGCTCAAAAACAA
MDL-1.pwm 34934 + 7 20 0.000246 1 AAGAGTGAAAATTT
MDL-1.pwm 36267 + 7 20 0.000246 1 AAGATCTAAAAATG
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MDL-1.pwm 32791 2 15 0.000334 1 AATCATGAAAATTA
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MDL-1.pwm 16253 + 4 17 0.000471 1 AAATTGAACAATAA
MDL-1.pwm 20508 8 21 0.000471 1 AATATGGAAAAGTT
MDL-1.pwm 21198 + 7 20 0.000471 1 ATGAGAAAAAACAT
MDL-1.pwm 21955 + 17 30 0.000471 1 ATGAATAATAAAAC
MDL-1.pwm 22304 + 18 31 0.000471 1 AAGATTACATAGAG
MDL-1.pwm 24456 + 9 22 0.000471 1 AAGTTATAAAACAT
MDL-1.pwm 27758 5 18 0.000471 1 AATCGTTAAAATTG
MDL-1.pwm 32716 + 9 22 0.000471 1 AAAAATAGAAAATA
MDL-1.pwm 33646 + 2 15 0.000471 1 ACTATAGAAAAATA
MDL-1.pwm 35405 + 6 19 0.000471 1 AACATTATTAAGAA
MDL-1.pwm 36164 + 12 25 0.000471 1 AATTATCAAAATTG
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MDL-1.pwm 2314 + 1 14 0.000495 1 ACCAGTGAAAAAAG
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MDL-1.pwm 14850 16 29 0.000495 1 ATGTTTAAATTATA
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MDL-1.pwm 18815 13 26 0.000495 1 AAGTTTTCAATAAA
MDL-1.pwm 19306 + 7 20 0.000495 1 AGGAGTAAAAACTT
MDL-1.pwm 21168 11 24 0.000495 1 ATGCGGTAAAAGAA
MDL-1.pwm 23550 17 30 0.000495 1 AACATTAATACAAA
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MDL-1.pwm 26171 + 8 21 0.000495 1 AATATTTCAAACTC
MDL-1.pwm 29887 14 27 0.000495 1 AGGATGAAAATCAC
MDL-1.pwm 35248 + 16 29 0.000495 1 ACTATTGAAAGTAA
MDL-1.pwm 37894 + 10 23 0.000495 1 ACGCGTAAAAATAC
MDL-1.pwm 38174 9 22 0.000495 1 AAGTTTCAATATAC
MDL-1.pwm 38977 + 21 34 0.000495 1 AATTGTTAGAATAA
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MDL-1.pwm 2454 6 19 0.000519 1 AAGAAATGAAAAAA
MDL-1.pwm 4116 + 21 34 0.000519 1 GTGATAAAAAAAAA
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MDL-1.pwm 13764 21 34 0.000519 1 ACCTTTAGAAACAA
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MDL-1.pwm 19171 25 38 0.000519 1 ACCAGGAAAAACAC
MDL-1.pwm 21159 + 14 27 0.000519 1 AACAATTACAACTA
MDL-1.pwm 22394 20 33 0.000519 1 AATATTACAGACAG
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MDL-1.pwm 28268 + 14 27 0.000519 1 AATATTAAGACCAA
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MDL-1.pwm 38678 4 17 0.000519 1 ATTAGGTTAAAGAA
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MDL-1.pwm 14391 23 36 0.000571 1 AATCATTTAAAAAA
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MDL-1.pwm 18298 8 21 0.000571 1 ATTTTTAAATACAT
MDL-1.pwm 21674 17 30 0.000571 1 ATGATGGTAAATAC
MDL-1.pwm 26142 23 36 0.000571 1 ATGCTTTAGAATAA
MDL-1.pwm 26362 + 1 14 0.000571 1 AAGATGTAGAACAG
MDL-1.pwm 26895 + 4 17 0.000571 1 AGGAAGAAATATTA
MDL-1.pwm 27335 + 16 29 0.000571 1 AAATATAAAAACAT
MDL-1.pwm 32511 + 14 27 0.000571 1 GAAAATAAAAATAA
MDL-1.pwm 32525 + 10 23 0.000571 1 AACCTTTAATAATA
MDL-1.pwm 37229 16 29 0.000571 1 AAGATTGAACATTA
MDL-1.pwm 38376 + 15 28 0.000571 1 AATATTAAACAATG
MDL-1.pwm 39130 + 2 15 0.000571 1 AACATTTTAAGAAA
MDL-1.pwm 39139 + 13 26 0.000571 1 ATGCTGAAAATATA
MDL-1.pwm 1962 + 19 32 0.000598 1 ACGACGAAAAAATA
MDL-1.pwm 2093 2 15 0.000598 1 ACGATAAGAAACAA
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MDL-1.pwm 5420 17 30 0.000598 1 ATGATGCAAATAAG
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MDL-1.pwm 9144 4 17 0.000598 1 AATAATTAAGCAAA
MDL-1.pwm 9620 10 23 0.000598 1 AACCATATAAAGAA
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MDL-1.pwm 16324 + 2 15 0.000598 1 TAAATTAAAAAAAG
MDL-1.pwm 18016 15 28 0.000598 1 ATTATTTTGAATAA
MDL-1.pwm 21949 + 11 24 0.000598 1 ACTTATAAAAAGTG
MDL-1.pwm 23189 14 27 0.000598 1 ACTATTAAAATATT
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MDL-1.pwm 28363 + 16 29 0.000598 1 AATATGAGAATTAG
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MDL-1.pwm 2759 20 33 0.000627 1 AATATGTAATCAAA
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MDL-1.pwm 4116 + 20 33 0.000627 1 AGTGATAAAAAAAA
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MDL-1.pwm 8588 + 21 34 0.000627 1 ATTTATAAAATTTG
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MDL-1.pwm 12081 1 14 0.000627 1 AATATCAAAGACAG
MDL-1.pwm 12175 + 7 20 0.000627 1 AATTGATAAAAGTA
MDL-1.pwm 14170 18 31 0.000627 1 AATTTGTAAACTAG
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MDL-1.pwm 16114 + 5 18 0.000627 1 TCGAGTAAAAAAAA
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MDL-1.pwm 19572 + 10 23 0.000627 1 ATTATATAAACTTA
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MDL-1.pwm 26948 + 1 14 0.000627 1 AAGAATAAATATGA
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MDL-1.pwm 28885 16 29 0.000627 1 ACCAATTAAAAGAT
MDL-1.pwm 29345 25 38 0.000627 1 ACGAATCAAAAGAC
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MDL-1.pwm 36765 + 20 33 0.000627 1 AAGTAGCAAAAGTA
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MDL-1.pwm 11634 22 35 0.000657 1 AACATGAAATCGAA
MDL-1.pwm 11949 + 3 16 0.000657 1 ATCATTAAATCTAG
MDL-1.pwm 14690 1 14 0.000657 1 AAGTTTGAAGAATG
MDL-1.pwm 16370 23 36 0.000657 1 ACTCTTATAAACAA
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MDL-1.pwm 41849 + 13 26 0.000657 1 ATTCTATAAAATAG
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MDL-1.pwm 7099 13 26 0.000688 1 AAAATAAACAACAA
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MDL-1.pwm 15214 + 18 31 0.000688 1 ACGTTGAAATATAG
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MDL-1.pwm 19057 + 23 36 0.000688 1 AGTCTTTAAAATTG
MDL-1.pwm 21011 + 14 27 0.000688 1 ACCATTATCAATAA
MDL-1.pwm 26504 + 5 18 0.000688 1 AATATGGGAAAAAG
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MDL-1.pwm 34080 8 21 0.000688 1 ACTATTAAAGCCAA
MDL-1.pwm 36247 + 21 34 0.000688 1 AAGTGGGAAAAGAG
MDL-1.pwm 36300 + 7 20 0.000688 1 AAAAGGAACAAAAA
MDL-1.pwm 39113 + 2 15 0.000688 1 AAGTATTAAAAAGA
MDL-1.pwm 2044 + 6 19 0.00072 1 ATCTATAAATACTA
MDL-1.pwm 3842 + 7 20 0.00072 1 AATAGTAAGTAAAA
MDL-1.pwm 4357 4 17 0.00072 1 ATGAGGCTAAATAA
MDL-1.pwm 5439 25 38 0.00072 1 ACACTTTAAAACAA
MDL-1.pwm 6879 7 20 0.00072 1 AAGATTAACAACGA
MDL-1.pwm 7409 + 24 37 0.00072 1 AATAGTCAATAAAG
MDL-1.pwm 7835 11 24 0.00072 1 ATGATGAAACATAG
MDL-1.pwm 7950 15 28 0.00072 1 AAGTACTAAAAATA
MDL-1.pwm 10264 + 15 28 0.00072 1 ATGATTAGGAAGAA
MDL-1.pwm 10993 + 16 29 0.00072 1 ACTAAAATAAATAA
MDL-1.pwm 11194 9 22 0.00072 1 AATATTTAAGGATA
MDL-1.pwm 11350 7 20 0.00072 1 ATGAAGCAAAAATG
MDL-1.pwm 11751 + 24 37 0.00072 1 AATAGGAAAATCTG
MDL-1.pwm 15042 9 22 0.00072 1 ATGTGGACAAAAAA
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MDL-1.pwm 26171 7 20 0.00072 1 AGTTTGAAATATTA
MDL-1.pwm 29053 17 30 0.00072 1 ATAATTTAGAATTA
MDL-1.pwm 29499 21 34 0.00072 1 ATCCGTTAAAAGTA
MDL-1.pwm 32716 + 12 25 0.00072 1 AATAGAAAATACTA
MDL-1.pwm 34456 10 23 0.00072 1 AGCATTAAAATCTC
MDL-1.pwm 35864 + 16 29 0.00072 1 ACTAATAGAAATAC
MDL-1.pwm 37283 + 23 36 0.00072 1 ATTTGTAAAAGGAA
MDL-1.pwm 37322 7 20 0.00072 1 ATTATCTAAGAGAA
MDL-1.pwm 37433 21 34 0.00072 1 AGTAGTGAAAATAT
MDL-1.pwm 37936 + 28 41 0.00072 1 AAGATTTAAGTCTG
MDL-1.pwm 39453 + 16 29 0.00072 1 ATTTATGAAAAATG
MDL-1.pwm 40426 + 15 28 0.00072 1 AAAATTAATGAAAA
MDL-1.pwm 2602 25 38 0.000754 1 ACGAGTTAAATAAC
MDL-1.pwm 3221 23 36 0.000754 1 AGCCTGAAAAAAAG
MDL-1.pwm 4642 14 27 0.000754 1 AACATTAAAGGGTA
MDL-1.pwm 4897 3 16 0.000754 1 ATGAATAACGATTA
MDL-1.pwm 4971 15 28 0.000754 1 ATTATTAGAACATA
MDL-1.pwm 5546 25 38 0.000754 1 ACGAAGAGAAACAA
MDL-1.pwm 6051 13 26 0.000754 1 ATCATTAAAACACA
MDL-1.pwm 6431 + 8 21 0.000754 1 ATGAGTCAAAAATT
MDL-1.pwm 7026 + 20 33 0.000754 1 ATCATTTAAGTCTA
MDL-1.pwm 10275 3 16 0.000754 1 AAAATGTAAAACTT
MDL-1.pwm 10923 2 15 0.000754 1 AAGATTACAACCAG
MDL-1.pwm 14115 + 2 15 0.000754 1 TATATGATAAATAA
MDL-1.pwm 14808 + 17 30 0.000754 1 AAGTGGAAAATCAG
MDL-1.pwm 16716 12 25 0.000754 1 ACTACTTAAAAAAG
MDL-1.pwm 17096 + 2 15 0.000754 1 ATCAAGAAATAAAC
MDL-1.pwm 17127 20 33 0.000754 1 AGGATGGAAAACTG
MDL-1.pwm 18371 18 31 0.000754 1 AACATTTCAGATAG
MDL-1.pwm 18957 + 21 34 0.000754 1 AAGAACTAATAAAA
MDL-1.pwm 20455 16 29 0.000754 1 AAGTGTTAAGTAAA
MDL-1.pwm 21323 + 22 35 0.000754 1 AAGTTTAAACAAAC
MDL-1.pwm 23217 + 7 20 0.000754 1 ATTATTTTATAAAG
MDL-1.pwm 24793 + 3 16 0.000754 1 ATGTAGGAAAACTA
MDL-1.pwm 25343 + 12 25 0.000754 1 AATACAAAAAACAG
MDL-1.pwm 26712 + 9 22 0.000754 1 ATTAATAAAGCGAA
MDL-1.pwm 27875 11 24 0.000754 1 AAGAATATAATTAT
MDL-1.pwm 28646 16 29 0.000754 1 ATGATTAAAGCGAC
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MDL-1.pwm 23441 + 19 32 0.000826 1 AACATTAATGACTA
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MDL-1.pwm 9737 12 25 0.000864 1 ATTATTTTAATCAG
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MDL-1.pwm 19683 21 34 0.000864 1 ATCAATAGATAAAA
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MDL-1.pwm 9486 6 19 0.000944 1 ATGAATAAGATCAA
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MDL-1.pwm 13663 + 19 32 0.000944 1 AAATTTTGAAATAG
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MDL-1.pwm 27242 9 22 0.000944 1 ATGATTACATTAAA
MDL-1.pwm 28363 8 21 0.000944 1 CATATTAAAGATAA
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MDL-1.pwm 30766 + 28 41 0.000944 1 AAGATGAAAGTCTG
MDL-1.pwm 31920 + 17 30 0.000944 1 AACATTTAATCAAG
MDL-1.pwm 32387 + 7 20 0.000944 1 AATGTTATAAACTA
MDL-1.pwm 32394 9 22 0.000944 1 AATATTGAATCTTA
MDL-1.pwm 32501 + 2 15 0.000944 1 AACTTAGAAAATTG
MDL-1.pwm 32935 + 1 14 0.000944 1 ATCCTGTAAAACAC
MDL-1.pwm 33063 + 14 27 0.000944 1 AAGTAGTAAATCTA
MDL-1.pwm 34071 8 21 0.000944 1 ATTAAATAATAGAA
MDL-1.pwm 34350 20 33 0.000944 1 ACCCTTTTAAATAA
MDL-1.pwm 35566 + 2 15 0.000944 1 ATGATAACAGAAAA
MDL-1.pwm 35779 + 3 16 0.000944 1 AAGATTCAAGTAAC
MDL-1.pwm 35968 4 17 0.000944 1 AGCATAAAAAGTAA
MDL-1.pwm 37363 + 17 30 0.000944 1 AATAATGAATAATG
MDL-1.pwm 38115 + 11 24 0.000944 1 AATAGTAAATGGAA
MDL-1.pwm 39833 11 24 0.000944 1 ATCAATTAAATATC
MDL-1.pwm 2982 2 15 0.000987 1 ACGAGGAAGAAAAA
MDL-1.pwm 4040 15 28 0.000987 1 AATATTTATACGAA
MDL-1.pwm 4493 + 24 37 0.000987 1 AAGTATGAATAAAG
MDL-1.pwm 7517 + 10 23 0.000987 1 AATTGTCACAATAA
MDL-1.pwm 8733 6 19 0.000987 1 ACTTTTAAAAACGA
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MDL-1.pwm 10076 21 34 0.000987 1 AACCTTCAAATCAA
MDL-1.pwm 10440 14 27 0.000987 1 ATGAAAAGAAATAG
MDL-1.pwm 12231 + 8 21 0.000987 1 AAGTGTGGAAAGAA
MDL-1.pwm 13398 + 19 32 0.000987 1 ATTATAATAGACAA
MDL-1.pwm 13851 21 34 0.000987 1 ACGTTACAAAAGAA
MDL-1.pwm 15317 + 2 15 0.000987 1 ATGCAGATAAAAAA
MDL-1.pwm 15922 16 29 0.000987 1 AAGAATACAGAAAC
MDL-1.pwm 17120 3 16 0.000987 1 ATGAATGAAATTTC
MDL-1.pwm 17634 + 10 23 0.000987 1 ACGTGTTGAAATAA
MDL-1.pwm 17815 4 17 0.000987 1 AACTTTACAAATTT
MDL-1.pwm 18583 + 18 31 0.000987 1 ATGATTGGAACTAA
MDL-1.pwm 18966 + 23 36 0.000987 1 AAGCTTTAAAAGGA
MDL-1.pwm 22779 12 25 0.000987 1 ATTTTTCAAACTTA
MDL-1.pwm 24066 12 25 0.000987 1 AACATGTAGAAGAG
MDL-1.pwm 25339 + 13 26 0.000987 1 AACTTTCAAATCAG
MDL-1.pwm 25762 25 38 0.000987 1 ACGATTAGTAATAA
MDL-1.pwm 28716 + 19 32 0.000987 1 ATTATTAGAGACAC
MDL-1.pwm 29976 + 18 31 0.000987 1 ACGTTTAGATATAA
MDL-1.pwm 30204 + 7 20 0.000987 1 AAGAAGGAATACTA
MDL-1.pwm 30602 12 25 0.000987 1 AGGATGTTAAAGAG
MDL-1.pwm 32119 + 14 27 0.000987 1 AGGATTACAGAATA
MDL-1.pwm 32394 + 17 30 0.000987 1 AATATTTATACCAA
MDL-1.pwm 34419 17 30 0.000987 1 ATGATCCAAGATAA
MDL-1.pwm 35867 16 29 0.000987 1 ATGCATTAAAACTG
MDL-1.pwm 38642 + 6 19 0.000987 1 ACTATTGAGAACAA
MDL-1.pwm 38833 + 6 19 0.000987 1 ACGAGGAAATAAAG
MDL-1.pwm 38935 8 21 0.000987 1 ATTAGTGTAAACTA
MDL-1.pwm 39670 3 16 0.000987 1 ATCTATAAAGTAAA
MDL-1.pwm 39998 21 34 0.000987 1 AGGTATAAAACTTA
MDL-1.pwm 41710 19 32 0.000987 1 ACCATTTAAGCTAA

DEBUGGING INFORMATION

Command line:

/home/yang23/programs/meme_4.9.0/bin/fimo -oc /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/descend -thresh 0.001 /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/pwm.fimo /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/uniprobes.descend.fasta

Settings:

output directory = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/descend MEME file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/pwm.fimo sequence file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/uniprobes.descend.fasta
allow clobber = true compute q-values = true text only = false
scan both strands = true max sequence length = 250000000 output threshold = 0.001
threshold type = p-value max stored scores = 100000 pseudocount = 0.1
verbosity = 2

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.


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