Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information



FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.9.0, (Release date: 6 EST 20)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011.


DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/uniprobes.shuffled.fasta
Database contains 41871 sequences, 2512260 residues

MOTIFS /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/pwm.fimo (nucleotide)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
MDL-1.pwm 14 AATATTAAAAATAA

Random model letter frequencies (from non-redundant database):
A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275


SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES

Motif Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
MDL-1.pwm 3726 4 17 1.96e-06 1 AAGAATTAAAAAAA
MDL-1.pwm 1917 + 4 17 2.06e-06 1 AATATTGAAAAAAA
MDL-1.pwm 10215 20 33 2.5e-06 1 ACGATTAAAAACAA
MDL-1.pwm 5784 + 3 16 4.46e-06 1 AGTATTAAAAAGAA
MDL-1.pwm 33383 7 20 4.94e-06 1 AACATTAAAAATAT
MDL-1.pwm 25754 21 34 5.26e-06 1 ATCAGTAAAAAAAA
MDL-1.pwm 13573 20 33 6.23e-06 1 ATGAATAAAAATAG
MDL-1.pwm 40583 + 14 27 6.23e-06 1 ATTATTCAAAATAA
MDL-1.pwm 14090 2 15 6.67e-06 1 ATTATTAAAAAGAC
MDL-1.pwm 37612 + 24 37 9.9e-06 1 AATATTAAAATTAG
MDL-1.pwm 14364 + 20 33 1.13e-05 1 AACAATAAAAACTA
MDL-1.pwm 19016 + 16 29 1.13e-05 1 ACTATTTAAAACAA
MDL-1.pwm 15511 6 19 1.31e-05 1 AATAGTAAAAACAG
MDL-1.pwm 13235 16 29 1.42e-05 1 AACAATGAAAATAA
MDL-1.pwm 6525 21 34 1.62e-05 1 ATTAGTTAAAAGAA
MDL-1.pwm 24001 9 22 1.62e-05 1 AAAAATAAAAAGAA
MDL-1.pwm 33107 + 13 26 1.62e-05 1 AATAATAAAGAAAA
MDL-1.pwm 14514 22 35 1.74e-05 1 ATCATTTAAAAAAC
MDL-1.pwm 27571 + 13 26 1.74e-05 1 ATTATTTAAATAAA
MDL-1.pwm 28119 16 29 1.74e-05 1 AAGATTTAAATATA
MDL-1.pwm 26254 17 30 1.86e-05 1 ATGATTGAAAATAC
MDL-1.pwm 25997 + 22 35 2e-05 1 AATATTAATAAAAA
MDL-1.pwm 7767 4 17 2.16e-05 1 AATATGAAAATGAA
MDL-1.pwm 9808 22 35 2.29e-05 1 AACAGTTAAAATAG
MDL-1.pwm 10744 9 22 2.29e-05 1 ACTATTGAAAAAAA
MDL-1.pwm 24269 25 38 2.46e-05 1 ACGATTTAAAACTA
MDL-1.pwm 28194 8 21 2.8e-05 1 AAGATGAAAAATTT
MDL-1.pwm 39412 23 36 2.8e-05 1 AATAAGAAAAAGTA
MDL-1.pwm 21738 + 8 21 3.02e-05 1 AAGATTTAAGATAC
MDL-1.pwm 28207 + 9 22 3.02e-05 1 ATTATTAAGAATAA
MDL-1.pwm 38986 4 17 3.02e-05 1 ATGAGGAAAAAATA
MDL-1.pwm 33969 25 38 3.21e-05 1 ACAATTTAAAATAA
MDL-1.pwm 31819 + 10 23 3.42e-05 1 ATGATTAAAGAAAC
MDL-1.pwm 35875 8 21 3.42e-05 1 AATAATCAAAACAA
MDL-1.pwm 26918 + 6 19 3.66e-05 1 ATCTTTAAAAACAG
MDL-1.pwm 18759 + 13 26 3.88e-05 1 AAGATTAAAAATCG
MDL-1.pwm 15617 3 16 4.14e-05 1 AGGATTTAAAAGAG
MDL-1.pwm 41611 + 16 29 4.14e-05 1 ATTATAAAAAAGTA
MDL-1.pwm 1600 + 8 21 4.42e-05 1 AATAATATAAATTA
MDL-1.pwm 2350 + 7 20 4.42e-05 1 AACTTTTAAAAGAG
MDL-1.pwm 6373 2 15 4.42e-05 1 ATGATTAAAATTTG
MDL-1.pwm 33167 + 23 36 4.42e-05 1 AGGATTAGAAATAA
MDL-1.pwm 41365 + 14 27 4.42e-05 1 ATCAGTAAAAAGAG
MDL-1.pwm 744 6 19 4.68e-05 1 AAGAGTGAAAAAAG
MDL-1.pwm 3493 13 26 4.68e-05 1 AAGATTCAAAAAAT
MDL-1.pwm 21556 2 15 4.99e-05 1 AACATGTAAATAAA
MDL-1.pwm 34152 + 2 15 4.99e-05 1 AATATATAAAACTA
MDL-1.pwm 40768 + 5 18 4.99e-05 1 AATATTTAGAAAAA
MDL-1.pwm 2930 17 30 5.32e-05 1 AAGATGGAAATTAA
MDL-1.pwm 33350 16 29 5.32e-05 1 ACTATGTAAAATTA
MDL-1.pwm 37390 + 13 26 5.32e-05 1 AACAGTTAAAACAG
MDL-1.pwm 39119 + 9 22 5.32e-05 1 AACATTAAATACAG
MDL-1.pwm 17281 + 1 14 5.65e-05 1 AAGATGGAAAACAG
MDL-1.pwm 258 + 10 23 6.05e-05 1 ATCAATTAAAAGTA
MDL-1.pwm 9273 20 33 6.05e-05 1 ATTATTAAAAGCAA
MDL-1.pwm 12075 + 5 18 6.05e-05 1 AAGAATCAAAATAC
MDL-1.pwm 20545 + 19 32 6.05e-05 1 ATTAATTAAGATAA
MDL-1.pwm 1858 + 23 36 6.4e-05 1 AAGATGAAAATGAG
MDL-1.pwm 5414 + 2 15 6.4e-05 1 ATAAGGAAAAATAA
MDL-1.pwm 10163 12 25 6.4e-05 1 AACAAGTAAAAATA
MDL-1.pwm 33017 + 6 19 6.4e-05 1 AAATTGTAAAATAA
MDL-1.pwm 41611 + 13 26 6.79e-05 1 AGCATTATAAAAAA
MDL-1.pwm 41788 + 14 27 6.79e-05 1 ACTATTAAAACAAA
MDL-1.pwm 1917 + 5 18 7.21e-05 1 ATATTGAAAAAAAA
MDL-1.pwm 3174 22 35 7.21e-05 1 AATTTTAACAACAA
MDL-1.pwm 6974 + 12 25 7.21e-05 1 AATATTTAAAGGAA
MDL-1.pwm 10584 4 17 7.21e-05 1 AAGCTTAAAATGAA
MDL-1.pwm 12287 + 19 32 7.21e-05 1 ATTATTTATAATAA
MDL-1.pwm 33017 + 7 20 7.21e-05 1 AATTGTAAAATAAA
MDL-1.pwm 33923 1 14 7.21e-05 1 AAGACTAAAAAAAC
MDL-1.pwm 32 + 24 37 7.64e-05 1 ATGAATGAAAAAAG
MDL-1.pwm 8362 3 16 7.64e-05 1 ACCATGAAAAACTA
MDL-1.pwm 19366 + 9 22 7.64e-05 1 ACGATGTAAAAAAG
MDL-1.pwm 32852 25 38 7.64e-05 1 ACGATTAAATATAG
MDL-1.pwm 3726 3 16 8.11e-05 1 AGAATTAAAAAAAG
MDL-1.pwm 16752 20 33 8.11e-05 1 ATGATGTAAAAATC
MDL-1.pwm 22083 + 9 22 8.11e-05 1 ACGAATAAAAAGAC
MDL-1.pwm 7272 + 18 31 8.62e-05 1 ATGAATAAAATTAC
MDL-1.pwm 11759 20 33 8.62e-05 1 ATGTTGAAAGAAAA
MDL-1.pwm 14455 + 10 23 8.62e-05 1 ATGATTATAAATTC
MDL-1.pwm 24489 19 32 8.62e-05 1 AACATTGAAATTTA
MDL-1.pwm 15570 5 18 9.12e-05 1 AAGCATAAAAAGTA
MDL-1.pwm 23401 19 32 9.12e-05 1 ACCATTCAAAAGAA
MDL-1.pwm 26410 + 12 25 9.12e-05 1 AAGATTGGAAACAA
MDL-1.pwm 38287 + 17 30 9.12e-05 1 AACGTTAAAAATTA
MDL-1.pwm 11328 11 24 9.65e-05 1 AAGATTATAAATTT
MDL-1.pwm 15737 + 13 26 9.65e-05 1 ATCATAAAAGATAA
MDL-1.pwm 33400 17 30 9.65e-05 1 AAAATTAAAATGTA
MDL-1.pwm 34390 19 32 9.65e-05 1 AATAATATAAAGTA
MDL-1.pwm 3947 + 21 34 0.000103 1 ACCATTTTAAATAA
MDL-1.pwm 4983 + 14 27 0.000103 1 AATATGAAAAAGCA
MDL-1.pwm 5478 14 27 0.000103 1 AGTACTAAAAATAA
MDL-1.pwm 6400 5 18 0.000103 1 ATGAGTATAAAATA
MDL-1.pwm 7402 + 17 30 0.000103 1 AAAAGGTAAAAAAA
MDL-1.pwm 8940 + 7 20 0.000103 1 AGCATTAAAGATTA
MDL-1.pwm 14383 7 20 0.000103 1 AAGATTAGAATGAA
MDL-1.pwm 22194 + 1 14 0.000103 1 AAAATGAAATAAAA
MDL-1.pwm 38989 + 6 19 0.000103 1 AACATTGTAAAGAA
MDL-1.pwm 39825 22 35 0.000103 1 AAGAGGTAAAATTG
MDL-1.pwm 13944 + 21 34 0.000108 1 AGTTGTAAAAACAA
MDL-1.pwm 3726 1 14 0.000115 1 AATTAAAAAAAGAA
MDL-1.pwm 9770 16 29 0.000115 1 ATGTATAAATAAAA
MDL-1.pwm 13671 6 19 0.000115 1 AGTATTCAAAATAG
MDL-1.pwm 14849 1 14 0.000115 1 ATCATGAAAATTAG
MDL-1.pwm 26380 + 23 36 0.000115 1 ATTATTGACAATAA
MDL-1.pwm 34046 21 34 0.000115 1 AAGTTAAAAAATAT
MDL-1.pwm 34682 + 2 15 0.000115 1 AACATTATAATCAA
MDL-1.pwm 37329 2 15 0.000115 1 AACTTTTACAATAA
MDL-1.pwm 1422 + 13 26 0.000122 1 ATAATTAAAAACTC
MDL-1.pwm 4514 + 13 26 0.000122 1 AAGTACAAAAATAA
MDL-1.pwm 6078 + 12 25 0.000122 1 ACGATTTGAAAAAA
MDL-1.pwm 13421 2 15 0.000122 1 ATGTGAAAAAAAAA
MDL-1.pwm 19885 + 1 14 0.000122 1 ACTATTAACAACAA
MDL-1.pwm 20679 + 10 23 0.000122 1 AATATTCACAAAAA
MDL-1.pwm 39932 + 21 34 0.000122 1 ATTTTTATAAATAG
MDL-1.pwm 13314 9 22 0.000128 1 AGTAATTAAAATAC
MDL-1.pwm 18997 + 23 36 0.000128 1 AGTATTTAAACTAA
MDL-1.pwm 25570 19 32 0.000128 1 ATGATTAAGAACTA
MDL-1.pwm 26816 11 24 0.000128 1 AGTATGAAAAAATG
MDL-1.pwm 2316 7 20 0.000136 1 GAGTTTAAAAAAAA
MDL-1.pwm 6282 11 24 0.000136 1 ATCTTTAAAGAATA
MDL-1.pwm 19361 3 16 0.000136 1 AAGATATACAATAA
MDL-1.pwm 19566 + 18 31 0.000136 1 AAGAATTAAATAAC
MDL-1.pwm 21533 + 9 22 0.000136 1 AAGATTTTAAAATC
MDL-1.pwm 26063 + 22 35 0.000136 1 AACATGTAAAATTT
MDL-1.pwm 35364 23 36 0.000136 1 AACCGTAAAAAATA
MDL-1.pwm 4267 11 24 0.000143 1 ATCAAGAAAAATTG
MDL-1.pwm 7213 25 38 0.000143 1 ACTATTTAAAACAT
MDL-1.pwm 9949 + 15 28 0.000143 1 AAGAATACAAAGTA
MDL-1.pwm 18877 23 36 0.000143 1 ACTAATAAAAAAAT
MDL-1.pwm 29484 + 18 31 0.000143 1 AAAATTTAAAAGTC
MDL-1.pwm 845 + 15 28 0.000152 1 AATATTTACATTAA
MDL-1.pwm 8405 + 5 18 0.000152 1 AACATATAAGAAAA
MDL-1.pwm 11213 10 23 0.000152 1 ACGATGATAAACAA
MDL-1.pwm 12049 15 28 0.000152 1 AATTGTAAATAGAA
MDL-1.pwm 29095 + 19 32 0.000152 1 ATCATGAAAAAATT
MDL-1.pwm 34548 25 38 0.000152 1 ACCTTTCAAAATAA
MDL-1.pwm 1742 + 20 33 0.00016 1 ATGATGCAAAAGAG
MDL-1.pwm 2872 4 17 0.00016 1 AATCTTAAAAATTT
MDL-1.pwm 5091 14 27 0.00016 1 AACATTTTAATAAA
MDL-1.pwm 13351 + 22 35 0.00016 1 AACTTTAAAACTAG
MDL-1.pwm 16559 19 32 0.00016 1 AACTTTAAATAAAC
MDL-1.pwm 17953 + 6 19 0.00016 1 ATGATCAAAAATTG
MDL-1.pwm 23233 + 2 15 0.00016 1 AATTTTCAATATAA
MDL-1.pwm 38639 7 20 0.00016 1 ATGATAAAAGAATA
MDL-1.pwm 41246 + 18 31 0.00016 1 ATTAATGAAAAGAG
MDL-1.pwm 778 + 23 36 0.000169 1 AATATTATATATAG
MDL-1.pwm 3287 + 18 31 0.000169 1 AATATTCAAACCAA
MDL-1.pwm 4803 8 21 0.000169 1 AAGATTGTAATTAA
MDL-1.pwm 14442 + 20 33 0.000169 1 ATTATTAACATAAA
MDL-1.pwm 15344 + 24 37 0.000169 1 AATTGTGAAAATAG
MDL-1.pwm 15518 + 5 18 0.000169 1 ATGTTGATAAAGAA
MDL-1.pwm 19068 2 15 0.000169 1 ACTATTTTAAATTA
MDL-1.pwm 31042 + 7 20 0.000169 1 AATAGTTTAAATAG
MDL-1.pwm 32887 25 38 0.000169 1 ACCTTGAAAAAATA
MDL-1.pwm 36068 22 35 0.000169 1 ATTCGTAAAAAATA
MDL-1.pwm 7609 6 19 0.000178 1 AAGAGTAAAATATC
MDL-1.pwm 37418 20 33 0.000178 1 AATATTCAAATCTA
MDL-1.pwm 38906 17 30 0.000178 1 TTTATGAAAAATAA
MDL-1.pwm 4214 + 26 39 0.000189 1 AAGATGGAAAAGTC
MDL-1.pwm 24138 + 19 32 0.000189 1 AATTTTTTAAAAAG
MDL-1.pwm 33320 + 16 29 0.000189 1 ATTAGTATAAAAAG
MDL-1.pwm 34535 9 22 0.000189 1 AAGATAAAATAAAC
MDL-1.pwm 35924 + 18 31 0.000189 1 AACTAGAAAAAAAC
MDL-1.pwm 3769 + 19 32 0.000199 1 ATGAGGATAAACAA
MDL-1.pwm 13482 + 1 14 0.000199 1 AAGTTGTTAAACAA
MDL-1.pwm 29111 + 23 36 0.000199 1 AACATTGAAGACTA
MDL-1.pwm 29164 8 21 0.000199 1 ACTTTATAAAATAA
MDL-1.pwm 30700 1 14 0.000199 1 AACAATTTAAAATA
MDL-1.pwm 36697 + 6 19 0.000199 1 AGGAATTAAAACAC
MDL-1.pwm 4707 + 11 24 0.00021 1 ATCAATAAAACTTA
MDL-1.pwm 12137 + 11 24 0.00021 1 ATTATTGAAACGAA
MDL-1.pwm 13717 + 10 23 0.00021 1 ATTTTGACAAATAA
MDL-1.pwm 15043 + 23 36 0.00021 1 ACTTGTTAAAAGAA
MDL-1.pwm 16552 + 8 21 0.00021 1 AAGAATAAGAATAC
MDL-1.pwm 18565 11 24 0.00021 1 ACGAGTTAAAACAC
MDL-1.pwm 25754 22 35 0.00021 1 AATCAGTAAAAAAA
MDL-1.pwm 35655 8 21 0.00021 1 AAGAATGTAAATTA
MDL-1.pwm 36955 + 10 23 0.00021 1 ACTTTTAAATAGAA
MDL-1.pwm 1416 25 38 0.000222 1 ACGAGTTAAGAAAA
MDL-1.pwm 8082 + 14 27 0.000222 1 ATCATTTAATAGAG
MDL-1.pwm 12090 2 15 0.000222 1 AACCAGAAAAAGAA
MDL-1.pwm 13199 + 12 25 0.000222 1 AACATTAAAGTGTA
MDL-1.pwm 21157 18 31 0.000222 1 AGGAGTAAAAAGAT
MDL-1.pwm 23806 + 20 33 0.000222 1 ATTTTTAAATTTAA
MDL-1.pwm 25190 + 1 14 0.000222 1 ATCCATAAAAATAG
MDL-1.pwm 30593 + 14 27 0.000222 1 ATGATTTAAAAACG
MDL-1.pwm 32066 6 19 0.000222 1 ATCAATCAAAAAAG
MDL-1.pwm 34859 + 20 33 0.000222 1 ATTTGTTAAATTAA
MDL-1.pwm 35964 7 20 0.000222 1 ATTATGTAGAATAA
MDL-1.pwm 7767 13 26 0.000233 1 AACATGATAAATAT
MDL-1.pwm 10713 5 18 0.000233 1 AGCATTGAAAACAG
MDL-1.pwm 11799 16 29 0.000233 1 ATTTTGAAAACAAA
MDL-1.pwm 13349 + 26 39 0.000233 1 AAGAAGTAAAAGTC
MDL-1.pwm 13762 + 6 19 0.000233 1 AAGAGGTTAAAGAA
MDL-1.pwm 16702 3 16 0.000233 1 AAGTTTAGAAATAT
MDL-1.pwm 20466 + 23 36 0.000233 1 AAGTTTAAAATTTT
MDL-1.pwm 22145 + 17 30 0.000233 1 AATATAAAAACATA
MDL-1.pwm 26072 + 9 22 0.000233 1 AAGATGATATAGAA
MDL-1.pwm 28946 18 31 0.000233 1 AATTATAGAAAGAA
MDL-1.pwm 33297 16 29 0.000233 1 ACCATTATAAACTA
MDL-1.pwm 35391 + 13 26 0.000233 1 ATTAGTGAATATAA
MDL-1.pwm 1539 + 7 20 0.000246 1 AAGAGTGAAAATTT
MDL-1.pwm 3936 + 8 21 0.000246 1 ATGATTCGAAAGAA
MDL-1.pwm 5036 + 16 29 0.000246 1 AATCTAAAAAAAAG
MDL-1.pwm 13064 19 32 0.000246 1 ATCATTAACTATAA
MDL-1.pwm 18158 14 27 0.000246 1 ATCAGGATAAAAAA
MDL-1.pwm 19031 + 12 25 0.000246 1 ACTAGTAAATACAA
MDL-1.pwm 20463 + 7 20 0.000246 1 AAGATCTAAAAATG
MDL-1.pwm 20770 + 3 16 0.000246 1 AAGAAGAAAGACAG
MDL-1.pwm 21533 11 24 0.000246 1 ATGATTTTAAAATC
MDL-1.pwm 24156 17 30 0.000246 1 AGTAGTAAAATTTA
MDL-1.pwm 25292 + 20 33 0.000246 1 AAGCTCAAAAACAA
MDL-1.pwm 26924 12 25 0.000246 1 AAGTAAGAAAATAA
MDL-1.pwm 28228 17 30 0.000246 1 AATATGAAGAAAAG
MDL-1.pwm 31078 + 7 20 0.000246 1 AACAGTAAAACAAG
MDL-1.pwm 33107 + 7 20 0.000246 1 AATTGTAATAATAA
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MDL-1.pwm 28686 18 31 0.000471 1 ATCTAAAAAAATAG
MDL-1.pwm 28876 4 17 0.000471 1 AACAAGGTAAATAA
MDL-1.pwm 29482 + 24 37 0.000471 1 ACCTTTAAAATAAG
MDL-1.pwm 29794 + 2 15 0.000471 1 GAGATATAAAATAA
MDL-1.pwm 32981 + 10 23 0.000471 1 AGTTTTTAATACAA
MDL-1.pwm 33783 + 18 31 0.000471 1 AAGATTACATAGAG
MDL-1.pwm 33981 + 26 39 0.000471 1 ATGAGGTAAAAGTC
MDL-1.pwm 36046 + 7 20 0.000471 1 ATGAGAAAAAACAT
MDL-1.pwm 38461 + 2 15 0.000471 1 ACTATAGAAAAATA
MDL-1.pwm 40552 15 28 0.000471 1 AAGATTTAGAAGTG
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MDL-1.pwm 2331 + 16 29 0.000495 1 ACTATTGAAAGTAA
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MDL-1.pwm 20201 + 23 36 0.000495 1 ATCATTCAAGAGTA
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MDL-1.pwm 25715 16 29 0.000495 1 ATGTTTAAATTATA
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MDL-1.pwm 30541 + 7 20 0.000495 1 ATGATGAAGAAGAG
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MDL-1.pwm 34373 + 17 30 0.000495 1 AATAGCTAAAATAC
MDL-1.pwm 35836 + 18 31 0.000495 1 AGGTGGAAAAAAAG
MDL-1.pwm 40151 + 7 20 0.000495 1 AGGAGTAAAAACTT
MDL-1.pwm 1478 16 29 0.000519 1 AAAAAGATAAAGAA
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MDL-1.pwm 3210 6 19 0.000519 1 ATTAATAAAATGTC
MDL-1.pwm 5904 6 19 0.000519 1 AAGAAATGAAAAAA
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MDL-1.pwm 8800 + 22 35 0.000519 1 AATATTAACAGGAA
MDL-1.pwm 9562 + 4 17 0.000519 1 AAGCTGTAAATTTA
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MDL-1.pwm 17225 23 36 0.000519 1 AAGATGAAAGGGAA
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MDL-1.pwm 22050 + 20 33 0.000519 1 ATCTAGTAAAATAC
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MDL-1.pwm 14514 23 36 0.000571 1 AATCATTTAAAAAA
MDL-1.pwm 14519 21 34 0.000571 1 AAGATTAAAGACCG
MDL-1.pwm 14726 25 38 0.000571 1 ACGTTTTAAATCTA
MDL-1.pwm 15576 + 13 26 0.000571 1 ATGCTGAAAATATA
MDL-1.pwm 16559 20 33 0.000571 1 AAACTTTAAATAAA
MDL-1.pwm 17898 + 16 29 0.000571 1 AGTATACAAAATTA
MDL-1.pwm 20348 + 24 37 0.000571 1 AATATGTTAAACTG
MDL-1.pwm 22145 + 16 29 0.000571 1 AAATATAAAAACAT
MDL-1.pwm 24440 + 2 15 0.000571 1 AACATTTTAAGAAA
MDL-1.pwm 35250 + 15 28 0.000571 1 AATATTAAACAATG
MDL-1.pwm 38348 17 30 0.000571 1 ATGATGGTAAATAC
MDL-1.pwm 39940 16 29 0.000571 1 AAGATTGAACATTA
MDL-1.pwm 40346 8 21 0.000571 1 ATTTTTAAATACAT
MDL-1.pwm 41091 + 14 27 0.000571 1 GAAAATAAAAATAA
MDL-1.pwm 41858 7 20 0.000571 1 AGCATGTAAAAGTG
MDL-1.pwm 5005 17 30 0.000598 1 ATGATGCAAATAAG
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MDL-1.pwm 8313 + 16 29 0.000598 1 AAGATGAAACACTA
MDL-1.pwm 11079 + 12 25 0.000598 1 AACTTGTGAAAGAA
MDL-1.pwm 11336 11 24 0.000598 1 AGCACTTAAAACAA
MDL-1.pwm 11613 14 27 0.000598 1 ACTATTAAAATATT
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MDL-1.pwm 13147 + 16 29 0.000598 1 AATATGAGAATTAG
MDL-1.pwm 13671 7 20 0.000598 1 AAGTATTCAAAATA
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MDL-1.pwm 24861 7 20 0.000598 1 ATTATGCAAAACTC
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MDL-1.pwm 39733 16 29 0.000598 1 ATCTGTAAATATAG
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MDL-1.pwm 8434 1 14 0.000627 1 AACAATAAAGCGAA
MDL-1.pwm 11428 4 17 0.000627 1 ATAAGGTAAAAGTA
MDL-1.pwm 13323 16 29 0.000627 1 ACCAATTAAAAGAT
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MDL-1.pwm 14615 + 7 20 0.000627 1 AATTGATAAAAGTA
MDL-1.pwm 14684 + 20 33 0.000627 1 AAGTAGCAAAAGTA
MDL-1.pwm 17101 + 20 33 0.000627 1 AGTGATAAAAAAAA
MDL-1.pwm 19068 + 3 16 0.000627 1 AATTTAAAATAGTA
MDL-1.pwm 21608 16 29 0.000627 1 ACTAGTCAAAAAAC
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MDL-1.pwm 23655 + 5 18 0.000627 1 ACTTGTAAAACTAA
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MDL-1.pwm 28166 20 33 0.000627 1 ACCAAGAAAATCAA
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MDL-1.pwm 32560 11 24 0.000627 1 AACATGCAAAAATT
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MDL-1.pwm 3837 4 17 0.000688 1 AATTAGACAAAGAA
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MDL-1.pwm 33383 8 21 0.000688 1 AAACATTAAAAATA
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MDL-1.pwm 37712 + 1 14 0.000688 1 ATGATGGAAACTAG
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MDL-1.pwm 9154 9 22 0.00072 1 ATGTGGACAAAAAA
MDL-1.pwm 12241 + 24 37 0.00072 1 AATAGTCAATAAAG
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MDL-1.pwm 15186 7 20 0.00072 1 ATTATCTAAGAGAA
MDL-1.pwm 15374 27 40 0.00072 1 AGACGTAAAAATAA
MDL-1.pwm 17127 + 17 30 0.00072 1 AATTTGGAAAACTC
MDL-1.pwm 17290 + 19 32 0.00072 1 AGGTGTAGAAAAAA
MDL-1.pwm 18681 + 7 20 0.00072 1 ATCTTTTAAACAAG
MDL-1.pwm 18836 7 20 0.00072 1 AAGATTAACAACGA
MDL-1.pwm 20022 7 20 0.00072 1 AGTTTGAAATATTA
MDL-1.pwm 20159 17 30 0.00072 1 ATAATTTAGAATTA
MDL-1.pwm 20275 22 35 0.00072 1 ATGCTTATAAAGAC
MDL-1.pwm 21448 11 24 0.00072 1 ATGATGAAACATAG
MDL-1.pwm 22892 + 10 23 0.00072 1 ACGATGAAAACCAG
MDL-1.pwm 26303 25 38 0.00072 1 ACACTTTAAAACAA
MDL-1.pwm 26432 + 16 29 0.00072 1 ACTAATAGAAATAC
MDL-1.pwm 28132 + 16 29 0.00072 1 ACTAAAATAAATAA
MDL-1.pwm 30575 10 23 0.00072 1 AGCATTAAAATCTC
MDL-1.pwm 33037 + 7 20 0.00072 1 AATAGTAAGTAAAA
MDL-1.pwm 41246 + 15 28 0.00072 1 AAAATTAATGAAAA
MDL-1.pwm 41843 4 17 0.00072 1 ATGAGGCTAAATAA
MDL-1.pwm 330 + 20 33 0.000754 1 GAGATTGAAAAGTA
MDL-1.pwm 875 18 31 0.000754 1 AACATTTCAGATAG
MDL-1.pwm 1323 + 17 30 0.000754 1 AAGTGGAAAATCAG
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MDL-1.pwm 4113 23 36 0.000754 1 AGCCTGAAAAAAAG
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MDL-1.pwm 9604 25 38 0.000754 1 ACGAAGAGAAACAA
MDL-1.pwm 12206 + 3 16 0.000754 1 ATGTAGGAAAACTA
MDL-1.pwm 13945 + 12 25 0.000754 1 AATACAAAAAACAG
MDL-1.pwm 14627 11 24 0.000754 1 AAGAATATAATTAT
MDL-1.pwm 15100 3 16 0.000754 1 ATGAATAACGATTA
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MDL-1.pwm 15430 + 14 27 0.000754 1 AATATTATAGTATA
MDL-1.pwm 16760 + 2 15 0.000754 1 ATCAAGAAATAAAC
MDL-1.pwm 17730 12 25 0.000754 1 ACTACTTAAAAAAG
MDL-1.pwm 18356 15 28 0.000754 1 ATTATTAGAACATA
MDL-1.pwm 18830 3 16 0.000754 1 AAAATGTAAAACTT
MDL-1.pwm 19448 + 18 31 0.000754 1 GCGATTTAAAATTA
MDL-1.pwm 19934 + 2 15 0.000754 1 TATATGATAAATAA
MDL-1.pwm 20106 + 1 14 0.000754 1 AAGTTGATAACAAA
MDL-1.pwm 20985 + 20 33 0.000754 1 ATCATTTAAGTCTA
MDL-1.pwm 23935 13 26 0.000754 1 ATCATTAAAACACA
MDL-1.pwm 24426 20 33 0.000754 1 AGGATGGAAAACTG
MDL-1.pwm 24471 16 29 0.000754 1 AAGTGTTAAGTAAA
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MDL-1.pwm 12318 6 19 0.000944 1 ATGAATAAGATCAA
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MDL-1.pwm 13444 23 36 0.000944 1 AATATTTAGATTAC
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MDL-1.pwm 15045 + 13 26 0.000944 1 AATCTGATAAAAAC
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MDL-1.pwm 17021 + 17 30 0.000944 1 AATAATGAATAATG
MDL-1.pwm 17110 20 33 0.000944 1 ACCCTTTTAAATAA
MDL-1.pwm 17288 + 8 21 0.000944 1 AAGTATAAAGAATT
MDL-1.pwm 17918 + 21 34 0.000944 1 AATTTTTATTATAA
MDL-1.pwm 17918 20 33 0.000944 1 TATAATAAAAATTC
MDL-1.pwm 18343 + 2 15 0.000944 1 ATGATAACAGAAAA
MDL-1.pwm 18772 + 10 23 0.000944 1 AGTAATGAAGAGAA
MDL-1.pwm 18833 22 35 0.000944 1 ATGTTTACAATTAG
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MDL-1.pwm 19060 + 11 24 0.000944 1 AATAGTAAATGGAA
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MDL-1.pwm 23526 + 1 14 0.000944 1 ATCCTGTAAAACAC
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MDL-1.pwm 25586 + 12 25 0.000944 1 AGGGTTTAAAATAC
MDL-1.pwm 26924 11 24 0.000944 1 AGTAAGAAAATAAG
MDL-1.pwm 27791 25 38 0.000944 1 ACTATTAAAACTTT
MDL-1.pwm 28347 14 27 0.000944 1 AATATCAACAACTA
MDL-1.pwm 28590 + 24 37 0.000944 1 AAGGTTCAAAACAG
MDL-1.pwm 29214 9 22 0.000944 1 ATGATTACATTAAA
MDL-1.pwm 31129 + 1 14 0.000944 1 ATGATGTATAAGAG
MDL-1.pwm 31185 4 17 0.000944 1 ATCTTGTAAACGAA
MDL-1.pwm 31522 11 24 0.000944 1 AATATAACAATGAA
MDL-1.pwm 34775 9 22 0.000944 1 AAGTTAGAAATTTA
MDL-1.pwm 34801 + 14 27 0.000944 1 AAGTAGTAAATCTA
MDL-1.pwm 35349 11 24 0.000944 1 ATCAATTAAATATC
MDL-1.pwm 37223 9 22 0.000944 1 AATATTGAATCTTA
MDL-1.pwm 38198 + 4 17 0.000944 1 ATAAGTAGAAATAG
MDL-1.pwm 38718 20 33 0.000944 1 AAGATTTTACAAAA
MDL-1.pwm 39367 + 17 30 0.000944 1 AACATTTAATCAAG
MDL-1.pwm 40580 + 7 20 0.000944 1 AATGTTATAAACTA
MDL-1.pwm 40916 2 15 0.000944 1 ATGATATAATATAT
MDL-1.pwm 41328 + 15 28 0.000944 1 ATTAGTAATTATAA
MDL-1.pwm 41861 14 27 0.000944 1 ATCTTAGAAAATAC
MDL-1.pwm 803 16 29 0.000987 1 AAGAATACAGAAAC
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MDL-1.pwm 3275 + 14 27 0.000987 1 AGGATTACAGAATA
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MDL-1.pwm 6056 21 34 0.000987 1 AGGTATAAAACTTA
MDL-1.pwm 8605 + 13 26 0.000987 1 AACTTTCAAATCAG
MDL-1.pwm 9114 19 32 0.000987 1 ACCATTTAAGCTAA
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MDL-1.pwm 19140 3 16 0.000987 1 ATCTATAAAGTAAA
MDL-1.pwm 20936 15 28 0.000987 1 AATATTTATACGAA
MDL-1.pwm 21739 2 15 0.000987 1 ACGAGGAAGAAAAA
MDL-1.pwm 21755 + 18 31 0.000987 1 ACGTTTAGATATAA
MDL-1.pwm 22127 + 7 20 0.000987 1 AAGAAGGAATACTA
MDL-1.pwm 24564 + 23 36 0.000987 1 AAGCTTTAAAAGGA
MDL-1.pwm 25023 + 18 31 0.000987 1 ATGATTGGAACTAA
MDL-1.pwm 25234 12 25 0.000987 1 ATTTTTCAAACTTA
MDL-1.pwm 25284 + 6 19 0.000987 1 ACGAGGAAATAAAG
MDL-1.pwm 25881 16 29 0.000987 1 ATGCATTAAAACTG
MDL-1.pwm 27118 + 11 24 0.000987 1 AGGACGTAAAATTA
MDL-1.pwm 28611 4 17 0.000987 1 AACATTAACGATTC
MDL-1.pwm 30249 + 19 32 0.000987 1 ATTATTAGAGACAC
MDL-1.pwm 30415 + 8 21 0.000987 1 AAGTGTGGAAAGAA
MDL-1.pwm 30827 12 25 0.000987 1 AACATGTAGAAGAG
MDL-1.pwm 31303 + 10 23 0.000987 1 ACGTGTTGAAATAA
MDL-1.pwm 31656 21 34 0.000987 1 ACGTTACAAAAGAA
MDL-1.pwm 33091 + 6 19 0.000987 1 ACTATTGAGAACAA
MDL-1.pwm 34321 3 16 0.000987 1 ATGAATGAAATTTC
MDL-1.pwm 35080 4 17 0.000987 1 AACTTTACAAATTT
MDL-1.pwm 35828 12 25 0.000987 1 AGGATGTTAAAGAG
MDL-1.pwm 36540 14 27 0.000987 1 ATGAAAAGAAATAG
MDL-1.pwm 37095 + 2 15 0.000987 1 ATGCAGATAAAAAA
MDL-1.pwm 37223 + 17 30 0.000987 1 AATATTTATACCAA
MDL-1.pwm 37567 8 21 0.000987 1 ATTAGTGTAAACTA
MDL-1.pwm 38117 21 34 0.000987 1 AACCTTCAAATCAA

DEBUGGING INFORMATION

Command line:

/home/yang23/programs/meme_4.9.0/bin/fimo -oc /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/shuffled -thresh 0.001 /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/pwm.fimo /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/uniprobes.shuffled.fasta

Settings:

output directory = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/shuffled MEME file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/pwm.fimo sequence file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss0i8r3q7sl25lq08sfc3o4o89mtkdqatvpe6h94qjddce8bd3c401/uniprobes.shuffled.fasta
allow clobber = true compute q-values = true text only = false
scan both strands = true max sequence length = 250000000 output threshold = 0.001
threshold type = p-value max stored scores = 100000 pseudocount = 0.1
verbosity = 2

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.


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