| Database and Motifs | High-scoring Motif Occurences | Debugging Information |
FIMO version 4.9.0, (Release date: 6 EST 20)
For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net
If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble,
"FIMO: Scanning for occurrences of a given motif",
Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011.
DATABASE
/srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss4k3ivtrd4d1r9f60k1aadf3gocg29f8rijqor0olg861f1q83c60/uniprobes.descend.fasta
Database contains
37664
sequences,
2259840
residues
MOTIFS /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss4k3ivtrd4d1r9f60k1aadf3gocg29f8rijqor0olg861f1q83c60/pwm.fimo (nucleotide)
| MOTIF | WIDTH | BEST POSSIBLE MATCH |
|---|---|---|
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 9 | GGTGTGAAC |
Random model letter frequencies
(from non-redundant database):
A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275
| Motif | Sequence Name | Strand | Start | End | p-value | q-value | Matched Sequence |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 6 | + | 28 | 36 | 3.31e-06 | 1 | GGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 9 | + | 18 | 26 | 3.31e-06 | 1 | GGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 24 | − | 11 | 19 | 3.31e-06 | 1 | GGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 31 | + | 15 | 23 | 3.31e-06 | 1 | GGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 87 | + | 4 | 12 | 3.31e-06 | 1 | GGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 88 | − | 25 | 33 | 3.31e-06 | 1 | GGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 426 | + | 3 | 11 | 3.31e-06 | 1 | GGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3321 | − | 28 | 36 | 3.31e-06 | 1 | GGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3367 | − | 25 | 33 | 3.31e-06 | 1 | GGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1 | + | 5 | 13 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 13 | − | 17 | 25 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 18 | + | 23 | 31 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 95 | + | 23 | 31 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 100 | − | 8 | 16 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 113 | − | 3 | 11 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 134 | − | 2 | 10 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 175 | + | 11 | 19 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 509 | − | 24 | 32 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 715 | + | 8 | 16 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1383 | − | 5 | 13 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2009 | + | 25 | 33 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2435 | − | 28 | 36 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2702 | + | 3 | 11 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 5100 | + | 28 | 36 | 1.14e-05 | 1 | GGTGTGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 94 | + | 14 | 22 | 1.47e-05 | 1 | GGTGTGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 116 | − | 27 | 35 | 1.47e-05 | 1 | GGTGTGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 145 | − | 2 | 10 | 1.47e-05 | 1 | GGTGTGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 174 | + | 18 | 26 | 1.47e-05 | 1 | GGTGTGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 183 | − | 2 | 10 | 1.47e-05 | 1 | GGTGTGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1208 | − | 27 | 35 | 1.47e-05 | 1 | GGTGTGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1579 | − | 8 | 16 | 1.47e-05 | 1 | GGTGTGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1637 | + | 1 | 9 | 1.47e-05 | 1 | GGTGTGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1682 | + | 29 | 37 | 1.47e-05 | 1 | GGTGTGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2794 | + | 26 | 34 | 1.47e-05 | 1 | GGTGTGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 35 | − | 3 | 11 | 1.74e-05 | 1 | GGTGCGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 45 | + | 22 | 30 | 1.74e-05 | 1 | GGTGCGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 153 | + | 8 | 16 | 1.74e-05 | 1 | GGTGCGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 442 | − | 20 | 28 | 1.74e-05 | 1 | GGTGCGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 477 | + | 4 | 12 | 1.74e-05 | 1 | GGTGCGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 705 | + | 27 | 35 | 1.74e-05 | 1 | GGTGCGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 806 | − | 23 | 31 | 1.74e-05 | 1 | GGTGCGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1591 | − | 27 | 35 | 1.74e-05 | 1 | GGTGCGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2495 | − | 15 | 23 | 1.74e-05 | 1 | GGTGCGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3115 | − | 28 | 36 | 1.74e-05 | 1 | GGTGCGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 67 | − | 17 | 25 | 2.01e-05 | 1 | GGTGTGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 251 | − | 18 | 26 | 2.01e-05 | 1 | GGTGTGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 332 | − | 16 | 24 | 2.01e-05 | 1 | GGTGTGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 824 | + | 2 | 10 | 2.01e-05 | 1 | GGTGTGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1237 | + | 23 | 31 | 2.01e-05 | 1 | GGTGTGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1517 | + | 23 | 31 | 2.01e-05 | 1 | GGTGTGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 5759 | + | 27 | 35 | 2.01e-05 | 1 | GGTGTGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 11134 | − | 10 | 18 | 2.01e-05 | 1 | GGTGTGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 36 | − | 6 | 14 | 2.28e-05 | 1 | GGTGTGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 118 | + | 24 | 32 | 2.28e-05 | 1 | GGTGTGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 473 | − | 3 | 11 | 2.28e-05 | 1 | GGTGTGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1693 | + | 25 | 33 | 2.28e-05 | 1 | GGTGTGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1884 | − | 12 | 20 | 2.28e-05 | 1 | GGTGTGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3886 | + | 8 | 16 | 2.28e-05 | 1 | GGTGTGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 17345 | − | 28 | 36 | 2.28e-05 | 1 | GGTGTGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 11 | + | 12 | 20 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 17 | − | 20 | 28 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTCAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 25 | − | 22 | 30 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 47 | − | 15 | 23 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 109 | + | 7 | 15 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 157 | + | 25 | 33 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTCAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 164 | + | 6 | 14 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 188 | − | 18 | 26 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 200 | + | 3 | 11 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTCAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 234 | − | 5 | 13 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 259 | + | 4 | 12 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTCAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 304 | − | 14 | 22 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 322 | + | 7 | 15 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 326 | − | 8 | 16 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 401 | + | 3 | 11 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 581 | + | 28 | 36 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 585 | − | 21 | 29 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTCAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 639 | + | 23 | 31 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 662 | − | 10 | 18 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTCAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 840 | + | 19 | 27 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTCAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 856 | + | 28 | 36 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTCAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 968 | − | 7 | 15 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1076 | − | 17 | 25 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1150 | + | 24 | 32 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1223 | + | 12 | 20 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1305 | − | 9 | 17 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1800 | − | 20 | 28 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3500 | + | 2 | 10 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 4620 | − | 1 | 9 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 6192 | + | 25 | 33 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 7353 | − | 26 | 34 | 3.61e-05 | 1 | GGTGTGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 8332 | + | 27 | 35 | 3.61e-05 | 1 | GGTGCGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 389 | + | 19 | 27 | 3.88e-05 | 1 | GGTGCGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 448 | − | 24 | 32 | 3.88e-05 | 1 | GGTGCGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 522 | + | 12 | 20 | 3.88e-05 | 1 | GGTGCGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1032 | − | 1 | 9 | 3.88e-05 | 1 | GGTGCGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3810 | − | 26 | 34 | 3.88e-05 | 1 | GGTGCGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 13994 | + | 29 | 37 | 3.88e-05 | 1 | GGTGCGAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3 | + | 3 | 11 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 10 | + | 19 | 27 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 39 | + | 10 | 18 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 71 | − | 18 | 26 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 90 | − | 9 | 17 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 137 | + | 4 | 12 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 220 | + | 4 | 12 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 305 | − | 15 | 23 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 347 | + | 30 | 38 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 403 | + | 14 | 22 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 502 | − | 15 | 23 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 566 | + | 8 | 16 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 694 | + | 28 | 36 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 799 | − | 11 | 19 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1313 | + | 14 | 22 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1344 | − | 9 | 17 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1589 | − | 19 | 27 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3483 | − | 19 | 27 | 4.54e-05 | 1 | GGTGTGAGT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 4 | − | 4 | 12 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTTAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 53 | + | 3 | 11 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 56 | − | 10 | 18 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 60 | + | 14 | 22 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 74 | − | 3 | 11 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 119 | + | 27 | 35 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 126 | − | 20 | 28 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 178 | + | 15 | 23 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 213 | + | 2 | 10 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 245 | − | 12 | 20 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 288 | − | 24 | 32 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 343 | + | 28 | 36 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 392 | − | 7 | 15 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTTAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 397 | + | 26 | 34 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTTAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 558 | + | 22 | 30 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTTAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 755 | + | 2 | 10 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 761 | + | 26 | 34 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 860 | − | 11 | 19 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 882 | + | 6 | 14 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTTAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 892 | − | 20 | 28 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 985 | − | 16 | 24 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1000 | + | 15 | 23 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1085 | − | 11 | 19 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1394 | + | 15 | 23 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1492 | + | 21 | 29 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2216 | − | 4 | 12 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2332 | − | 11 | 19 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTTAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2347 | − | 23 | 31 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2512 | + | 1 | 9 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3056 | + | 29 | 37 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3413 | − | 25 | 33 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3660 | + | 29 | 37 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 4059 | − | 28 | 36 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 6417 | − | 27 | 35 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTTAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 6972 | + | 15 | 23 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGACA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 9219 | + | 21 | 29 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTGAGG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 10376 | + | 1 | 9 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTTAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 12572 | − | 2 | 10 | 5.88e-05 | 1 | GGTGTTAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 33 | + | 5 | 13 | 6.77e-05 | 1 | AGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 97 | − | 9 | 17 | 6.77e-05 | 1 | AGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 176 | + | 15 | 23 | 6.77e-05 | 1 | GGTGCGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 201 | − | 10 | 18 | 6.77e-05 | 1 | GGTGTGACG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 224 | − | 12 | 20 | 6.77e-05 | 1 | GGTGCGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 242 | + | 3 | 11 | 6.77e-05 | 1 | GGTGTGACG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 330 | + | 15 | 23 | 6.77e-05 | 1 | AGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 406 | − | 15 | 23 | 6.77e-05 | 1 | AGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 412 | − | 13 | 21 | 6.77e-05 | 1 | AGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 430 | − | 5 | 13 | 6.77e-05 | 1 | GGTGCGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 539 | − | 9 | 17 | 6.77e-05 | 1 | AGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1104 | + | 11 | 19 | 6.77e-05 | 1 | AGTGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1452 | + | 13 | 21 | 6.77e-05 | 1 | GGTGTGACG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1976 | + | 28 | 36 | 6.77e-05 | 1 | GGTGTGACG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2130 | − | 8 | 16 | 6.77e-05 | 1 | GGTGCGAGC |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3735 | − | 21 | 29 | 6.77e-05 | 1 | GGTGTGACG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 5803 | + | 9 | 17 | 6.77e-05 | 1 | GGTGCGAGC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 11219 | − | 18 | 26 | 6.77e-05 | 1 | GGTGTGACG |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 80 | + | 9 | 17 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 81 | − | 6 | 14 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 83 | + | 14 | 22 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 89 | − | 9 | 17 | 8.61e-05 | 1 | GGTGCGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 127 | + | 25 | 33 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 232 | − | 15 | 23 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 308 | − | 15 | 23 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 310 | − | 17 | 25 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 313 | − | 23 | 31 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 378 | + | 3 | 11 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 452 | − | 6 | 14 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 484 | + | 16 | 24 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 523 | − | 18 | 26 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 617 | + | 3 | 11 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 636 | − | 14 | 22 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 677 | − | 6 | 14 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 687 | + | 22 | 30 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 719 | + | 6 | 14 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 729 | − | 24 | 32 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 845 | + | 28 | 36 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 939 | + | 4 | 12 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1265 | + | 23 | 31 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1516 | − | 1 | 9 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2185 | + | 3 | 11 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2260 | − | 10 | 18 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2328 | − | 17 | 25 | 8.61e-05 | 1 | GGTGCGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2725 | + | 28 | 36 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2727 | + | 28 | 36 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3322 | + | 18 | 26 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 4005 | + | 27 | 35 | 8.61e-05 | 1 | GGTGCGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 4684 | − | 12 | 20 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 4929 | + | 14 | 22 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTGATA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 5695 | − | 13 | 21 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 5841 | + | 26 | 34 | 8.61e-05 | 1 | GGTGCGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 6947 | − | 17 | 25 | 8.61e-05 | 1 | GGTGCGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 7121 | − | 26 | 34 | 8.61e-05 | 1 | GGTGTCAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 8763 | + | 19 | 27 | 8.61e-05 | 1 | GGTGCGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 9347 | + | 2 | 10 | 8.61e-05 | 1 | GGTGCGACC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 76 | + | 5 | 13 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTCAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 106 | − | 14 | 22 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGGAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 121 | − | 21 | 29 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGATG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 160 | − | 19 | 27 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTCAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 236 | + | 26 | 34 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGATG |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 683 | − | 15 | 23 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGATG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 921 | + | 22 | 30 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGATG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1114 | + | 25 | 33 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTCAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1375 | − | 8 | 16 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGGAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1399 | − | 14 | 22 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGGAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1657 | − | 19 | 27 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTCAAG |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2389 | + | 18 | 26 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTCAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2411 | + | 26 | 34 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGATG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2806 | − | 3 | 11 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTCAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2907 | + | 12 | 20 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGGAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3278 | − | 23 | 31 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTCAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 4753 | − | 28 | 36 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTCAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 5017 | + | 8 | 16 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGATG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 5823 | + | 1 | 9 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGATG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 7107 | − | 10 | 18 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGATG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 7452 | − | 19 | 27 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGATG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 7520 | + | 29 | 37 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTCAAG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 11096 | − | 27 | 35 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGGAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 11612 | − | 23 | 31 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGGAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 14625 | − | 16 | 24 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGGAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 37341 | + | 27 | 35 | 9.54e-05 | 1 | GGTGTGGAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 46 | − | 12 | 20 | 0.000104 | 1 | GGTGAGAAC |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 122 | + | 19 | 27 | 0.000104 | 1 | GGTGAGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 124 | + | 3 | 11 | 0.000104 | 1 | GGTGCGATC |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 676 | − | 22 | 30 | 0.000104 | 1 | GGTGCGATC |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1481 | + | 23 | 31 | 0.000104 | 1 | GGTGCGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2884 | − | 10 | 18 | 0.000104 | 1 | GGTGCGATC |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3686 | + | 20 | 28 | 0.000104 | 1 | GGTGCCAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3866 | − | 27 | 35 | 0.000104 | 1 | GGTGAGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 4229 | + | 12 | 20 | 0.000104 | 1 | GGTGCGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 4421 | + | 8 | 16 | 0.000104 | 1 | GGTGCGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 5388 | − | 21 | 29 | 0.000104 | 1 | GGTGCGATC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 10649 | − | 6 | 14 | 0.000104 | 1 | GGTGCCAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 11064 | − | 20 | 28 | 0.000104 | 1 | GGTGCCAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 14431 | − | 28 | 36 | 0.000104 | 1 | GGTGAGAAC |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1490 | − | 28 | 36 | 0.000117 | 1 | GGTGTTAAT |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2013 | + | 2 | 10 | 0.000117 | 1 | GGTGTTAAA |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2270 | − | 11 | 19 | 0.000117 | 1 | GGCGTGAAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2362 | + | 27 | 35 | 0.000117 | 1 | GGTGTTAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2559 | − | 10 | 18 | 0.000117 | 1 | GGTGTTAAT |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2768 | − | 13 | 21 | 0.000117 | 1 | GGTGTTAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 2869 | + | 25 | 33 | 0.000117 | 1 | GGTGTTAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 3621 | + | 1 | 9 | 0.000117 | 1 | GGTGTTAAA |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 325 | + | 12 | 20 | 0.000139 | 1 | AGTGTGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 327 | + | 21 | 29 | 0.000139 | 1 | GGTGTTAAG |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 374 | − | 20 | 28 | 0.000231 | 1 | GGTGCGATG |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 1006 | + | 14 | 22 | 0.000231 | 1 | GGCGTGAAT |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 257 | + | 24 | 32 | 0.000279 | 1 | GGTGTCACT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 276 | − | 19 | 27 | 0.000279 | 1 | TGTGTGAAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 283 | + | 4 | 12 | 0.000279 | 1 | GGTGTCACT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 284 | − | 11 | 19 | 0.000279 | 1 | TGTGTGAAA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 290 | + | 4 | 12 | 0.000279 | 1 | GGTGTTATC |
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| SpTbr_rep1.bml.pwm | 7953 | + | 18 | 26 | 0.000396 | 1 | GGTGCGGAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 7985 | + | 1 | 9 | 0.000396 | 1 | GGTGTGGTC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 7999 | − | 3 | 11 | 0.000396 | 1 | GGTGTTACA |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 8025 | + | 31 | 39 | 0.000396 | 1 | GGTGTGGTC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 8233 | + | 26 | 34 | 0.000396 | 1 | GGTGTCATG |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 9195 | + | 31 | 39 | 0.000396 | 1 | GGTGTGGTC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 9430 | + | 12 | 20 | 0.000396 | 1 | GGTGCGGAT |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 9433 | + | 18 | 26 | 0.000396 | 1 | GGTGTGGTC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 9876 | − | 25 | 33 | 0.000396 | 1 | GGTGTCGAC |
| SpTbr_rep1.bml.pwm | 9909 | + | 31 | 39 | 0.000396 | 1 | GGTGTGGTC |
Command line:
/home/yang23/programs/meme_4.9.0/bin/fimo -oc /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss4k3ivtrd4d1r9f60k1aadf3gocg29f8rijqor0olg861f1q83c60/descend -thresh 0.001 /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss4k3ivtrd4d1r9f60k1aadf3gocg29f8rijqor0olg861f1q83c60/pwm.fimo /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss4k3ivtrd4d1r9f60k1aadf3gocg29f8rijqor0olg861f1q83c60/uniprobes.descend.fasta
Settings:
| output directory = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss4k3ivtrd4d1r9f60k1aadf3gocg29f8rijqor0olg861f1q83c60/descend | MEME file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss4k3ivtrd4d1r9f60k1aadf3gocg29f8rijqor0olg861f1q83c60/pwm.fimo | sequence file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/ss4k3ivtrd4d1r9f60k1aadf3gocg29f8rijqor0olg861f1q83c60/uniprobes.descend.fasta |
| allow clobber = true | compute q-values = true | text only = false |
| scan both strands = true | max sequence length = 250000000 | output threshold = 0.001 |
| threshold type = p-value | max stored scores = 100000 | pseudocount = 0.1 |
| verbosity = 2 |
This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.