Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information



FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.9.0, (Release date: 6 EST 20)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011.


DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/sskke6k3ia8m87u6s67rs92oeu8k3qmh33l73vlkf980h9a7vrjra1/uniprobes.shuffled.fasta
Database contains 41840 sequences, 2510400 residues

MOTIFS /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/sskke6k3ia8m87u6s67rs92oeu8k3qmh33l73vlkf980h9a7vrjra1/pwm.fimo (nucleotide)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
Pdp1.pwm 22 CATATTGTTATATAACTTGATC

Random model letter frequencies (from non-redundant database):
A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275


SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES

Motif Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
Pdp1.pwm 24953 + 20 41 2.49e-06 1 CCGATTCTTACATAATCGTCTG
Pdp1.pwm 26161 17 38 2.49e-06 1 ACGATTCTTATATAAGTCGCAA
Pdp1.pwm 38373 + 3 24 2.49e-06 1 ACGCCCGTTACGTAACTTGGAC
Pdp1.pwm 37144 17 38 3.87e-06 1 ACGCGTATTATATAACGGTGAG
Pdp1.pwm 23697 + 18 39 4.3e-06 1 CCTAAACTTATGTAATCATGTC
Pdp1.pwm 26452 3 24 5.25e-06 1 ATCATCGTTATATAATTGTCCA
Pdp1.pwm 7767 + 6 27 5.78e-06 1 GCTGGCATTACATAACCTGATA
Pdp1.pwm 13705 + 19 40 5.78e-06 1 ACTCGGGTTATATAACTGGTCT
Pdp1.pwm 1100 22 43 6.34e-06 1 CACAGACTTACGTAACAACATA
Pdp1.pwm 37144 + 17 38 7.6e-06 1 CTCACCGTTATATAATACGCGT
Pdp1.pwm 37208 + 16 37 8.29e-06 1 CTGAGTGTTGTATAACCGGCTG
Pdp1.pwm 27436 16 37 9.03e-06 1 CACTTCCTTATATAACCCGTGA
Pdp1.pwm 1366 12 33 1.06e-05 1 CTCCGGCTTACATAACGAGTGA
Pdp1.pwm 5261 15 36 1.15e-05 1 GATGTGCTTATGTAACCTGGGA
Pdp1.pwm 4733 + 8 29 1.24e-05 1 AAAGGAGTTACATAATTGTTGC
Pdp1.pwm 28902 + 22 43 1.24e-05 1 AACGCTGTTATGTAAGTCTGTG
Pdp1.pwm 5559 17 38 1.34e-05 1 ACAGTTATTACGTAACCCTTAG
Pdp1.pwm 40534 14 35 1.34e-05 1 ATCGCGGTTACATAATCGCCGC
Pdp1.pwm 28581 16 37 1.44e-05 1 CATTGCGTTACGTAATACTACA
Pdp1.pwm 28902 22 43 1.44e-05 1 CACAGACTTACATAACAGCGTT
Pdp1.pwm 5877 20 41 1.55e-05 1 CAGACCTTTACATAACCTTCAC
Pdp1.pwm 1100 + 22 43 1.66e-05 1 TATGTTGTTACGTAAGTCTGTG
Pdp1.pwm 28581 + 16 37 1.66e-05 1 TGTAGTATTACGTAACGCAATG
Pdp1.pwm 3306 21 42 1.78e-05 1 ACAGACATTATATAATACGTTC
Pdp1.pwm 7767 6 27 1.78e-05 1 TATCAGGTTATGTAATGCCAGC
Pdp1.pwm 29176 + 22 43 1.78e-05 1 CGGTCTGTTACATAAGTCTGTG
Pdp1.pwm 39100 + 4 25 1.78e-05 1 ATCCTTCTTATGTAACGTATGA
Pdp1.pwm 3820 11 32 2.04e-05 1 TGGACGATTACGTAATTGGGTC
Pdp1.pwm 9530 20 41 2.17e-05 1 CAGACTCTTACGTAAGAGGAAA
Pdp1.pwm 13705 19 40 2.17e-05 1 AGACCAGTTATATAACCCGAGT
Pdp1.pwm 12216 + 3 24 2.31e-05 1 CCCGACATTATATAAGTCGATT
Pdp1.pwm 29176 22 43 2.61e-05 1 CACAGACTTATGTAACAGACCG
Pdp1.pwm 32923 + 11 32 2.77e-05 1 CCAGTGATTACGTAAGTACGAA
Pdp1.pwm 5559 + 17 38 2.94e-05 1 CTAAGGGTTACGTAATAACTGT
Pdp1.pwm 9943 + 18 39 2.94e-05 1 CATCTAATTATGTAAATATGTC
Pdp1.pwm 4285 + 5 26 3.12e-05 1 CCGGGTGTTATATATTTGGCAA
Pdp1.pwm 5978 + 18 39 3.12e-05 1 AGCAATATTATGTAAGATAGTC
Pdp1.pwm 28203 6 27 3.12e-05 1 ACGCTGATTGTATAACATGAGC
Pdp1.pwm 5261 + 15 36 3.3e-05 1 TCCCAGGTTACATAAGCACATC
Pdp1.pwm 24953 20 41 3.3e-05 1 CAGACGATTATGTAAGAATCGG
Pdp1.pwm 40846 3 24 3.3e-05 1 CCAGTAGTTATGTAAACATGTA
Pdp1.pwm 12216 3 24 3.48e-05 1 AATCGACTTATATAATGTCGGG
Pdp1.pwm 4733 8 29 3.68e-05 1 GCAACAATTATGTAACTCCTTT
Pdp1.pwm 11818 4 25 3.68e-05 1 GATACCCTTACGTAACTTAGCC
Pdp1.pwm 26452 + 3 24 3.68e-05 1 TGGACAATTATATAACGATGAT
Pdp1.pwm 40534 + 14 35 3.88e-05 1 GCGGCGATTATGTAACCGCGAT
Pdp1.pwm 14371 20 41 4.09e-05 1 CAGACACTTACACAACTATGAC
Pdp1.pwm 17796 + 14 35 4.09e-05 1 TCGTTATTTATATAATTATATC
Pdp1.pwm 28976 9 30 4.09e-05 1 CACAGAGTTGTATAATCTGTTT
Pdp1.pwm 37208 16 37 4.09e-05 1 CAGCCGGTTATACAACACTCAG
Pdp1.pwm 5263 + 4 25 4.31e-05 1 AGTGAGCTTATATAATGGCGAA
Pdp1.pwm 23697 18 39 4.54e-05 1 GACATGATTACATAAGTTTAGG
Pdp1.pwm 37777 + 7 28 4.54e-05 1 AATGCGGTTGCATAACGCTTAC
Pdp1.pwm 12013 + 7 28 4.78e-05 1 CTTACAGTTGCGTAACCTCTAC
Pdp1.pwm 1454 8 29 5.03e-05 1 AGGACCGTTATGTAAGTTGTAT
Pdp1.pwm 3324 11 32 5.29e-05 1 CTAAATCTTATACAACCACGTA
Pdp1.pwm 9345 1 22 5.29e-05 1 ATATTTGTTATACAATGGGATC
Pdp1.pwm 9943 18 39 5.29e-05 1 GACATATTTACATAATTAGATG
Pdp1.pwm 14370 15 36 5.29e-05 1 CTCTACCTTATATAACAAATCC
Pdp1.pwm 22040 13 34 5.29e-05 1 TGGGTCATTATGTAATCGAGAA
Pdp1.pwm 32378 22 43 5.29e-05 1 CACAGACTTGTATAACGCCCTG
Pdp1.pwm 39771 22 43 5.29e-05 1 CACAGACTTGTGTAACGTCTTC
Pdp1.pwm 1366 + 12 33 5.56e-05 1 TCACTCGTTATGTAAGCCGGAG
Pdp1.pwm 2576 14 35 5.56e-05 1 AGGGTGGTTACGTAAGCTATTG
Pdp1.pwm 27436 + 16 37 5.56e-05 1 TCACGGGTTATATAAGGAAGTG
Pdp1.pwm 3306 + 21 42 5.84e-05 1 GAACGTATTATATAATGTCTGT
Pdp1.pwm 5455 12 33 5.84e-05 1 AGGATTGTGATATAACTAAGGT
Pdp1.pwm 13041 + 6 27 5.84e-05 1 CCAATGCTTGTGTAACATTGGA
Pdp1.pwm 38373 3 24 5.84e-05 1 GTCCAAGTTACGTAACGGGCGT
Pdp1.pwm 4938 10 31 6.13e-05 1 CCGGGTGTTGCGTAAGTGCCCC
Pdp1.pwm 32378 + 22 43 6.13e-05 1 CAGGGCGTTATACAAGTCTGTG
Pdp1.pwm 37638 21 42 6.13e-05 1 ACAGACGTTGTATAACTATGAA
Pdp1.pwm 1592 + 10 31 6.43e-05 1 CCAATCGTGACATAATTTTTGC
Pdp1.pwm 20439 + 11 32 6.43e-05 1 CAGCATATTACATAAATCATGA
Pdp1.pwm 27772 19 40 6.43e-05 1 AGACGCATTACATAATGCATAA
Pdp1.pwm 37240 + 10 31 6.43e-05 1 AGAATAATTACATAAGAGTGAA
Pdp1.pwm 6403 16 37 6.74e-05 1 CGAGGGATTGCGTAACTAGCGC
Pdp1.pwm 22325 + 13 34 6.74e-05 1 GTTATCGTTACATAAAGTGCCC
Pdp1.pwm 35423 11 32 6.74e-05 1 CAGTTCGTTACACAACGCCCTT
Pdp1.pwm 20299 + 18 39 7.07e-05 1 CAGTATCTTGTATAATAGGGTC
Pdp1.pwm 36126 + 7 28 7.07e-05 1 TAAAACTTTATGTAACTCGCCC
Pdp1.pwm 37240 10 31 7.07e-05 1 TTCACTCTTATGTAATTATTCT
Pdp1.pwm 40846 + 3 24 7.07e-05 1 TACATGTTTACATAACTACTGG
Pdp1.pwm 17796 14 35 7.41e-05 1 GATATAATTATATAAATAACGA
Pdp1.pwm 35062 + 22 43 7.41e-05 1 ACCTGTTTTATGTAAGTCTGTG
Pdp1.pwm 35423 + 11 32 7.41e-05 1 AAGGGCGTTGTGTAACGAACTG
Pdp1.pwm 19530 + 3 24 7.77e-05 1 ATCCTTATGACATAACTTTTGC
Pdp1.pwm 3153 + 10 31 8.14e-05 1 ATGAGTGTTATGCAAGAAGGTT
Pdp1.pwm 3820 + 11 32 8.14e-05 1 GACCCAATTACGTAATCGTCCA
Pdp1.pwm 5400 + 9 30 8.14e-05 1 CCCCCGGTTACGTATCACGGGC
Pdp1.pwm 8895 + 11 32 8.14e-05 1 CTTGATGTTATATCATTTAATT
Pdp1.pwm 35312 22 43 8.14e-05 1 CACAGACTTACGCAACGTCTTA
Pdp1.pwm 41589 1 22 8.14e-05 1 ACACTCGTTACATCACCATGTA
Pdp1.pwm 5880 15 36 8.52e-05 1 CACGATGTTGCATAATTTATAG
Pdp1.pwm 26578 13 34 8.52e-05 1 CGGCTTGTTATATCATCTATTG
Pdp1.pwm 31581 14 35 8.52e-05 1 ACTAGGCATACGTAACCAGCTC
Pdp1.pwm 34006 + 14 35 8.52e-05 1 GCCATTATTACATCACGCACCC
Pdp1.pwm 40087 + 7 28 8.52e-05 1 ACGGTTATTATGCAATTAGTCG
Pdp1.pwm 410 20 41 8.92e-05 1 CAGACTGATATATAACTGATAT
Pdp1.pwm 5705 8 29 8.92e-05 1 CCGAAAGTTGTGTAAGCGTCGA
Pdp1.pwm 12769 + 4 25 8.92e-05 1 AATACGTTTATATAAGCGCTGC
Pdp1.pwm 22417 7 28 8.92e-05 1 AGGGCTTTTATATAATCAAAAT
Pdp1.pwm 23558 + 4 25 8.92e-05 1 TTAAATGTTACGCAACGGGGTA
Pdp1.pwm 28169 + 8 29 8.92e-05 1 GGGCTGTTTATGTAATAGCATC
Pdp1.pwm 28169 8 29 8.92e-05 1 GATGCTATTACATAAACAGCCC
Pdp1.pwm 34232 + 12 33 8.92e-05 1 CGCAGGAATATATAACACTGGA
Pdp1.pwm 2749 20 41 9.34e-05 1 CAGACGATTATGCAACGCAGCG
Pdp1.pwm 7490 15 36 9.34e-05 1 ACCAAAATTATACAATCCTGCA
Pdp1.pwm 12038 + 14 35 9.34e-05 1 GCAACTCTTATATAAATTAATA
Pdp1.pwm 14370 + 15 36 9.34e-05 1 GGATTTGTTATATAAGGTAGAG
Pdp1.pwm 15102 + 14 35 9.34e-05 1 AACCTCATTACGCAACTAAAAC
Pdp1.pwm 28203 + 6 27 9.34e-05 1 GCTCATGTTATACAATCAGCGT
Pdp1.pwm 5797 1 22 9.77e-05 1 GTAGATTTTATATAACATACCC
Pdp1.pwm 9036 + 2 23 9.77e-05 1 CTGGGTTTTACATAAGGCACCG
Pdp1.pwm 26883 + 7 28 9.77e-05 1 CATGCGGTTACGCAAGTTTAAA
Pdp1.pwm 3153 10 31 0.000102 1 AACCTTCTTGCATAACACTCAT
Pdp1.pwm 3791 13 34 0.000102 1 CTTTTTATTGTGTAAGGCGTAC
Pdp1.pwm 13945 6 27 0.000102 1 CGTGGCATTATACAACTGGTGT
Pdp1.pwm 22040 + 13 34 0.000102 1 TTCTCGATTACATAATGACCCA
Pdp1.pwm 29360 7 28 0.000102 1 ACACAACTTATGTAAGGGAATC
Pdp1.pwm 34997 + 18 39 0.000102 1 ACCGGAAATATGTAACTTCGTC
Pdp1.pwm 2163 + 5 26 0.000107 1 CCCCGTGTTACACAAATGGCGA
Pdp1.pwm 2576 + 14 35 0.000107 1 CAATAGCTTACGTAACCACCCT
Pdp1.pwm 4471 11 32 0.000107 1 CCGAGGGTGGTATAACCCCAAA
Pdp1.pwm 21965 + 8 29 0.000107 1 CGTAAGATTACGCAATATTCGC
Pdp1.pwm 22325 13 34 0.000107 1 GGGCACTTTATGTAACGATAAC
Pdp1.pwm 28976 + 9 30 0.000107 1 AAACAGATTATACAACTCTGTG
Pdp1.pwm 29281 + 15 36 0.000107 1 GTAAATGTTGCATAAGTAGCTC
Pdp1.pwm 32872 15 36 0.000107 1 CCAAGGCTTATATCATAGGAAA
Pdp1.pwm 5614 20 41 0.000112 1 CAGACCCTTATGCAATGAGGTG
Pdp1.pwm 9730 + 14 35 0.000112 1 GGTGGTCTTATACAACAAGTCC
Pdp1.pwm 17817 + 12 33 0.000112 1 CTGATTATTATATATGAGGAGC
Pdp1.pwm 25988 + 13 34 0.000112 1 CCCCCTTTTACACAACATGAGA
Pdp1.pwm 32761 + 12 33 0.000112 1 CTTGCATTTATGTAAGGATTGC
Pdp1.pwm 41818 20 41 0.000112 1 CAGACTGTGACGTAACATATGT
Pdp1.pwm 2109 16 37 0.000117 1 CTCCGCATGATATAATGAACTC
Pdp1.pwm 9891 + 12 33 0.000117 1 CCTAAAATGACATAATAAAGAC
Pdp1.pwm 11818 + 4 25 0.000117 1 GGCTAAGTTACGTAAGGGTATC
Pdp1.pwm 28866 + 17 38 0.000117 1 CATCGTCTTATATCACGTAGGT
Pdp1.pwm 36787 + 14 35 0.000117 1 ACAATGCTTATACAAGCCTCGC
Pdp1.pwm 39679 + 18 39 0.000117 1 CCTTGGTTTACGCAACCTTGTC
Pdp1.pwm 27322 1 22 0.000122 1 ACACGGCTGATATAACGCGCCC
Pdp1.pwm 32923 11 32 0.000122 1 TTCGTACTTACGTAATCACTGG
Pdp1.pwm 36126 7 28 0.000122 1 GGGCGAGTTACATAAAGTTTTA
Pdp1.pwm 1454 + 8 29 0.000128 1 ATACAACTTACATAACGGTCCT
Pdp1.pwm 2426 + 20 41 0.000128 1 TGTAGTCTGATATAACTGTCTG
Pdp1.pwm 2426 20 41 0.000128 1 CAGACAGTTATATCAGACTACA
Pdp1.pwm 4642 + 18 39 0.000128 1 ACTTTGCTTACATATCCCTGTC
Pdp1.pwm 5877 + 20 41 0.000128 1 GTGAAGGTTATGTAAAGGTCTG
Pdp1.pwm 10784 10 31 0.000128 1 ACTACTATTGCACAACTTCCTC
Pdp1.pwm 16518 7 28 0.000128 1 CCTCTCGATATGTAATAGTTAC
Pdp1.pwm 17507 8 29 0.000128 1 ATCAGCATTATATCACATAAGA
Pdp1.pwm 22178 17 38 0.000128 1 ACTCTCCTTGTATAATAGAAAC
Pdp1.pwm 25565 3 24 0.000128 1 TAGGAAGTTATGCAATTCACAA
Pdp1.pwm 29160 2 23 0.000128 1 GACAAGCTTGTGTAATCCGCTA
Pdp1.pwm 32689 + 5 26 0.000128 1 TATATTTTTGTGTAATGGGCTC
Pdp1.pwm 5978 18 39 0.000133 1 GACTATCTTACATAATATTGCT
Pdp1.pwm 26161 + 17 38 0.000133 1 TTGCGACTTATATAAGAATCGT
Pdp1.pwm 34232 12 33 0.000133 1 TCCAGTGTTATATATTCCTGCG
Pdp1.pwm 34735 22 43 0.000133 1 CACAGACTTATGTCACTGCAAG
Pdp1.pwm 35062 22 43 0.000133 1 CACAGACTTACATAAAACAGGT
Pdp1.pwm 37638 + 21 42 0.000133 1 TTCATAGTTATACAACGTCTGT
Pdp1.pwm 41806 + 12 33 0.000133 1 ATTCTGCTTGCATAATTCTCTT
Pdp1.pwm 5705 + 8 29 0.000139 1 TCGACGCTTACACAACTTTCGG
Pdp1.pwm 9530 + 20 41 0.000139 1 TTTCCTCTTACGTAAGAGTCTG
Pdp1.pwm 17110 + 21 42 0.000139 1 CTCTTTATTACACAACGTCTGT
Pdp1.pwm 23197 6 27 0.000139 1 CCGGAGTTTGTATAATTCCGGA
Pdp1.pwm 25565 + 3 24 0.000139 1 TTGTGAATTGCATAACTTCCTA
Pdp1.pwm 33110 + 5 26 0.000139 1 CTGGGTGTGATGTAAGTCTCCT
Pdp1.pwm 38871 + 2 23 0.000139 1 GGGCTGGTGACATAATCGGATA
Pdp1.pwm 39549 16 37 0.000139 1 CAGTCGATTACATATCGCCCTC
Pdp1.pwm 322 + 18 39 0.000145 1 CTTTCTAATATGTAATAAGGTC
Pdp1.pwm 2345 + 22 43 0.000145 1 ACCTGTGTGACATAAGTCTGTG
Pdp1.pwm 2749 + 20 41 0.000145 1 CGCTGCGTTGCATAATCGTCTG
Pdp1.pwm 5797 + 1 22 0.000145 1 GGGTATGTTATATAAAATCTAC
Pdp1.pwm 9976 22 43 0.000145 1 CACAGACTGATGTAAGATGGTC
Pdp1.pwm 19793 10 31 0.000145 1 GATACGATGATGTAATTTGAAA
Pdp1.pwm 27367 + 22 43 0.000145 1 CCTCATGATATGTAAGTCTGTG
Pdp1.pwm 35076 + 4 25 0.000145 1 CGCCGCTTTATATAAAGCGGAC
Pdp1.pwm 1712 + 15 36 0.000152 1 AAGAGCTTTACGTAAGCTGCCG
Pdp1.pwm 2900 3 24 0.000152 1 CTGGAGAATATGTAATTCGCGA
Pdp1.pwm 10742 15 36 0.000152 1 CGGATCATTAGATAACTGGGGC
Pdp1.pwm 17890 + 15 36 0.000152 1 TCTTATTTTACGTAATTCAGAG
Pdp1.pwm 25917 4 25 0.000152 1 CTTTCGCTTGCATAATGGGATA
Pdp1.pwm 29281 15 36 0.000152 1 GAGCTACTTATGCAACATTTAC
Pdp1.pwm 41589 + 1 22 0.000152 1 TACATGGTGATGTAACGAGTGT
Pdp1.pwm 5794 5 26 0.000158 1 CCAATTGTTATGCATCTCCTTC
Pdp1.pwm 6332 + 3 24 0.000158 1 CGCCTGGTTATGTCACTGCCCT
Pdp1.pwm 11262 + 11 32 0.000158 1 TCTAGCCTTATGCAACTGATCC
Pdp1.pwm 20088 20 41 0.000158 1 CAGACGTTGATGTAACACCGAC
Pdp1.pwm 22714 2 23 0.000158 1 CCCTTCGTTATGTATCGCAGCA
Pdp1.pwm 31686 15 36 0.000158 1 CTCCCTGTTATGTCAGCGCCGC
Pdp1.pwm 39994 16 37 0.000158 1 CATCGTGTCACATAATGAGGGC
Pdp1.pwm 8077 20 41 0.000165 1 CAGACCCATATGTAACTAACAA
Pdp1.pwm 8521 + 20 41 0.000165 1 AGAGTACTTGTATAACTGTCTG
Pdp1.pwm 11112 5 26 0.000165 1 CTAAAGATTATGTATCCGCATC
Pdp1.pwm 34289 + 13 34 0.000165 1 GCTGGCCTGATGTAACATCATC
Pdp1.pwm 34309 15 36 0.000165 1 CCAAATATTACGTCAGACGTTC
Pdp1.pwm 36100 + 13 34 0.000165 1 CGACACGTTACATCACTTGTGA
Pdp1.pwm 37777 7 28 0.000165 1 GTAAGCGTTATGCAACCGCATT
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Pdp1.pwm 963 7 28 0.000172 1 CATATATTGATATAATTCGGAT
Pdp1.pwm 2345 22 43 0.000172 1 CACAGACTTATGTCACACAGGT
Pdp1.pwm 2359 + 2 23 0.000172 1 CACACTTTTACACAATCGGGTT
Pdp1.pwm 7850 15 36 0.000172 1 CCGGACGTGGCATAACTCTATC
Pdp1.pwm 8521 20 41 0.000172 1 CAGACAGTTATACAAGTACTCT
Pdp1.pwm 12123 16 37 0.000172 1 CGTGGGGTTACACAAATTGGCC
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Pdp1.pwm 34735 + 22 43 0.000172 1 CTTGCAGTGACATAAGTCTGTG
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Pdp1.pwm 27271 + 9 30 0.000317 1 ATGTACATTACGTAAAATGTGA
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Pdp1.pwm 37234 + 12 33 0.00033 1 TGAGCCCTTATGTAAAACGATA
Pdp1.pwm 37951 + 1 22 0.00033 1 CATTGTCTTACAAAACAATCAC
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Pdp1.pwm 6354 2 23 0.000526 1 CTCTCGGTGACATCACTCCATA
Pdp1.pwm 8654 1 22 0.000526 1 AACTGTCCTATATAACCGCCAC
Pdp1.pwm 9885 22 43 0.000526 1 CACAGACTGACATAAAAGCCTA
Pdp1.pwm 10266 + 10 31 0.000526 1 AATGTTGATACACAACTCAGCT
Pdp1.pwm 11055 + 11 32 0.000526 1 AATCGGATTACTTAACAACATA
Pdp1.pwm 11514 19 40 0.000526 1 AGACTGTTGACATAACTGCTAC
Pdp1.pwm 14111 14 35 0.000526 1 CATAAGCTTATGTCAGATTGCT
Pdp1.pwm 15224 + 21 42 0.000526 1 TCGTTAGTGACGTAATGTCTGT
Pdp1.pwm 18875 20 41 0.000526 1 CAGACTTTGATACAACAGGGCC
Pdp1.pwm 23412 + 22 43 0.000526 1 TGGGCACTTGCATAAGTCTGTG
Pdp1.pwm 24394 6 27 0.000526 1 TTTATTCCTACGTAACGCCAAC
Pdp1.pwm 25122 + 4 25 0.000526 1 AAGCTAGTTATGTGATGATTGA
Pdp1.pwm 25988 13 34 0.000526 1 TCTCATGTTGTGTAAAAGGGGG
Pdp1.pwm 28108 + 13 34 0.000526 1 CTGTACATTGCACAATCCGAGC
Pdp1.pwm 29255 + 8 29 0.000526 1 GAGTGGATGACATAAGGGGCCC
Pdp1.pwm 29602 4 25 0.000526 1 CAGCCTTTTATGTATCATTTAT
Pdp1.pwm 30157 1 22 0.000526 1 CGGCGACTGACATAATGGCACT
Pdp1.pwm 31153 + 8 29 0.000526 1 GCCGTAGTCACATAACTCGTGT
Pdp1.pwm 31929 + 4 25 0.000526 1 GCTATCTTTATATATCTAACAT
Pdp1.pwm 33534 + 22 43 0.000526 1 TATAGTGTTACATAGGTCTGTG
Pdp1.pwm 34961 + 9 30 0.000526 1 CCAGCGATTTTATAACCAGAAT
Pdp1.pwm 35076 4 25 0.000526 1 GTCCGCTTTATATAAAGCGGCG
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Pdp1.pwm 15359 + 15 36 0.000547 1 ACCGCTATTACCTAATACACCA
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Pdp1.pwm 26490 22 43 0.000547 1 CACAGACTGACATCATATGGTC
Pdp1.pwm 26720 16 37 0.000547 1 CTCCTCCTTATATCAGCACTGG
Pdp1.pwm 27006 + 7 28 0.000547 1 CACCGCCTTATGTAGTTGTGTC
Pdp1.pwm 27066 4 25 0.000547 1 AAGGTTGTTATGTCTCAATATG
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Pdp1.pwm 39250 16 37 0.000547 1 CATACTATTAAGTAAGTAACTA
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Pdp1.pwm 2148 22 43 0.000568 1 CACAGACTTACCTAATAGTTCC
Pdp1.pwm 2761 18 39 0.000568 1 GACCTTCATATGTAAGACGTCC
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Pdp1.pwm 8641 21 42 0.000568 1 ACAGACGTGATATCACCCTAAC
Pdp1.pwm 10259 + 8 29 0.000568 1 GCACTCGTTGTACAACATGCAT
Pdp1.pwm 10878 10 31 0.000568 1 CTGATAATTTCGTAATAAACAA
Pdp1.pwm 10918 + 3 24 0.000568 1 CCCGACCTGACGTAAGGCCATG
Pdp1.pwm 13669 + 3 24 0.000568 1 GACCCACTGATATAATAGACCC
Pdp1.pwm 13683 3 24 0.000568 1 CCTCGCAATATGTCACTTAGTC
Pdp1.pwm 15213 17 38 0.000568 1 ACACCCGTGGTGTAACAGTCTC
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Pdp1.pwm 15887 + 13 34 0.000568 1 CTGATTCTAATATAATTGGATT
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Pdp1.pwm 19969 + 4 25 0.000568 1 CCGCGGATTATATGAGGGCGAC
Pdp1.pwm 20088 + 20 41 0.000568 1 GTCGGTGTTACATCAACGTCTG
Pdp1.pwm 21294 + 8 29 0.000568 1 CGTTGATTGACATAACCAAATT
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Pdp1.pwm 22230 15 36 0.000568 1 GTCACGGTTAAGTAACTGTCAA
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Pdp1.pwm 32843 + 20 41 0.000568 1 TCCAACCATACATAATTGTCTG
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Pdp1.pwm 3488 18 39 0.00059 1 GACTTGATTATACAAAGACAAC
Pdp1.pwm 4368 2 23 0.00059 1 ATCGCTATTATGTGACATAAAA
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Pdp1.pwm 5678 + 5 26 0.00059 1 TCTCAGGGTACGTAACACGGTA
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Pdp1.pwm 9937 7 28 0.00059 1 CGTACGGTTACACCATGTTGGG
Pdp1.pwm 11233 + 7 28 0.00059 1 TGAACCATTGCGTAATTGAACA
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Pdp1.pwm 11487 + 14 35 0.00059 1 CCAAGGGTAATGTAATGTTTGC
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Pdp1.pwm 14445 + 3 24 0.00059 1 GCAGATGTCATGTAACTACCCA
Pdp1.pwm 19365 9 30 0.00059 1 TCTATAGTTGCATATCTTCCTT
Pdp1.pwm 22222 + 14 35 0.00059 1 CTTATTGATAGATAACTCGCTT
Pdp1.pwm 28947 + 11 32 0.00059 1 AATTGTATTACGCCACAGGCGA
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Pdp1.pwm 39345 + 15 36 0.00059 1 TATAGTATAATGTAACAGGATA
Pdp1.pwm 1296 13 34 0.000613 1 GAGTGGGTTATACCAGCCGCTC
Pdp1.pwm 2317 22 43 0.000613 1 CACAGACGTACATAATGTGACC
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Pdp1.pwm 6496 + 19 40 0.000613 1 GTCCCGCTTATGCAATACGTCT
Pdp1.pwm 7850 + 15 36 0.000613 1 GATAGAGTTATGCCACGTCCGG
Pdp1.pwm 11503 6 27 0.000613 1 AGACTTTATACATAATGGGGGC
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Pdp1.pwm 13213 14 35 0.000613 1 GCGGGTCTGGCGTAACTTTGTG
Pdp1.pwm 16258 + 19 40 0.000613 1 TTTACAGATACGTAATGCGTCT
Pdp1.pwm 17289 + 18 39 0.000613 1 CATTGAGTAACGTAACGTCGTC
Pdp1.pwm 21909 + 13 34 0.000613 1 TCTTATATTATATACCTCTGGA
Pdp1.pwm 23732 + 18 39 0.000613 1 GTTACCGTTTTGTAATATCGTC
Pdp1.pwm 23732 18 39 0.000613 1 GACGATATTACAAAACGGTAAC
Pdp1.pwm 26666 + 5 26 0.000613 1 ATGCAGGTTATATCTCTTTCAC
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Pdp1.pwm 27163 + 9 30 0.000613 1 CCTCGGGTTGTGCAAGGACTTT
Pdp1.pwm 31929 4 25 0.000613 1 ATGTTAGATATATAAAGATAGC
Pdp1.pwm 32622 1 22 0.000613 1 CACAACTTTGCGTAAGCAGAAG
Pdp1.pwm 33889 8 29 0.000613 1 TATCACTTGACGTAACGCTGTA
Pdp1.pwm 35196 + 18 39 0.000613 1 GAATTTATTATGTAGCTACGTC
Pdp1.pwm 35414 2 23 0.000613 1 ATTACAGTTACATACCAAACCC
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Pdp1.pwm 40911 8 29 0.000613 1 CATCGTGTTGTAAAATTTACAC
Pdp1.pwm 963 + 7 28 0.000637 1 ATCCGAATTATATCAATATATG
Pdp1.pwm 2761 + 18 39 0.000637 1 GGACGTCTTACATATGAAGGTC
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Pdp1.pwm 4170 + 4 25 0.000637 1 CATACGTTTGTGCAACAACAGA
Pdp1.pwm 4737 + 10 31 0.000637 1 ATTCGGGTAACATAACCCTATG
Pdp1.pwm 4934 + 13 34 0.000637 1 CACGTTCTTACGTTACTCAGAA
Pdp1.pwm 7516 16 37 0.000637 1 CATAAACTTATATTACCTGGAA
Pdp1.pwm 8786 + 17 38 0.000637 1 CCTCTGATTATGCATCTACGGT
Pdp1.pwm 8808 + 7 28 0.000637 1 CTGCACCTTATACAAAGGAAAC
Pdp1.pwm 11408 + 9 30 0.000637 1 CGACCGTTTACGTAAAGACATG
Pdp1.pwm 11715 + 13 34 0.000637 1 CAGCCTGTTGCATATTGCAGTT
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Pdp1.pwm 11804 13 34 0.000637 1 TCAATAGTTAGATAAGTACGCC
Pdp1.pwm 11971 + 13 34 0.000637 1 AACCTCCTGATACAACGATAAA
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Pdp1.pwm 12354 14 35 0.000637 1 GCGTTAATTACGAAACTCCCTA
Pdp1.pwm 14277 + 3 24 0.000637 1 ATTACGGTTAGGTAAGTTCTGA
Pdp1.pwm 14444 + 10 31 0.000637 1 ATATAAATTGTATAAGCCCCTT
Pdp1.pwm 14962 20 41 0.000637 1 CAGACAGTTTTATAAGCGGCAT
Pdp1.pwm 15213 + 17 38 0.000637 1 GAGACTGTTACACCACGGGTGT
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Pdp1.pwm 32126 + 19 40 0.000637 1 CGGCCTTTTGTATAAGTGGTCT
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Pdp1.pwm 40869 + 12 33 0.000637 1 GCAACTATGACGTAAAGTTATC
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Pdp1.pwm 1446 14 35 0.000661 1 ATCGGTCTTATGTCAAGAGTGA
Pdp1.pwm 2333 + 18 39 0.000661 1 TCGGGCGTTACATGAGATGGTC
Pdp1.pwm 2346 + 3 24 0.000661 1 ACTGTTGTTGTATGATTGGGGA
Pdp1.pwm 3766 22 43 0.000661 1 CACAGACGTATGTAATGTTTTA
Pdp1.pwm 3791 + 13 34 0.000661 1 GTACGCCTTACACAATAAAAAG
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Pdp1.pwm 17505 9 30 0.000661 1 CGACGAGTTGCATCACTCGACT
Pdp1.pwm 17796 22 43 0.000661 1 CACAGACAGATATAATTATATA
Pdp1.pwm 20286 5 26 0.000661 1 CCTCCATATACATAAGACTATA
Pdp1.pwm 20584 13 34 0.000661 1 CCCTCAGTTCTGTAACCCTAAA
Pdp1.pwm 21909 13 34 0.000661 1 TCCAGAGGTATATAATATAAGA
Pdp1.pwm 22276 22 43 0.000661 1 CACAGACCTACGTAACTATTTT
Pdp1.pwm 22714 + 2 23 0.000661 1 TGCTGCGATACATAACGAAGGG
Pdp1.pwm 23908 + 9 30 0.000661 1 ATCGCCGTGATACAATTATGTG
Pdp1.pwm 24539 + 12 33 0.000661 1 AGGATAAGTACGTAACCTAAAC
Pdp1.pwm 27200 + 18 39 0.000661 1 CGGGATAATACGTCACTGGGTC
Pdp1.pwm 28145 2 23 0.000661 1 CCGGGGGTTTTGCAATATGGTC
Pdp1.pwm 31264 18 39 0.000661 1 GACCCTCTTACATAGCTGGCGC
Pdp1.pwm 33590 3 24 0.000661 1 GGTGTGGATGTATAACCTCCGA
Pdp1.pwm 34309 + 15 36 0.000661 1 GAACGTCTGACGTAATATTTGG
Pdp1.pwm 34620 + 16 37 0.000661 1 TATGCTGTTTTATAATTCTTCG
Pdp1.pwm 37261 + 8 29 0.000661 1 CGCACTGTTATACATGACAGGC
Pdp1.pwm 37464 4 25 0.000661 1 GGGCTAATTACATCAGCGAGAA
Pdp1.pwm 39047 15 36 0.000661 1 CAGCAGATTATACCATTAAATG
Pdp1.pwm 39758 16 37 0.000661 1 CTGAGGCAGATGTAACCCGTAA
Pdp1.pwm 40466 3 24 0.000661 1 ACAATTATTAAATAATTCCTGT
Pdp1.pwm 1127 4 25 0.000686 1 ACTGTCCTTGTGTATCCCTTAC
Pdp1.pwm 3681 1 22 0.000686 1 GCGACTGTTGCGTCACGGACGG
Pdp1.pwm 4770 1 22 0.000686 1 GCGATAACTACGTAATGATAGC
Pdp1.pwm 6350 + 10 31 0.000686 1 GCGAAGGTGATATATCGCATTC
Pdp1.pwm 8342 18 39 0.000686 1 GACCGAATTGCGCAACGATAAA
Pdp1.pwm 9319 8 29 0.000686 1 CTCCAGGTTACATGAGTGTCTA
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Pdp1.pwm 10056 15 36 0.000686 1 AAGGGCATGACACAACTTGCCG
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Pdp1.pwm 38697 11 32 0.00074 1 AAGAAGATGATACAACCTACGT
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Pdp1.pwm 21266 4 25 0.000797 1 CGTATTCATGCGTAACTCTTCG
Pdp1.pwm 24333 15 36 0.000797 1 AGTTTGTTTACACAATGATCCT
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Pdp1.pwm 25144 + 11 32 0.000797 1 TAGAAATTTGCATAATGTCTAG
Pdp1.pwm 26835 13 34 0.000797 1 CGGGCGATTAAATAACCGAGCA

DEBUGGING INFORMATION

Command line:

/home/yang23/programs/meme_4.9.0/bin/fimo -oc /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/sskke6k3ia8m87u6s67rs92oeu8k3qmh33l73vlkf980h9a7vrjra1/shuffled -thresh 0.001 /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/sskke6k3ia8m87u6s67rs92oeu8k3qmh33l73vlkf980h9a7vrjra1/pwm.fimo /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/sskke6k3ia8m87u6s67rs92oeu8k3qmh33l73vlkf980h9a7vrjra1/uniprobes.shuffled.fasta

Settings:

output directory = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/sskke6k3ia8m87u6s67rs92oeu8k3qmh33l73vlkf980h9a7vrjra1/shuffled MEME file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/sskke6k3ia8m87u6s67rs92oeu8k3qmh33l73vlkf980h9a7vrjra1/pwm.fimo sequence file name = /srv/wwwtest/htdocs/TFBSshape/temp/sskke6k3ia8m87u6s67rs92oeu8k3qmh33l73vlkf980h9a7vrjra1/uniprobes.shuffled.fasta
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scan both strands = true max sequence length = 250000000 output threshold = 0.001
threshold type = p-value max stored scores = 100000 pseudocount = 0.1
verbosity = 2

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